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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1827 个数据集

基因组学与多组学单细胞基因组学蛋白质组学转录组多模态评测基准

scT&P-4M — 全球首个大规模 RNA-蛋白共测单细胞语料库 426 万细胞 × 382 表面蛋白

原始数据多模态数据公共数据整合约 426 万单细胞（Methods 精确值 4,260,545），来自 249 个独立共测样本；无个体级患者数量披露（语料为公开二次整合，样本单元是数据集/样本而非患者）

CAPTAIN 模型预训练语料——249 个共测样本、426 万细胞、382 种标准化表面蛋白，92.01% 来自 CITE-seq；门户公开检索下载，代码 MIT 而数据许可未公开

GEO、ArrayExpress 与 10x Genomics 官网公开的 RNA-蛋白共测单细胞数据集（CITE-seq 为主，92.01%），经统一 HGNC 基因词表（19,264 基因）与 382 表面蛋白标准化词表整合为 CAPTAIN 预训练语料 43

医学影像CT图像分类目标检测真实世界数据

ChestPathCT5-S100 — 洛桑大学医院 87 例真实世界胸部 CT 的五病变开放数据集

87 例胸部 CT（NIfTI）五类病变单标签 + 87×5 共现矩阵三种对比剂期相（动脉静脉平扫）Zenodo 直下 · 9.4 GB87 例检查（初始 100 例，排除 13 例）；男 49 / 女 38；年龄中位 64 岁

十年单中心回顾性队列压缩成 9.4 GB 的 NIfTI 大礼包——肋骨骨折、胸腔积液、肺肿块、肺栓塞、气胸各成一包，刻意保留动脉期/静脉期/平扫三种采集异质性，配一张 87×5 共现矩阵撑起多标签研究，CC0 1.0 零门槛直下

Zenodo: ChestPathCT5-S100 v1.0（Jesionowski/Rotzinger/Jayet/Fahrni，洛桑大学医院，2026-02-20）；论文 GigaByte gigabyte.184（PMID 42245226） 26

医学影像CT图像分类内窥镜影像肺癌评测基准

BronchoAccess — 438 例术前 CT 联结支气管镜真实取材转归的可达性预测数据集

影像数据临床结局标注公开数据438 例患者（3 家临床中心），每例 1 个目标病灶；279 例诊断成功 + 159 例非诊断

三中心 438 例 3D CT 配对「活检是否取得诊断性组织」的术后硬结局，把「这支镜子能不能到」从术者主观阅片变成可监督的二分类任务，并以解剖感知专家混合模型（AUROC 0.8052）确立首个基准

西北大学 Bagci Lab 三中心回顾性队列：术前胸部 3D CT（NIfTI）+ 病灶 patch + 气道树图（PyTorch Geometric .pt）+ labels.csv 转归标签，Hugging Face 公开直链（gated=false） 27

基因组学与多组学队列研究GWAS测序数据公共卫生与流行病学

ChinaMAP 中国代谢解析计划 — 万人深度全基因组 + 前瞻队列 + RCT 的国家级代谢病开放数据门户

10,588 人深度 WGS40.80× 测序深度1.36 亿 SNP1,000 万 Indel五模块整合门户申请制获取一期 WGS 队列 10,588 人；门户另有 4C / BPROAD / GOCY / CNDS 四模块（各自样本量未公开）

瑞金医院 / 国家代谢性疾病临床医学研究中心（上海）牵头：10,588 人 × 40.80× WGS、1.36 亿 SNP + 1,000 万 Indel、8 民族 27 省；2026-05-11 官网 www.mbiobank.com 发布并开放全球数据申请

ChinaMAP 官方网站 mBiobank（WGS 变异检索、4C 前瞻队列、BPROAD 随机对照试验、GOCY 极端肥胖病例对照、CNDS 慢病监测），申请制发放 26

公共卫生与流行病学疾病监测公共卫生统计全球健康流行病学

STI Prevalence Atlas — WHO 首个中低收入国家 STI 患病率证据图集：766 项研究、2,453 个数据点

文献抽取聚合统计汇总数据非个体级数据：766 项研究 / 2,453 个患病率数据点（2026-06 口径），每个数据点对应一个 Study Group（研究×国家×性别×时段×人群）

WHO 于 2026 年 7 月发布的 STI Prevalence Atlas，把 2010 年后中低收入国家散落在文献与国别报告中的衣原体、淋病、HSV-2、梅毒、滴虫病患病率，按研究×人群×地点拆成可比的 Study Group 数据点；它是患病率汇总库而非个体级微数据，看板呈现、无公开 bulk 下载

WHO STI Prevalence Atlas 数据看板（data.who.int/dashboards/sti-prevalence-atlas）：Anova Health Institute 系统综述 + 89 篇已发表系统综述 + UNAIDS 国别报告 + 专项检索，抽取为 Study / Study Group / 患病率三层记录 46