PRJNA1493802:毒力噬菌体vB PmuP Pa7感染多杀性巴氏杆菌的时间分辨链特异性转录组分析

该数据集为多杀性巴氏杆菌S34株感染毒力噬菌体vB PmuP Pa7的时间分辨链特异性转录组分析,包含感染前及感染后20、30、120分钟的RNA测序样本,覆盖裂解周期三个代表性阶段

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基因组Raw sequence reads
PRJNA1493802: Time-resolved strand-specific transcriptome analysis of Pasteurella multocida infected by virulent phage vB PmuP Pa7

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1493802:毒力噬菌体vB PmuP Pa7感染多杀性巴氏杆菌的时间分辨链特异性转录组分析

该数据集为多杀性巴氏杆菌S34株感染毒力噬菌体vB PmuP Pa7的时间分辨链特异性转录组分析,包含感染前及感染后20、30、120分钟的RNA测序样本,覆盖裂解周期三个代表性阶段。数据可用于研究噬菌体感染过程中宿主基因表达的动态变化,涉及翻译、核糖体功能、膜转运、氨基糖与核苷酸糖代谢、细菌趋化性及能量代谢等通路,为理解噬菌体-宿主互作的分子机制及开发噬菌体防控策略提供资源(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该BioProject呈现了对感染毒力噬菌体vB PmuP Pa7的多杀性巴氏杆菌S34株进行的时间分辨链特异性转录组分析。对感染前及裂解周期三个代表性阶段(感染后20、30和120分钟)采集的样本进行了RNA测序,以研究噬菌体感染期间的宿主转录响应。该数据集捕获了与噬菌体介导的宿主接管相关的细菌基因表达动态变化,包括涉及翻译、核糖体功能、膜转运、氨基糖和核苷酸糖代谢、细菌趋化性及能量代谢的通路。这些数据为研究噬菌体宿主相互作用的分子基础提供了宝贵资源,并有助于开发基于噬菌体的多杀性巴氏杆菌预防和控制策略。

【主题与分类】

主题标签:Raw sequence reads。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1493802

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该BioProject呈现了多杀性巴氏杆菌菌株S34感染强毒力噬菌体vB PmuP Pa7后的时间分辨链特异性转录组分析。对感染前及裂解周期三个代表性阶段(感染后20、30和120分钟)采集的样本进行了RNA测序,以研究噬菌体感染期间的宿主转录反应。该数据集捕获了与噬菌体介导的宿主接管相关的细菌基因表达动态变化,包括涉及翻译、核糖体功能、膜转运、氨基糖和核苷酸糖代谢、细菌趋化性及能量代谢的途径。这些数据为研究噬菌体-宿主相互作用的分子基础提供了宝贵资源,并有助于开发基于噬菌体的策略以预防和控制家畜中的多杀性巴氏杆菌感染。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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