PRJNA1474100：Cathepsin C 经 PI3K-AKT 通路限制甲型流感病毒复制
该数据集来自 NCBI，包含 A549 细胞感染 H1N1 毒株 A/Puerto Rico/8/1934（PR8，MOI=0.1）后的 RNA 测序原始序列读段，比较了 CTSC 过表达、CTSC 敲低及各自对照细胞在感染后 24 小时的转录组谱
基本信息
资源简介
PRJNA1474100：Cathepsin C 经 PI3K-AKT 通路限制甲型流感病毒复制
该数据集来自 NCBI，包含 A549 细胞感染 H1N1 毒株 A/Puerto Rico/8/1934（PR8，MOI=0.1）后的 RNA 测序原始序列读段，比较了 CTSC 过表达、CTSC 敲低及各自对照细胞在感染后 24 小时的转录组谱。数据可用于研究 Cathepsin C 在流感病毒感染中的作用及其经 PI3K-AKT 通路影响凋亡与炎症的分子机制，并支持宿主限制因子与病毒-宿主互作分析（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：Cathepsin C（CTSC）是一种溶酶体半胱氨酸蛋白酶。本研究旨在探究 CTSC 在甲型流感病毒（H1N1）感染中的作用及其潜在分子机制。通过对感染 H1N1 毒株 A/Puerto Rico/8/1934（PR8，MOI=0.1）的 A549 细胞进行 RNA 测序，我们比较了 CTSC 过表达、CTSC 敲低及其各自对照细胞在感染后 24 小时的转录组谱。结果表明，CTSC 在体外和体内均显著限制 H1N1 复制。机制上，CTSC 抑制 PI3K-AKT 信号通路，导致凋亡增强和炎症减轻。该数据集为宿主限制因子和病毒-宿主互作提供了见解，并提示 CTSC 可作为抗流感的潜在宿主导向抗病毒靶点。
【主题与分类】
主题标签：Raw sequence reads。本站分类：感染性疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1474100
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1474100
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
组织蛋白酶C（CTSC）是一种溶酶体半胱氨酸蛋白酶。本研究旨在探究CTSC在甲型流感病毒（H1N1）感染中的作用及其潜在分子机制。利用RNA测序技术，对以MOI=0.1感染H1N1毒株A/Puerto Rico/8/1934（PR8）的A549细胞进行分析，我们在感染后24小时比较了CTSC过表达、CTSC敲低及其各自对照细胞的转录组图谱。结果表明，CTSC在体外和体内均显著抑制H1N1复制。机制上，CTSC抑制PI3K-AKT信号通路，从而导致细胞凋亡增强和炎症减轻。该数据集为宿主限制因子及病毒-宿主相互作用提供了见解，并提示CTSC可作为抗流感的潜在宿主导向抗病毒靶点。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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