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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

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共 97 个数据集

临床电子病历初级保健 EHR流行病学队列风险预测处方药物流行病学

QResearch — 英国初级保健研究数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 3,500 万累计患者1,500+ EMIS 诊所申请审核制可链接 HESONS 死亡记录回溯至 1989约 3,500 万累计患者（部分表述 4,000 万）

英国最大 EMIS 初级保健 EHR · 3,500 万+患者 · QRISK/QCovid 发源地

QResearch（University of Oxford & EMIS Health） url: https://www.qresearch.org/ 1

脑神经公共卫生神经科学参考图谱单细胞基因组学

BICCN — 哺乳动物脑细胞普查多模态图谱 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

数百万细胞 · 多模态跨小鼠狨猴人类运动皮层CC BY 4.0 开放NeMOBILDANDI 档案biccn.org 门户浏览运动皮层细胞普查图谱（细胞级数据，非患者队列）：小鼠/狨猴/人类供体数百万细胞

NIH BRAIN 计划跨物种运动皮层细胞普查图谱 · 数百万细胞 · 多模态

BRAIN Initiative Cell Census Network (BICCN) / BRAIN Cell Data Center (BCDC), Allen Institute url: https://www.biccn.org 1

药物警戒自发不良事件报告上市后安全监测真实世界证据

FAERS — 全球最大自发药物警戒库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

FDA 公开免费下载季度非累计 ASCIIXMLMedDRA 编码七表 PRIMARYID 关联含重复报告需去重去标识化公开数千万条报告（含重复，FDA 仪表盘 2026-03 约 3,282 万条）

FDA 不良事件自发报告系统 · 累计报告 3,000 万+ · 公开免费

U.S. Food and Drug Administration (FDA) url: https://fis.fda.gov/extensions/FPD-QDE-FAERS/FPD-QDE-FAERS.html 1

医疗 NLP 与多模态病理图像视觉问答医学 AI 基准

PathVQA — 病理视觉问答基准数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

4,998 张病理图像32,799 条问答对约 785 MB ParquetMIT 许证开放下载不适用（图像源自出版教科书与 PEIR 公共数字图书馆，不含患者信息）

4,998 张病理图像、32,799 条问答对的病理 VQA 开放基准

UCSD-AI4H（加州大学圣地亚哥分校 / 卡内基梅隆大学 / 北京工业大学） url: https://github.com/UCSD-AI4H/PathVQA 1

临床电子病历与重症监护初级保健 EHR药物警戒真实世界数据

THIN — 英国初级保健 EHR 数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 1,970 万累计患者850+ 全科诊所5 张核心数据表Read code 层级编码申请审核 + 商业许可1994 年起纵向记录累计约 1,970 万患者（现役约 290 万）

覆盖约 6% 英国人口的 1,970 万人初级保健电子病历库

IQVIA（The Health Improvement Network / IQVIA Medical Research Data） url: https://www.the-health-improvement-network.com/ 2

公共卫生与脑神经脑影像影像遗传学多中心联盟荟萃分析

ENIGMA — 国际多中心脑影像遗传联盟 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

50 个活跃工作组43 国 200+ 机构GWAS 汇总 51,665 人26 种脑疾病协议公开共享汇总统计申请获取代表性 GWAS 汇总 30,717-51,665 名受试者

50 个工作组、43 国 200+ 机构的分布式脑影像遗传荟萃分析联盟

ENIGMA Consortium（USC Stevens 神经影像与信息学研究所） url: http://enigma.ini.usc.edu/ 2

药物发现药物警戒药物相互作用真实世界证据图学习基准

TWOSIDES — 药物相互作用副作用权威数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

4,651,131 药物对-副作用关联63,473 个药物组合645 种药物1,301 种 MedDRA 副作用CSV 开放下载不适用（FAERS 自发报告聚合数据；覆盖 645 种药物）

645 药物 × 63,473 药物对，465 万药物对-副作用关联

Tatonetti Lab（斯坦福大学，后哥伦比亚大学，现 Cedars-Sinai） url: http://tatonettilab.org/resources/tatonetti-stm.html 2

外科手术手术视频白内障计算机视觉手术工作流分析

CATARACTS — 白内障手术视频基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

50 台白内障手术117.8 GB Full HD 视频21 类器械逐帧标注18+1 类手术阶段标注免费开放获取50 名白内障患者（38 女 / 12 男，平均 61 岁）

50 台白内障手术、9 小时 Full HD 显微镜视频、21 类器械与 18 类手术阶段逐帧标注

布雷斯特大学医院（CHU de Brest）× LaTIM / Inserm UMR 1101 url: https://ieee-dataport.org/open-access/cataracts 2

["医疗 NLP 与多模态""医学影像""视觉问答""知识图谱"]

SLAKE — 中英双语医学 VQA 基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

["642 幅放射影像""中英双语 QA（清洗版 5,980 条）""5,232 条知识三元组""约 217 MB JSON图像打包""CC-BY-4.0 免费下载"]不适用（影像级开放数据，未提供独立患者人口学信息）

642 幅放射影像、中英双语问答与 5,232 条知识图谱三元组的医生标注 Med-VQA 基准

name: "香港理工大学（med-vqa.com / HuggingFace BoKelvin/SLAKE）" url: "https://www.med-vqa.com/slake/" 2

基因组学多组学转录调控功能基因组

FANTOM5 — 哺乳动物转录调控元件图谱 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

2,832 个 CAGE 样本201,802 个人类 CAGE 峰65,423 个增强子CC BY 4.0 开放获取核心表达表 4.1 GB2,832 个样本（1,816 人 + 1,016 小鼠，phase 1+2）

975 人类样本启动子图谱 + 43,011 增强子，CAGE 单碱基分辨率转录调控参考

FANTOM Consortium / RIKEN Center for Integrative Medical Sciences url: https://fantom.gsc.riken.jp/5/ 2

临床电子病历重症监护 EHR & ICU多中心登记队列流行病学

CUB-Réa — 法国大巴黎 ICU 多中心登记队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 475,357 次 ICU 入院35-40 家大巴黎 ICU1993 年起前瞻采集申请审核获取累计 47.5 万+ 次 ICU 入院（1997-2016 公开研究口径）

累计 47.5 万+ 次 ICU 入院的大巴黎多中心重症监护登记库

CUB-Réa Network（SRLF 发起，AP-HP 资助） url: https://doi.org/10.1164/rccm.2201087 2

公共卫生队列研究脑神经儿童青少年精神健康神经影像

HBN — 儿童青少年脑与精神健康跨诊断队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 4,867 名受试者多模态 MRIEEG表型BIDS 格式CC BY-NC-SA 与 CC BY-SA 双许可DUA 申请获取约 4,867 名 5-21 岁受试者（Release 11，数据截至 2022-11）

5-21 岁约 4,867 名受试者的跨诊断儿童脑与精神健康开放生物样本库

Child Mind Institute（美国儿童心理研究所） url: https://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/cmi_healthy_brain_network/ 1

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