尤文肉瘤患者骨髓单细胞RNA测序数据集

该数据集包含尤文肉瘤患者骨髓的单细胞RNA测序数据,数据模态为基因表达谱,通过单分子测序技术获取,主要用于研究尤文肉瘤的细胞异质性、转录组特征以及探索潜在的诊断和治疗靶点,为肿瘤生物学和精准医疗提供重要数据支持。

Institut CurieInstitut Curie
干细胞与再生医学数据中心
2022-02-20 更新
浏览 33
EWSR1-FLI1Ewing sarcomaIndependent Component Analysisintratumor heterogeneitypatient-derived xenograftssingle-cell RNA-sequencingtime seriestranscriptomics.人Mesenchymal stem cellsMesenchymal stem cell转录组
Single cell RNA-Seq from bone marrow Ewing patients

基本信息

许可
openSource
创建/更新时间
2022-02-20

资源简介

尤文肉瘤患者骨髓单细胞RNA测序数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Single cell RNA-Seq from bone marrow Ewing patients》。源站首次发布:2022-02-20。

【数据内容】

源站原始描述:We report the application of single-molecule-based sequencing technology for high-throughput profiling of bone marrow Ewing patients

【主题与分类】

主题标签:EWSR1-FLI1、Ewing sarcoma、Independent Component Analysis、intratumor heterogeneity、patient-derived xenografts、single-cell RNA-sequencing、time series、transcriptomics.、EWSR1-FLI1、Ewing sarcoma。

【获取与许可】

源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=625c83ebf4659f29c5d37c16397afdd0

使用许可:openSource。

规范引用:PMID: 32049009

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个医学研究数据集,包含尤文肉瘤(Ewing sarcoma)患者的骨髓单细胞RNA测序数据。数据通过单分子测序技术进行高通量分析,旨在研究尤文肉瘤的细胞异质性、基因表达特征以及潜在的生物标志物。数据来源为患者骨髓样本,由法国居里研究所构建并托管于干细胞与再生医学数据中心,主要应用于肿瘤生物学研究、单细胞转录组学分析以及精准医疗相关领域。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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