环形肉芽肿治疗及托法替尼对促炎细胞因子活性的抑制 [RNA-Seq]
该数据集是一个基于单细胞RNA测序（scRNAseq）的基因表达数据集，包含环形肉芽肿（GA）患者皮肤和血浆样本的转录组数据，主要模态为基因表达谱（RNA-Seq），用于研究GA的发病机制中JAK-STAT通路异常及托法替尼（JAK抑制剂）的治疗效果，旨在为炎症性皮肤病提供分子靶向治疗依据。
![Treatment of granuloma annulare and suppression of pro-inflammatory cytokine activity with tofacitinib [RNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/13466.jpg)
基本信息
资源简介
环形肉芽肿治疗及托法替尼对促炎细胞因子活性的抑制 [RNA-Seq]
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Treatment of granuloma annulare and suppression of pro-inflammatory cytokine activity with tofacitinib [RNA-Seq]》。源站首次发布：2022-02-20。
【数据内容】
源站原始描述：Granuloma annulare (GA) is a common inflammatory cutaneous disorder characterized by macrophage accumulation and activation in the skin. Its pathogenesis is poorly understood and there are no reliably effective treatments. Its potential health implications, if any, are unknown. Using single cell RNA sequencing (scRNAseq) we show that in GA, CD4+ T cells over-produce interferon (IFN)-g resulting in inflammatory polarization of macrophages and in altered extracellular matrix (ECM) production induc…
【主题与分类】
主题标签：Granuloma annulare、IFN-γ、JAK inhibitor、oncostatin M、tofacitinib.、Granuloma annulare、IFN-γ、JAK inhibitor、oncostatin M、tofacitinib.。
【获取与许可】
源站页面：http://data.iscr.ac.cn/Article?id=a5ff4461bd00c3cb92fad0cbde7e3c30
使用许可：openSource。
规范引用：PMID: 33317858
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- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个关于环形肉芽肿（GA）的RNA-Seq数据集，旨在研究该皮肤炎症性疾病的发病机制及托法替尼（一种JAK抑制剂）的治疗效果。数据集包含通过单细胞RNA测序（scRNAseq）获取的基因表达数据，揭示了GA中CD4+ T细胞过度产生干扰素-γ（IFN-γ）导致巨噬细胞炎症极化及成纤维细胞外基质（ECM）改变，并识别JAK-STAT通路活性异常。数据来源于五名严重GA患者接受托法替尼治疗前后的皮肤样本及血浆样本，展示了治疗对细胞因子活性、巨噬细胞溶解及高细胞因子血症的抑制效果。主要研究方向为炎症性皮肤病机制、JAK抑制剂靶向治疗及单细胞转录组学在临床研究中的应用。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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