七带石斑鱼NNV感染鳃组织RNA-seq数据集
该数据集为七带石斑鱼（Hyporthodus septemfasciatus）幼鱼在神经坏死病毒（NNV）感染后的鳃组织配对末端RNA-seq原始测序数据
基本信息
资源简介
七带石斑鱼NNV感染鳃组织RNA-seq数据集
该数据集为七带石斑鱼（Hyporthodus septemfasciatus）幼鱼在神经坏死病毒（NNV）感染后的鳃组织配对末端RNA-seq原始测序数据。实验设PBS注射对照组与NNV感染组，感染组腹腔注射100 µL 10^3.8 TCID50的NNV，对照组注射等量PBS，感染后5天采集鳃组织并保存于-80 °C的RNAlater中。数据可用于宿主对NNV感染应答的比较转录组分析（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本研究从神经坏死病毒（NNV）感染后的七带石斑鱼（Hyporthodus septemfasciatus）幼鱼鳃组织中生成了配对末端RNA-seq数据。鱼被分为PBS注射对照组和NNV感染组。感染组通过腹腔注射接受100 µL滴度为10^3.8 TCID50的NNV，而对照组接受100 µL PBS。感染后5天采集鳃组织并保存于-80 °C的RNAlater中。从鳃组织中提取总RNA，并使用TruSeq Stranded Total RNA LT Sample Prep Kit (Gold)进行RNA-seq文库构建。文库在Illumina平台上以配对末端2 × 101 bp配置进行测序。该数据集提供了原始RNA-seq读段，用于七带石斑鱼鳃组织对NNV感染宿主应答的比较转录组分析。
【主题与分类】
主题标签：Transcriptome or Gene expression。本站分类：感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB115743
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
本研究从神经坏死病毒（NNV）感染后的幼年七带石斑鱼（Hyporthodus septemfasciatus）鳃组织中生成了双端RNA-seq数据。鱼被分为注射PBS的对照组和NNV感染组。感染组通过腹腔注射接受100 µL滴度为10^3.8 TCID50的NNV，而对照组接受100 µL PBS。感染后5天采集鳃组织，并保存于-80 °C的RNAlater中。从鳃组织中提取总RNA，并使用TruSeq Stranded Total RNA LT Sample Prep Kit (Gold)进行RNA-seq文库构建。文库在Illumina平台上采用双端2 × 101 bp配置进行测序。该数据集提供了原始RNA-seq reads，用于七带石斑鱼鳃组织对NNV感染宿主反应的比较转录组分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
