共 4330 个数据集

PRJDB41229:ResMicroDb样本相似性搜索功能示例样本(PRJCA044378)

PRJDB41229:ResMicroDb样本相似性搜索功能示例样本(PRJCA044378)

基因组Other

该数据集为ResMicroDb平台“样本相似性搜索”工具的演示数据,包含来自同一成年个体的四份外部宏基因组样本,覆盖鼻咽和口咽部位,既有健康状态样本,也有SARS-CoV-2感染后样本

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美国HIV阴性Black男男性行为者按需/间歇/事件驱动及长效注射PrEP偏好研究数据

美国HIV阴性Black男男性行为者按需/间歇/事件驱动及长效注射PrEP偏好研究数据

其他Medicine, Health and Life SciencesHIV preventionPrEPHIVlong-acting injectableLAIBlack gay men

该数据集来自一项定性研究,聚焦美国HIV阴性的Black gay、bisexual及其他性少数男性群体,探讨其对按需/间歇/事件驱动及长效注射PrEP的偏好及原因

来源Qualitative Data Repository
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罗氏沼虾肠道饥饿与DIV1感染全长转录组分析

罗氏沼虾肠道饥饿与DIV1感染全长转录组分析

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自NCBI,聚焦罗氏沼虾肠道在饥饿、DIV1感染及对照条件下的全长转录组变化。通过比较不同实验组,数据可用于探究肠道生理反应、宿主应激反应以及与病毒感染相关的分子机制,为淡水虾病毒感染的转录组研究提供资源(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

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PRJNA1474100:Cathepsin C 经 PI3K-AKT 通路限制甲型流感病毒复制

PRJNA1474100:Cathepsin C 经 PI3K-AKT 通路限制甲型流感病毒复制

时间序列回归Raw sequence reads

该数据集来自 NCBI,包含 A549 细胞感染 H1N1 毒株 A/Puerto Rico/8/1934(PR8,MOI=0.1)后的 RNA 测序原始序列读段,比较了 CTSC 过表达、CTSC 敲低及各自对照细胞在感染后 24 小时的转录组谱

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PRJNA1478078:微塑料与蛙病毒共暴露对白氏树蛙肠道微生物组的影响

PRJNA1478078:微塑料与蛙病毒共暴露对白氏树蛙肠道微生物组的影响

基因组分类Raw sequence reads

该数据集为白氏树蛙(Litoria caerulea)肠道微生物群的16S rRNA扩增子测序原始序列数据,涵盖暴露于0、5、20和60 mg/L高密度聚乙烯(HDPE)微塑料并接受或不接受蛙病毒(ranavirus)攻击的样本

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PRJEB126527:复发性外阴阴道念珠菌病的临床严重程度与宿主-微生物组状态相关

PRJEB126527:复发性外阴阴道念珠菌病的临床严重程度与宿主-微生物组状态相关

基因组分类Other

该数据集来自 NCBI,围绕复发性外阴阴道念珠菌病(RVVC)的临床严重程度与宿主-微生物组状态展开。研究纳入 RVVC 患者(n=42)与健康对照(n=38),按真菌培养状态分层,以 0-5 分评估临床严重程度,并对阴道拭子进行宏基因组测序分析分类组成与功能潜力,同时通过活检转录组学与 CD66b

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PRJNA1481667:甲型流感病毒PR8感染人A549细胞的m6A表观转录组芯片数据集

PRJNA1481667:甲型流感病毒PR8感染人A549细胞的m6A表观转录组芯片数据集

基因组分类Other

该数据集来自NCBI,利用甲基化RNA免疫沉淀结合双色杂交的Arraystar Human mRNA&lncRNA Epitranscriptomic Microarray(8x60K),对模拟感染或PR8甲型流感病毒感染24小时(MOI 0.5)的人A549细胞进行m6A表观转录组分析,每种条件设

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产气荚膜梭菌CpfQ株感染噬菌体phiQ后0、10、40、60分钟的RNA-seq转录组

产气荚膜梭菌CpfQ株感染噬菌体phiQ后0、10、40、60分钟的RNA-seq转录组

时间序列预测Raw sequence reads

该数据集为产气荚膜梭菌CpfQ株感染噬菌体phiQ后的全转录组RNA测序原始读段,覆盖感染后0分钟(未感染对照)、10分钟、40分钟和60分钟四个时间点,每个时间点均设生物学重复

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PRJNA1511302:基因型关联高危HPV感染阴道微生物组

PRJNA1511302:基因型关联高危HPV感染阴道微生物组

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自NCBI,包含按HPV状态分层的女性宫颈阴道微生物组图谱,覆盖对照组、HPV16阳性、HPV18阳性、其他高危型HPV阳性及多重hrHPV共感染组

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PRJNA1513192:ALKBH5处理下对照与HIV-1感染MT-2细胞中HTLV-1转录本直接RNA测序

PRJNA1513192:ALKBH5处理下对照与HIV-1感染MT-2细胞中HTLV-1转录本直接RNA测序

时间序列分类Raw sequence reads

该数据集来自NCBI,包含对照MT-2细胞与HIV-1感染MT-2细胞在模拟处理或ALKBH5处理后的Oxford Nanopore直接RNA测序原始序列读段

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西尼罗河病毒感染马丘脑与大脑基因表达分析

西尼罗河病毒感染马丘脑与大脑基因表达分析

基因组分类Expression profiling by arrayGPL137959796

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE30347,分析实验性感染西尼罗河病毒(West Nile Virus)的马丘脑与大脑基因表达

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PRJNA1513702:临床乳腺炎与季节性热应激期间牛乳微生物群的16S rRNA扩增子测序

PRJNA1513702:临床乳腺炎与季节性热应激期间牛乳微生物群的16S rRNA扩增子测序

基因组分类Raw sequence reads

该数据集为来自亚热带气候区牛乳样本的高通量16S rRNA基因扩增子测序(V3-V4高变区)数据,涵盖健康对照与临床乳腺炎、夏季热应激与冬季等条件

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