PRJNA1369636：绝经后女性尿液分离大肠杆菌完整基因组序列

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1369636

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

大肠杆菌是一种革兰氏阴性菌，是单纯性和复杂性尿路感染（UTIs）的主要原因。尿路致病性大肠杆菌（UPEC）菌株是导致UTIs相关发病率和死亡率的主要因素。尽管这些感染的治疗可能对全球抗生素耐药性问题产生重大影响，但人们对导致多重耐药（MDR）出现的UPEC分离株的基因组多样性知之甚少。此外，无症状大肠杆菌分离株的进化动力学和致病潜力仍鲜有了解。在本研究中，我们旨在构建一个临床尿液大肠杆菌分离株的高通量基因组数据集。这一资源将使研究人员能够识别不同大肠杆菌菌株间的遗传变异，揭示与UTI致病机制相关的基因，并监测抗生素耐药性的出现和传播。这些见解对于推进诊断方法和开发更有效的UTI治疗策略至关重要。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。