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医学影像 AI-Ready 数据集

电子病历与文本数据集

病灶分割与标注数据集

共 600 个数据集

Human Brain snRNA-seq Atlas — 1400 万核 · 31 脑区 · 2,239 例死后样本的 AD 单核转录组图谱
基因组学与多组学单细胞基因组学神经科学神经退行性疾病阿尔茨海默病转录组

Human Brain snRNA-seq Atlas — 1400 万核 · 31 脑区 · 2,239 例死后样本的 AD 单核转录组图谱

约 1400 万细胞核31 个脑区2,239 例死后样本GEO 内仅 6 例验证样本2,239 例深度表型化死后样本(GEO 归档仅 6 例 iPSC 验证样本)

GSE326002 / PRJNA1442802:CN·AD·CR·PART 四分组的人脑单核 RNA 测序最大规模自述图谱

UCDP 冲突数据 — 41.8 万起有组织暴力事件,记到村庄与单日
公共卫生与流行病学电子健康记录评测基准

UCDP 冲突数据 — 41.8 万起有组织暴力事件,记到村庄与单日

417,968 起事件126 个国家1989–2025,425.8 万死亡村庄级坐标单日精度CC BY 4.0,79 个数据集不适用(事件级聚合记录,不含个体身份;伤亡数为事件级估计,非个人记录)

它不是伤亡统计,是把「暴力」这件事拆成可核验的最小单元:某天、某个坐标、哪两方、死了多少人、依据什么来源。37 年、126 个国家、425.8 万条死亡记录。做冲突与健康研究时,这是唯一能让你把「战争」当作一个可测量的环境暴露变量接进模型的东西

OECD 健康统计 — 86 个 dataflow,把「卫生系统」拆成可比的零件
公共卫生与流行病学电子健康记录评测基准

OECD 健康统计 — 86 个 dataflow,把「卫生系统」拆成可比的零件

86 个 dataflow18 组 DSD51 个经济体1960–2024SDMX 3.0CC BY 4.0卫生系统绩效不适用(国家与地区级聚合统计;PaRIS 患者报告指标调查在独立的 dataflow,为抽样调查聚合结果,不含个体记录)

它不是一份数据,是一套 SDMX 3.0 的机器可读接口:生命 expectancy、医疗支出与筹资、医生护士密度、病床与 ICU、住院与手术量、癌症与传染病死亡、可避免死亡、药品市场——全部放在同一套维度模型下。做卫生系统比较研究时,你真正需要的那张「国家 × 年 × 指标」表,这里有 18 组数据流等着被拼起来

世界银行开放数据 — 29,544 个指标,把「国家」变成一行
公共卫生与流行病学电子健康记录多模态评测基准

世界银行开放数据 — 29,544 个指标,把「国家」变成一行

29,544 个指标296 个国家与地区71 个数据源健康主题 658 指标1960 年至今CC BY 4.0v2 REST API不适用(国家与地区级聚合统计,无个体记录;个体级微数据在独立的 Microdata Library,另需申请)

它不是一个数据集,是 71 个数据源的统一检索层:每个指标都标了原始生产者(WHO、UNICEF、ILO、IMF),每条观测都带国家代码、年份、单位与小数位。做跨国健康公平研究时,你真正需要的那张表在这里是「国家 × 年份 × 指标」的三维点阵

Matbench — 13 个材料任务,给算法排座次
药物发现与化学化学信息学分子性质预测评测基准量子化学

Matbench — 13 个材料任务,给算法排座次

13 个任务408,062 条样本五折嵌套交叉验证10 个原始来源modified BSD划分文件随包分发不适用(无机材料数据库,无生物个体;13 个任务中 0 个涉及人体样本)

它本身不是一个材料数据库,而是一份「考卷」:13 道题、10 个原始数据来源、40.8 万条样本,五折嵌套交叉验证、随机种子写死、划分文件随包分发。它的价值在于把「我的模型更好」这句话变成可复核的分数——代价是,你必须接受它的清洗口径与划分方式,而不是自己那套

QMOF — 20,372 个金属有机框架,四种泛函的带隙
药物发现与化学化学信息学量子化学分子性质预测虚拟筛选

QMOF — 20,372 个金属有机框架,四种泛函的带隙

20,372 个 MOF231 万原子79 种元素四档泛函带隙DDEC6CM5Bader 电荷CC BY 4.0需注册 CSD 才能取初始结构不适用(材料化学数据库,无生物个体;结构来源中 0 个涉及人体样本)

它是第一个把周期性 DFT 系统性地做在 MOF 上的公开库:500 个原子的大晶胞、170 CPU 年的算力、四种泛函的同一批结构。它最锋利的地方不是规模,而是那组「PBE 带隙双峰、HSE06 变单峰」的对照——同一批材料,换个泛函,结论会翻转

SHARE — 28 国 17.5 万人,欧洲老去过程的统一标尺
电子健康记录队列研究调查数据公共卫生与流行病学全球健康

SHARE — 28 国 17.5 万人,欧洲老去过程的统一标尺

28 个国家175,000 名受访者690,000 次访谈10 个波次22 年跨度21 项干血斑标志物四国行政记录链接严禁商用175,000(28 国 50 岁以上受访者;DBS 子样本约 27,000)

同一份问卷、同一套变量名、同一套缺失码,在 28 个国家问了 22 年:它让「德国的老人比意大利健康吗」这个问题第一次变得可以计算——而它最锋利的部分,是那 2.7 万份干血斑

Add Health — 2 万个美国青少年,从 12 岁追到 44 岁
电子健康记录队列研究调查数据公共卫生与流行病学基因组学与多组学

Add Health — 2 万个美国青少年,从 12 岁追到 44 岁

90,118 份校内问卷20,745 人家访6 波随访32 年跨度干血斑生物标志物DNA 甲基化双轨访问禁 LLM 使用20,745(Wave I 家访全样本;公开版子样本 6,504)

1994 年在 145 所中学里问出 9 万份问卷,抽 2 万人做家访,然后每 5–7 年回去一次,一直到 2025 年他们 44 岁——这不是一个数据集,是一代人被反复测量的三十年

Europe PMC — 4,911 万条生命科学文献,1.3 亿条机器标注
医疗NLP生物医学文献知识图谱命名实体识别公共卫生与流行病学

Europe PMC — 4,911 万条生命科学文献,1.3 亿条机器标注

4,911 万条文献1,244 万条全文835 万条开放获取13 亿条标注34 个预印本服务器开放式 REST无需注册不适用(文献书目库,个体患者数据仅以论文内聚合形式出现)

它不是 PubMed Central 的欧洲镜像:多了预印本、专利、Agricola,多了一整套资助方反查,还多了 13 亿条文本挖掘标注——这是目前唯一能「按钱查论文、按论文查数据」的公开文献基础设施

TCMSP — 502 味药材、13,729 个化合物,每个都带五项成药性打分
药物发现与化学基因组学与多组学公共卫生与流行病学

TCMSP — 502 味药材、13,729 个化合物,每个都带五项成药性打分

502 味药材13,729 个化合物3,339 个靶点867 种疾病OBDL 双达标 2,583ODbL 许可老版 2.3 免费不适用(化合物与靶点参考库,无患者数据)

免费的老版 2.3 只有 502 味药材和 13,729 个化合物,但每一个化合物都配齐 OB、DL、Caco-2、BBB、溶解度——这是网络药理学十年来的筛选口径本身

CPIC — 把基因型翻译成剂量的那一层
基因组学与多组学电子健康记录医学问答与基准

CPIC — 把基因型翻译成剂量的那一层

132 个基因324 种药物29 部指南2,115 条推荐112,820 条双倍型开放式 REST无需注册不适用(指南与推荐表,无真实患者记录)

132 个基因、324 种药、29 部指南、2,115 条推荐:它不做研究,只做一件事——把文献里的证据定级,然后落成一句「该加量、减量、还是换药」

DANDI Archive — 神经电生理数据联邦档案库
神经科学生理信号电子健康记录多模态

DANDI Archive — 神经电生理数据联邦档案库

NWB 格式BIDS 格式OME-Zarr上千个 dandisets版本化数据集CC-BY-4.0元数据 CC0单文件 5 TB 上限embargo 6 个月0

它不是一个数据集,是上千个数据集的容器。首页写着一千零五十九个、九百二十二太比特,同一个站的 API 却报九百三十八、一千二百零九;四个官方来源给出四个规模数字。这个库真正值得学的是它怎么把「版本」和「许可」做成硬约束

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