共 4817 个数据集

厄瓜多尔儿童血培养耐苯唑西林mecA阳性溶血葡萄球菌全基因组测序分析

厄瓜多尔儿童血培养耐苯唑西林mecA阳性溶血葡萄球菌全基因组测序分析

基因组分类Raw sequence reads

该数据集为厄瓜多尔一名儿童血流感染患者血培养中分离的多重耐药、耐苯唑西林且mecA阳性的溶血葡萄球菌分离株(VET41K)的全基因组测序数据

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PRJNA855896:驱动COVID-19心脏毒性的血清学机制

PRJNA855896:驱动COVID-19心脏毒性的血清学机制

基因组回归Transcriptome or Gene expressionCOVID-19

该数据集来自NCBI,研究COVID-19患者血清对多能干细胞来源心肌细胞(PSC-CMs)的影响。实验将PSC-CMs在对照、轻症或重症COVID-19患者血清存在下处理4天,并另用ARDS患者血浆处理以探究COVID-19特异性通路

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BNL CL.2细胞MCD培养基与CuCl2处理下CRISPR Cas9基因敲除筛选散点图汇总

BNL CL.2细胞MCD培养基与CuCl2处理下CRISPR Cas9基因敲除筛选散点图汇总

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自NCBI,包含在BNL CL.2细胞中进行的全基因组CRISPR Cas9敲除筛选的高通量测序数据。细胞经小鼠GeCKO v2慢病毒sgRNA文库转导,嘌呤霉素筛选后分别在补充CuCl2的MCD培养基或对照培养基中培养两周,提取基因组DNA并扩增sgRNA进行测序

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野生型C57BL/6J小鼠感染伯氏疟原虫ANKA株后脾脏的单核RNA测序(10x Genomics Flex),作为SpatialBench空间转录组学基准的全转录组参考

野生型C57BL/6J小鼠感染伯氏疟原虫ANKA株后脾脏的单核RNA测序(10x Genomics Flex),作为SpatialBench空间转录组学基准的全转录组参考

基因组分类Other

该数据集提供野生型C57BL/6J小鼠脾脏的单核RNA测序(snRNA-seq)图谱,样本来自静脉感染Plasmodium berghei ANKA后经氯喹和乙胺嘧啶治愈、并制成FFPE块的小鼠脾脏

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PRJNA1493802:毒力噬菌体vB PmuP Pa7感染多杀性巴氏杆菌的时间分辨链特异性转录组分析

PRJNA1493802:毒力噬菌体vB PmuP Pa7感染多杀性巴氏杆菌的时间分辨链特异性转录组分析

基因组Raw sequence reads

该数据集为多杀性巴氏杆菌S34株感染毒力噬菌体vB PmuP Pa7的时间分辨链特异性转录组分析,包含感染前及感染后20、30、120分钟的RNA测序样本,覆盖裂解周期三个代表性阶段

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七带石斑鱼NNV感染鳃组织RNA-seq数据集

七带石斑鱼NNV感染鳃组织RNA-seq数据集

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集为七带石斑鱼(Hyporthodus septemfasciatus)幼鱼在神经坏死病毒(NNV)感染后的鳃组织配对末端RNA-seq原始测序数据

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Houttuynia cordata提取物处理EPC细胞抗SVCV的RNA-seq分析

Houttuynia cordata提取物处理EPC细胞抗SVCV的RNA-seq分析

基因组预测Raw sequence reads

该数据集为针对EPC细胞在SVCV(弹状病毒)感染后24小时、有无Houttuynia cordata提取物处理的转录组测序数据,包含原始序列reads

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慢性脊髓损伤患者与照护者鼻腔微生物组16S rRNA测序

慢性脊髓损伤患者与照护者鼻腔微生物组16S rRNA测序

基因组分类Raw sequence reads

该数据集包含来自53名慢性脊髓损伤患者和26名照护者的鼻拭子样本的16S rRNA V4区域测序数据,主要目的是比较患者与照护者对照之间的鼻腔微生物组多样性和组成,并检查微生物分类群与临床感染评分之间的关联

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PRJNA1418789:基于扩增子的人类肠道微生物组宏基因组分析

PRJNA1418789:基于扩增子的人类肠道微生物组宏基因组分析

基因组分类Raw sequence reads

该数据集为 NCBI BioProject 收录的 PRJNA1418789 项目,主题为基于扩增子的人类肠道微生物组宏基因组分析,包含原始测序读段(Raw sequence reads)

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PRJNA1440026:中国东北地区蜱病毒组多样性

PRJNA1440026:中国东北地区蜱病毒组多样性

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自 NCBI,聚焦中国东北地区蜱的病毒组多样性。为全面调查该地区蜱携带的病毒多样性并建立蜱传病毒基线数据集,研究进行了广泛的蜱样本采集,并构建了高通量测序文库

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PRJNA1267171:Escherichia coli 基因组测序

PRJNA1267171:Escherichia coli 基因组测序

基因组分类Genome sequencing

源站描述指出,Escherichia coli 是单纯性和复杂性尿路感染(UTIs)的主要致病菌,尿路致病性 E. coli(UPEC)菌株与相关发病和死亡密切相关,而 UPEC 分离株的基因组多样性及多重耐药(MDR)的出现仍知之甚少,无症状 E. coli 分离株的进化动态和致病潜力也尚不明确

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PRJNA1369636:绝经后女性尿液分离大肠杆菌完整基因组序列

PRJNA1369636:绝经后女性尿液分离大肠杆菌完整基因组序列

基因组分类Genome sequencing

该数据集为绝经后女性尿液分离大肠杆菌的完整基因组序列,来源于 NCBI,属于感染性疾病分类。大肠杆菌是单纯性和复杂性尿路感染的主要致病菌,尿路致病性大肠杆菌(UPEC)与相关发病和死亡密切相关,且抗生素耐药问题突出,但 UPEC 基因组多样性及无症状菌株的演化动态和致病潜力仍了解有限

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