Isl1基因缺失小鼠垂体祖细胞中Rathke裂样囊肿形成数据集

该数据集包含小鼠垂体特异性Isl1基因敲除模型的实验数据,涵盖基因表达、组织病理图像、细胞谱系及干细胞标记物等多模态数据,主要用于研究ISL1转录因子在垂体正常发育中的作用、Rathke裂样囊肿的发病机制,以及探索FOXA1和FOXJ1作为囊肿诊断标志物的潜在应用。

University of MichiganUniversity of Michigan
干细胞与再生医学数据中心
2022-02-20 更新
浏览 48
小鼠pituitary转录组
Rathke's Cleft-Like Cysts Arise From Isl1 Deletion in Murine Pituitary Progenitors

基本信息

许可
openSource
创建/更新时间
2022-02-20

资源简介

Isl1基因缺失小鼠垂体祖细胞中Rathke裂样囊肿形成数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Rathke’s Cleft-Like Cysts Arise From Isl1 Deletion in Murine Pituitary Progenitors》。源站首次发布:2022-02-20。

【数据内容】

源站原始描述:The transcription factor ISL1 is expressed in pituitary gland stem cells and the thyrotrope and gonadotrope lineages. Pituitary-specific Isl1 deletion causes hypopituitarism with increased stem cell apoptosis, reduced differentiation of thyrotropes and gonadotropes, and reduced body size. Conditional Isl1 deletion causes development of multiple Rathke’s cleft-like cysts, with 100% penetrance. Foxa1 and Foxj1 are abnormally expressed in the pituitary gland and associated with a ciliogenic gene ex…

【主题与分类】

主题标签:小鼠、pituitary、转录组。

【获取与许可】

源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=94f1beb1a214c755922e1b940783766d

使用许可:openSource。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集来源于一项针对ISL1转录因子在小鼠垂体发育中作用的研究。数据集包含垂体特异性Isl1基因敲除小鼠模型的多模态实验数据,涉及基因表达、组织病理学、细胞谱系追踪以及干细胞标记物分析。数据主要通过动物实验、免疫组化、RNA测序及组织学观察构建。研究揭示了ISL1缺失导致垂体功能减退、促甲状腺激素和促性腺激素细胞分化减少,并100%诱发Rathke裂样囊肿形成。该数据集可用于探究垂体发育的分子机制、囊肿疾病的病因学以及ISL1、FOXA1、FOXJ1作为病理诊断标志物的潜在价值,为垂体相关疾病的研究提供重要模型数据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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