PRJEB126527：复发性外阴阴道念珠菌病的临床严重程度与宿主-微生物组状态相关

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数据说明

背景：复发性外阴阴道假丝酵母菌病（RVVC；每年≥3次发作）影响5%至9%的女性，造成重大的心理、性和生殖健康负担。尽管其患病率较高，但RVVC如何影响阴道微生物组的组成和功能能力仍不明确。结果：我们分析了RVVC女性（n=42）和健康对照（n=38）的阴道拭子和活检样本，按真菌培养状态分层。临床严重程度根据红肿、分泌物、干燥、皲裂和菌丝进行评分（0-5分）。对拭子进行宏基因组测序以评估分类组成和功能潜力，同时通过活检转录组学和CD66b免疫染色评估宿主反应。正如预期，与培养阴性的健康对照相比，培养阳性的RVVC组中白色念珠菌丰度显著增加（p < 0.0001）。阴道微生物组的α多样性和β多样性，以及15种最优势细菌物种的相对丰度，在这些组之间没有差异。

相比之下，按临床严重程度分层显示出微生物组组成和功能潜力的显著方向性变化（PERMANOVA p = 0.03 和 p < 0.05）。较高的临床评分与白色念珠菌丰度增加（Spearman ρ = 0.60）、卷曲乳杆菌丰度降低（Spearman ρ = −0.30）以及核苷酸和核苷代谢途径丰度增加相关。转录组分析识别出一个独特的培养阳性RVVC样本亚群，其特征为中性粒细胞活化和炎症相关表达增加。这些样本对应于临床评分较高的参与者，并进一步以白色念珠菌和惰性乳杆菌丰度增加、氨基酸生物合成途径耗竭以及阴道黏膜中CD66b阳性中性粒细胞升高为特征。其余培养阳性RVVC样本的转录谱与对照组相当，且c

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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