BNL CL.2细胞MCD培养基与CuCl2处理下CRISPR Cas9基因敲除筛选散点图汇总

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1492090

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本项目包含在BNL CL.2细胞中进行全基因组CRISPR Cas9敲除筛选所产生的下一代测序数据。以低感染复数用小鼠GeCKO v2慢病毒sgRNA文库转导细胞，以确保单个sgRNA整合。经嘌呤霉素筛选后，将细胞在添加CuCl2的MCD培养基或对照培养基中培养两周。随后提取基因组DNA，扩增sgRNA序列并进行高通量测序。测序数据使用MAGeCK VISPR流程分析，以定量sgRNA丰度，并鉴定与溶剂对照相比在MCD和CuCl2处理下显著富集或耗竭的基因。该数据集为鉴定BNL CL.2细胞在响应MCD和CuCl2诱导应激时适应性和存活的遗传调控因子提供了全基因组资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。