共 4804 个数据集

中国南昌小鼠粪便肠道菌群16S rRNA基因测序

中国南昌小鼠粪便肠道菌群16S rRNA基因测序

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自中国江西省南昌市的实验室小鼠(Mus musculus)粪便颗粒,采集其肠道菌群群落。研究目的是分析该特定队列肠道微生物组的细菌组成与多样性

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PRJNA1467728:Eggerthella lenta 分离与基因组测序

PRJNA1467728:Eggerthella lenta 分离与基因组测序

基因组分类Genome sequencing

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1467728),主题为 Eggerthella lenta 的分离与基因组测序,属于感染领域的其他类数据

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PRJNA1433141:既往病毒学失败个体中耐药HIV-1变异株的广泛多样性与影响

PRJNA1433141:既往病毒学失败个体中耐药HIV-1变异株的广泛多样性与影响

基因组分类Raw sequence reads

该数据集为来自既往一线抗逆转录病毒治疗病毒学失败个体的HIV-1样本原始测序数据。病毒RNA经靶向PCR扩增后测序,用于表征耐药突变及连锁变异单倍型,包含基于Illumina 2x300测序生成的高深度扩增子测序数据

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七带石斑鱼NNV感染鳃组织RNA-seq数据集

七带石斑鱼NNV感染鳃组织RNA-seq数据集

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集为七带石斑鱼(Hyporthodus septemfasciatus)幼鱼在神经坏死病毒(NNV)感染后的鳃组织配对末端RNA-seq原始测序数据

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Houttuynia cordata提取物处理EPC细胞抗SVCV的RNA-seq分析

Houttuynia cordata提取物处理EPC细胞抗SVCV的RNA-seq分析

基因组预测Raw sequence reads

该数据集为针对EPC细胞在SVCV(弹状病毒)感染后24小时、有无Houttuynia cordata提取物处理的转录组测序数据,包含原始序列reads

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PRJNA1542250:非人灵长类C2 AAV文库多转录本类别并行富集与测序

PRJNA1542250:非人灵长类C2 AAV文库多转录本类别并行富集与测序

基因组Raw sequence reads

该数据集来自NCBI BioProject,英文名为PRJNA1542250,主题为对非人灵长类中C2 AAV文库的多个转录本类别进行并行富集与测序,数据主题标签为Raw sequence reads

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PRJNA1002412:共生细菌通过TLR5和AhR信号改善屏障完整性并预防食物过敏反应

PRJNA1002412:共生细菌通过TLR5和AhR信号改善屏障完整性并预防食物过敏反应

时间序列Raw sequence reads

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,包含 Kemter 等 2023 年研究相关的全基因组测序(WGS)与鸟枪法测序数据及其对应的组装结果(如有)

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PRJNA533320:iMEF SDHC缺失稳定株 CUT&RUN

PRJNA533320:iMEF SDHC缺失稳定株 CUT&RUN

基因组分类Epigenomics

数据围绕 SDHC 缺失稳定细胞系展开,采用 CUT&RUN 技术获取染色质相关数据。可用于研究 SDHC 缺失对表观遗传修饰与基因调控的影响,并支撑感染性疾病相关机制探索(来源 NCBI)

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PRJNA533507:iMEF SDHC缺失稳定细胞系eHi-C

PRJNA533507:iMEF SDHC缺失稳定细胞系eHi-C

基因组Other

该数据集来自NCBI,为iMEF SDHC缺失稳定细胞系的eHi-C数据。研究构建了四环素诱导的SV-40大T抗原表达慢病毒永生化小鼠胚胎成纤维细胞(iMEF)培养模型,模拟线粒体电子传递链(ETC)复合体II(琥珀酸脱氢酶;SDH)功能障碍,通过多西环素依赖的cre重组酶表达驱动Sdhc flox

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PRJNA533325:iMEF SDHC缺失稳定细胞系ATAC-seq

PRJNA533325:iMEF SDHC缺失稳定细胞系ATAC-seq

基因组回归Epigenomics

该数据集来自NCBI,包含对四环素诱导型SV-40大T抗原永生化小鼠胚胎成纤维细胞(iMEF)模型进行的ATAC-seq实验

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PRJEB87282:马里儿童感染中的革兰阴性肠杆菌目(2005-2023)

PRJEB87282:马里儿童感染中的革兰阴性肠杆菌目(2005-2023)

基因组Other

该数据集对应 NCBI BioProject 记录 PRJEB87282,主题为马里儿童感染中分离的革兰阴性肠杆菌目,时间跨度为 2005 至 2023 年

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血流感染患者血液样本宏基因组测序用于抗菌药物耐药性预测

血流感染患者血液样本宏基因组测序用于抗菌药物耐药性预测

基因组预测Raw sequence reads

该数据集为 NCBI BioProject 项目 PRJNA1290626,收录血流感染患者血液样本的宏基因组测序数据,主题标签为 Raw sequence reads

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