Isl1基因缺失小鼠垂体祖细胞中Rathke裂样囊肿形成数据集
该数据集包含小鼠垂体特异性Isl1基因敲除模型的实验数据,涵盖基因表达、组织病理图像、细胞谱系及干细胞标记物等多模态数据,主要用于研究ISL1转录因子在垂体正常发育中的作用、Rathke裂样囊肿的发病机制,以及探索FOXA1和FOXJ1作为囊肿诊断标志物的潜在应用。

基本信息
资源简介
Isl1基因缺失小鼠垂体祖细胞中Rathke裂样囊肿形成数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Rathke’s Cleft-Like Cysts Arise From Isl1 Deletion in Murine Pituitary Progenitors》。源站首次发布:2022-02-20。
【数据内容】
源站原始描述:The transcription factor ISL1 is expressed in pituitary gland stem cells and the thyrotrope and gonadotrope lineages. Pituitary-specific Isl1 deletion causes hypopituitarism with increased stem cell apoptosis, reduced differentiation of thyrotropes and gonadotropes, and reduced body size. Conditional Isl1 deletion causes development of multiple Rathke’s cleft-like cysts, with 100% penetrance. Foxa1 and Foxj1 are abnormally expressed in the pituitary gland and associated with a ciliogenic gene ex…
【主题与分类】
主题标签:小鼠、pituitary、转录组。
【获取与许可】
源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=94f1beb1a214c755922e1b940783766d
使用许可:openSource。
下载信息
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源站:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=94f1beb1a214c755922e1b940783766d
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集来源于一项针对ISL1转录因子在小鼠垂体发育中作用的研究。数据集包含垂体特异性Isl1基因敲除小鼠模型的多模态实验数据,涉及基因表达、组织病理学、细胞谱系追踪以及干细胞标记物分析。数据主要通过动物实验、免疫组化、RNA测序及组织学观察构建。研究揭示了ISL1缺失导致垂体功能减退、促甲状腺激素和促性腺激素细胞分化减少,并100%诱发Rathke裂样囊肿形成。该数据集可用于探究垂体发育的分子机制、囊肿疾病的病因学以及ISL1、FOXA1、FOXJ1作为病理诊断标志物的潜在价值,为垂体相关疾病的研究提供重要模型数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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