PRJNA1267171：Escherichia coli 基因组测序
源站描述指出，Escherichia coli 是单纯性和复杂性尿路感染（UTIs）的主要致病菌，尿路致病性 E. coli（UPEC）菌株与相关发病和死亡密切相关，而 UPEC 分离株的基因组多样性及多重耐药（MDR）的出现仍知之甚少，无症状 E. coli 分离株的进化动态和致病潜力也尚不明确
基本信息
资源简介
PRJNA1267171：Escherichia coli 基因组测序
该数据集为 Escherichia coli 基因组测序数据，来源于 ncbi.nlm.nih.gov，主题标签为 Genome sequencing，本站归类为感染性疾病 / 其他。源站描述指出，Escherichia coli 是单纯性和复杂性尿路感染（UTIs）的主要致病菌，尿路致病性 E. coli（UPEC）菌株与相关发病和死亡密切相关，而 UPEC 分离株的基因组多样性及多重耐药（MDR）的出现仍知之甚少，无症状 E. coli 分离株的进化动态和致病潜力也尚不明确。本研究旨在生成临床尿液 E. coli 分离株的高通量基因组数据集，帮助研究人员识别不同菌株间的遗传变异、发现与 UTI 致病相关的基因并监测相关变化（来源。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：Escherichia coli 是一种革兰氏阴性菌，是单纯性和复杂性尿路感染（UTIs）的主要致病原因。尿路致病性 E. coli（UPEC）菌株是导致 UTI 相关发病和死亡的主要菌株。虽然这些感染的治疗可能对全球抗生素耐药问题产生重大影响，但人们对导致多重耐药（MDR）出现的 UPEC 分离株基因组多样性知之甚少。此外，无症状 E. coli 分离株的进化动态和致病潜力仍鲜为人知。在本研究中，我们旨在生成临床尿液 E. coli 分离株的高通量基因组数据集。该资源将使研究人员能够识别不同 E. coli 菌株之间的遗传变异，发现与 UTI 致病相关的基因，并监测……
【主题与分类】
主题标签：Genome sequencing。本站分类：感染性疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1267171
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1267171
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
大肠埃希菌是一种革兰阴性杆菌，是单纯性和复杂性尿路感染（UTIs）的主要致病菌。尿路致病性大肠埃希菌（UPEC）菌株是导致UTIs相关发病率和死亡率的主要病原体。尽管这些感染的治疗可能对全球抗生素耐药性问题产生重大影响，但人们对导致多重耐药（MDR）出现的UPEC分离株基因组多样性知之甚少。此外，无症状大肠埃希菌分离株的进化动力学和致病潜力仍未被充分了解。在本研究中，我们旨在构建一个临床尿液大肠埃希菌分离株的高通量基因组数据集。该资源将使研究人员能够识别不同大肠埃希菌菌株间的遗传变异，揭示与UTI致病机制相关的基因，并监测抗生素耐药性的出现和传播。这些见解对于推进诊断方法和开发更有效的UTIs治疗策略至关重要。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
