单细胞RNA序列揭示缺血性中风的转录图景

该数据集通过单细胞RNA测序技术,提供了小鼠缺血性中风模型中不同细胞类型的转录组数据,包括神经元、胶质细胞和免疫细胞等单细胞基因表达信息,主要用于揭示中风后细胞异质性、分子机制及潜在治疗靶点,适用于神经科学和脑血管疾病研究。

干细胞与再生医学数据中心
2023-02-10 更新
浏览 49
单细胞缺血性中风single cellischemic strokeMus musculusBrainOtherTranscriptome
Single-cell RNA Sequencing Reveals the Transcriptional Landscape of Ischemic Stroke

基本信息

许可
licenseAgreement
创建/更新时间
2023-02-10

资源简介

单细胞RNA序列揭示缺血性中风的转录图景

【数据集背景】

源站首次发布:2023-02-10。

【数据内容】

源站原始描述:Here, we employed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to comprehensively map the cell populations in the mouse model of MCAO (middle cerebral artery occlusion)

【主题与分类】

主题标签:单细胞、缺血性中风、single cell、ischemic stroke、Mus musculus、Brain、Other、Transcriptome。

【获取与许可】

源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=2eaf90f9d1de40629d469502b9f730b9

使用许可:licenseAgreement。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,全面绘制了小鼠大脑中动脉闭塞(MCAO)缺血性中风模型中的细胞群体图谱。数据包含来自中风模型的单细胞转录组数据,揭示了不同细胞类型(如神经元、胶质细胞、免疫细胞等)在缺血条件下的基因表达变化。数据来源于实验构建的小鼠MCAO模型,并通过scRNA-seq技术生成。该数据集主要用于研究缺血性中风的分子机制、细胞异质性以及潜在的治疗靶点,适用于神经科学、脑血管疾病和再生医学等领域的研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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