环形肉芽肿治疗及托法替尼对促炎细胞因子活性的抑制 [RNA-Seq]
该数据集是一个基于单细胞RNA测序（scRNAseq）的基因表达数据集，包含环形肉芽肿（GA）患者皮肤和血浆样本的转录组数据，主要模态为基因表达谱（RNA-Seq），用于研究GA的发病机制中JAK-STAT通路异常及托法替尼（JAK抑制剂）的治疗效果，旨在为炎症性皮肤病提供分子靶向治疗依据。
基本信息
资源简介
该数据集是一个关于环形肉芽肿（GA）的RNA-Seq数据集，旨在研究该皮肤炎症性疾病的发病机制及托法替尼（一种JAK抑制剂）的治疗效果。数据集包含通过单细胞RNA测序（scRNAseq）获取的基因表达数据，揭示了GA中CD4+ T细胞过度产生干扰素-γ（IFN-γ）导致巨噬细胞炎症极化及成纤维细胞外基质（ECM）改变，并识别JAK-STAT通路活性异常。数据来源于五名严重GA患者接受托法替尼治疗前后的皮肤样本及血浆样本，展示了治疗对细胞因子活性、巨噬细胞溶解及高细胞因子血症的抑制效果。主要研究方向为炎症性皮肤病机制、JAK抑制剂靶向治疗及单细胞转录组学在临床研究中的应用。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=a5ff4461bd00c3cb92fad0cbde7e3c30
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个关于环形肉芽肿（GA）的RNA-Seq数据集，旨在研究该皮肤炎症性疾病的发病机制及托法替尼（一种JAK抑制剂）的治疗效果。数据集包含通过单细胞RNA测序（scRNAseq）获取的基因表达数据，揭示了GA中CD4+ T细胞过度产生干扰素-γ（IFN-γ）导致巨噬细胞炎症极化及成纤维细胞外基质（ECM）改变，并识别JAK-STAT通路活性异常。数据来源于五名严重GA患者接受托法替尼治疗前后的皮肤样本及血浆样本，展示了治疗对细胞因子活性、巨噬细胞溶解及高细胞因子血症的抑制效果。主要研究方向为炎症性皮肤病机制、JAK抑制剂靶向治疗及单细胞转录组学在临床研究中的应用。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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