HERV-K ENV表达是非典型畸胎样/横纹肌样瘤的治疗靶点

该数据集提供了关于人类内源性逆转录病毒HERV-K在非典型畸胎样/横纹肌样瘤(AT/RT)中表达的多模态实验数据,包括细胞系免疫染色、患者组织蛋白表达检测以及药物干预效果分析,旨在研究HERV-K作为AT/RT治疗靶点的潜力,并为开发针对胚胎性肿瘤的新型疗法提供分子和细胞层面的依据。

NINDS/NIHNINDS/NIH
干细胞与再生医学数据中心
2022-02-20 更新
浏览 65
人Atypical Teratoid Rhabdoid Tumor转录组
HERV-K ENV expression is a therapeutic target in atypical teratoid rhabdoid tumors

基本信息

许可
openSource
创建/更新时间
2022-02-20

资源简介

HERV-K ENV表达是非典型畸胎样/横纹肌样瘤的治疗靶点

【数据集背景】

本数据集源站标题为《HERV-K ENV expression is a therapeutic target in atypical teratoid rhabdoid tumors》。源站首次发布:2022-02-20。

【数据内容】

源站原始描述:Human Endogenous Retroviruses (HERVs) are exogenous viral elements that integrated into the germline millions of years ago. They comprise 8% of the human genome and play a critical role in cellular differentiation during development. HERV-K(HML-2) is the most recently integrated and actively transcribed HERV. It is found to be highly expressed in pluripotent stem cells and strongly downregulated during cellular differentiation. Moreover, expression of HERV-K in terminally differentiated neurons…

【主题与分类】

主题标签:人、Atypical Teratoid Rhabdoid Tumor、转录组。

【获取与许可】

源站页面:http://data.iscr.ac.cn/Article?id=c0d858deb7b4cdf1ae6b1380a5d05ccb

使用许可:openSource。

规范引用:PMID: 34145313

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集聚焦于人类内源性逆转录病毒HERV-K(HML-2)在非典型畸胎样/横纹肌样瘤(AT/RT)中的表达及其治疗潜力。数据集包含对四种AT/RT细胞系的免疫染色分析,检测了干细胞标志物(Oct4、Pax6)、神经元分化标志物(TUBB3、MAP2)以及HERV-K的env、pol和gag转录本;同时,对20例AT/RT患者和5例对照的福尔马林固定脑组织进行了HERV-K ENV蛋白表达的免疫组化染色。研究还评估了强心苷类药物Ouabain对AT/RT细胞的毒性作用,并利用CRISPR/Cas9技术和荧光素酶报告基因实验探讨了HERV-K表达下调对细胞活力及启动子活性的影响。该数据集为探索HERV-K在AT/RT发生发展中的作用及开发针对胚胎性肿瘤的替代或辅助疗法提供了实验数据支持。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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