肺炎

肺炎指由非感染性因素引起的肺实质炎症，病理特征为肺泡壁及间质内炎性细胞浸润、水肿和纤维蛋白沉积，区别于感染性肺炎。发病机制常涉及吸入性损伤、药物毒性、放射治疗、自身免疫反应或过敏原暴露，诱发局部免疫失调与氧化应激。典型临床表现包括干咳、进行性呼吸困难、低氧血症，听诊可闻及爆裂音，影像学显示弥漫性磨玻璃影或网状阴影。诊断依赖高分辨率CT、支气管肺泡灌洗及肺功能评估，糖皮质激素为主要治疗手段，重症需呼吸支持。该疾病在间质性肺病、肿瘤治疗相关性肺损伤及免疫检查点抑制剂相关不良反应等研究与应用场景中具有重要临床价值。

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共 616 个数据集

CARDS与非ARDS患者两个时间点BALF单细胞图谱

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI，为CARDS与非ARDS患者两个时间点的支气管肺泡灌洗液（BALF）单细胞转录组数据，共纳入8例重症ARDS患者（4例CARDS、4例非CARDS，含2例细菌性肺炎和2例真菌性肺炎）

UHRF1介导的维持性DNA甲基化对流感诱导的年轻成年小鼠肺损伤后诱导性调节性T细胞功能至关重要[体外RNA测序]

基因组预测Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI，属于呼吸系统疾病/肺炎分类下的转录组或基因表达数据，包含体外诱导性调节性T细胞（iTregs）的RNA-seq数据

UHRF1介导的维持性DNA甲基化对流感诱导肺损伤后年轻成年小鼠诱导性调节性T细胞功能的作用[RNA-seq]

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI，属于呼吸系统疾病/肺炎分类下的转录组或基因表达数据，主题为UHRF1介导的维持性DNA甲基化在年轻成年小鼠流感诱导肺损伤后对诱导性调节性T细胞功能的作用

PRJNA1036578：IBR1——一种与IFIH1解旋酶结构域结合的新型内源性双链RNA及其在ARDS中LPS诱导的IFIH1激活和巨噬细胞M1极化中的作用[ATAC, ChIP]

时间序列Epigenomics

该数据集来自NCBI，属于呼吸系统疾病/肺炎分类下的表观基因组学数据，包含ATAC与ChIP实验类型。研究聚焦急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中由巨噬细胞和单核细胞驱动的失控炎症反应，探讨新转录本IBR1作为内源性dsRNA结合IFIH1解旋酶结构域，在LPS诱导的IFIH1激活及巨噬细胞M1极化中的

PRJNA929329：人脐带间充质干细胞治疗COVID-19所致急性呼吸窘迫综合征

基因组分类Raw sequence readsCOVID-19

本数据集来自NCBI，对应研究人脐带间充质干细胞移植对重症COVID-19患者安全性和临床结局的影响，重点关注重症COVID-19肺炎患者移植后肺功能状态、miRNA及细胞因子水平变化及其与肺纤维化的相关性

PRJNA1333963：单细胞RNA测序揭示AhR激活经肺免疫与上皮细胞多通路减轻急性呼吸窘迫综合征

时间序列分类Transcriptome or Gene expressionCOVID-19

该数据集来自NCBI，属于呼吸系统疾病/肺炎分类，主题为转录组或基因表达。研究采用单细胞RNA测序（scRNA-seq）探究2,3,7,8-四氯二苯并二噁英（TCDD）激活芳香烃受体（AhR）对LPS诱导小鼠急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的作用

IBR1：一种新型内源性双链RNA与IFIH1解旋酶结构域结合及其在ARDS中LPS诱导的IFIH1激活和巨噬细胞M1极化中的作用[RNA-seq]

时间序列预测Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI，属于呼吸系统疾病/肺炎分类下的 RNA-seq 转录组数据，主题为基因表达。研究聚焦急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中由巨噬细胞和单核细胞驱动的失控炎症反应，涉及 IFIH1 作为巨噬细胞 M1 极化关键调控因子、其被 LPS 激活的机制，以及新转录本 IBR1 在单核细胞和巨

肺炎克雷伯菌噬菌体抗性突变株与野生型NUHL30457转录组数据

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自NCBI，包含肺炎克雷伯菌野生型菌株NUHL30457及三株噬菌体抗性突变株（KpR30、KpR32、KpR33）的转录组测序原始序列数据

PRJNA1143381：TNFSF14驱动流感后肺泡巨噬细胞耗竭致继发性肺炎链球菌肺炎

基因组预测Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI，聚焦流感A病毒感染后肺泡巨噬细胞耗竭及继发性肺炎链球菌肺炎的分子机制。研究结合单细胞转录组与细胞特异性PCR，在体内感染模型中揭示TNFSF14配体-受体轴驱动流感后组织驻留肺泡巨噬细胞死亡，从而促进继发细菌感染

PRJNA1149109：Vanderbilt家族性肺纤维化的遗传图谱

基因组分类家族性间质性肺炎特发性肺纤维化罕见遗传变异全外显子测序呼吸系统疾病肺炎

该数据集来自一项研究，该研究旨在识别家族性间质性肺炎（FIP）个体中的致病性罕见遗传变异。受试者来自我们正在进行的FIP登记库（IRB #020343），其中FIP定义为两个或以上家庭成员患有特发性间质性肺病（ILD），且至少一名受影响个体被诊断为特发性肺纤维化（IPF）

PRJNA1537757：儿童支气管炎与肺炎配对鼻咽与气管吸出物微生物群

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1537757），主题为儿童支气管炎与肺炎中从插管到拔管的配对鼻咽与气管吸出物微生物群研究

PRJNA649150：SARS-CoV-2肺炎中感染巨噬细胞与T细胞间的回路

视频分类Transcriptome or Gene expressionCOVID-19

该数据集来自ncbi.nlm.nih.gov，聚焦SARS-CoV-2感染所致肺炎的免疫机制。研究采集了88例SARS-CoV-2所致呼吸衰竭患者及211例其他病原体已知或疑似肺炎患者的支气管肺泡灌洗液样本，进行流式细胞术和bulk转录组分析，并对10例重症COVID-19患者插管后48小时内采集的