共 4797 个数据集

PRJNA1528658:匈牙利北部24株鸡源共生大肠杆菌全基因组测序

PRJNA1528658:匈牙利北部24株鸡源共生大肠杆菌全基因组测序

基因组分类Genome sequencing

该数据集为NCBI BioProject PRJNA1528658,包含2022至2023年从匈牙利北部商业鸡群中分离的24株共生Escherichia coli的全基因组组装序列

浏览7
PRJNA1544026:小鼠颈椎脱臼与三溴乙醇麻醉后性别依赖性肠道微生物组变异

PRJNA1544026:小鼠颈椎脱臼与三溴乙醇麻醉后性别依赖性肠道微生物组变异

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自 NCBI,包含小鼠肠道微生物组的 16S rRNA 基因扩增子测序原始序列数据,靶向 V3-V4 区域。实验涉及三溴乙醇麻醉、颈椎脱臼或两者联合处理,并在处理后立即或间隔 30 分钟采集肠道内容物,同时覆盖雄性与雌性小鼠

浏览1
PRJNA576977:澳大利亚Elizabethkingia临床分离株的比较基因组学与抗菌药物耐药性研究

PRJNA576977:澳大利亚Elizabethkingia临床分离株的比较基因组学与抗菌药物耐药性研究

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自NCBI,对应PRJNA576977项目,聚焦澳大利亚昆士兰16年间收集的22株Elizabethkingia spp.临床分离株

浏览3
PRJNA1358278:加拿大魁北克SARS-CoV-2废水基因组测序

PRJNA1358278:加拿大魁北克SARS-CoV-2废水基因组测序

基因组预测Raw sequence readsCOVID-19

该数据集来自NCBI,为加拿大魁北克地区SARS-CoV-2废水基因组测序的原始序列读段。源站描述指出,废水监测是病原体监测的经济有效方法,研究比较了基于PCR的病毒核酸定量与SARS-CoV-2全基因组测序在预测当地COVID-19阳性病例数方面的表现,并计算病毒基因组中多态性核苷酸位点数量(分离

浏览13
PRJNA1363758:MV1或MV2感染人脑类器官单细胞RNA-seq(感染后120与180天)

PRJNA1363758:MV1或MV2感染人脑类器官单细胞RNA-seq(感染后120与180天)

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI,包含源自人诱导多能干细胞的无定向人脑类器官(HuCOs),在旋转生物反应器中维持并分为MV1感染、MV2感染和未感染对照(NBH)三组,于感染后约120天和180天两个时间点采集,使用10x Genomics Chromium Next GEM Single Cell 3′ R

浏览7
厄瓜多尔儿童血培养耐苯唑西林mecA阳性溶血葡萄球菌全基因组测序分析

厄瓜多尔儿童血培养耐苯唑西林mecA阳性溶血葡萄球菌全基因组测序分析

基因组分类Raw sequence reads

该数据集为厄瓜多尔一名儿童血流感染患者血培养中分离的多重耐药、耐苯唑西林且mecA阳性的溶血葡萄球菌分离株(VET41K)的全基因组测序数据

浏览9
BNL CL.2细胞MCD培养基与CuCl2处理下CRISPR Cas9基因敲除筛选散点图汇总

BNL CL.2细胞MCD培养基与CuCl2处理下CRISPR Cas9基因敲除筛选散点图汇总

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自NCBI,包含在BNL CL.2细胞中进行的全基因组CRISPR Cas9敲除筛选的高通量测序数据。细胞经小鼠GeCKO v2慢病毒sgRNA文库转导,嘌呤霉素筛选后分别在补充CuCl2的MCD培养基或对照培养基中培养两周,提取基因组DNA并扩增sgRNA进行测序

浏览7
野生型C57BL/6J小鼠感染伯氏疟原虫ANKA株后脾脏的单核RNA测序(10x Genomics Flex),作为SpatialBench空间转录组学基准的全转录组参考

野生型C57BL/6J小鼠感染伯氏疟原虫ANKA株后脾脏的单核RNA测序(10x Genomics Flex),作为SpatialBench空间转录组学基准的全转录组参考

基因组分类Other

该数据集提供野生型C57BL/6J小鼠脾脏的单核RNA测序(snRNA-seq)图谱,样本来自静脉感染Plasmodium berghei ANKA后经氯喹和乙胺嘧啶治愈、并制成FFPE块的小鼠脾脏

浏览13
PRJNA1493802:毒力噬菌体vB PmuP Pa7感染多杀性巴氏杆菌的时间分辨链特异性转录组分析

PRJNA1493802:毒力噬菌体vB PmuP Pa7感染多杀性巴氏杆菌的时间分辨链特异性转录组分析

基因组Raw sequence reads

该数据集为多杀性巴氏杆菌S34株感染毒力噬菌体vB PmuP Pa7的时间分辨链特异性转录组分析,包含感染前及感染后20、30、120分钟的RNA测序样本,覆盖裂解周期三个代表性阶段

浏览9
七带石斑鱼NNV感染鳃组织RNA-seq数据集

七带石斑鱼NNV感染鳃组织RNA-seq数据集

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集为七带石斑鱼(Hyporthodus septemfasciatus)幼鱼在神经坏死病毒(NNV)感染后的鳃组织配对末端RNA-seq原始测序数据

浏览5
Houttuynia cordata提取物处理EPC细胞抗SVCV的RNA-seq分析

Houttuynia cordata提取物处理EPC细胞抗SVCV的RNA-seq分析

基因组预测Raw sequence reads

该数据集为针对EPC细胞在SVCV(弹状病毒)感染后24小时、有无Houttuynia cordata提取物处理的转录组测序数据,包含原始序列reads

浏览5
慢性脊髓损伤患者与照护者鼻腔微生物组16S rRNA测序

慢性脊髓损伤患者与照护者鼻腔微生物组16S rRNA测序

基因组分类Raw sequence reads

该数据集包含来自53名慢性脊髓损伤患者和26名照护者的鼻拭子样本的16S rRNA V4区域测序数据,主要目的是比较患者与照护者对照之间的鼻腔微生物组多样性和组成,并检查微生物分类群与临床感染评分之间的关联

浏览3