CARDS与非ARDS患者两个时间点BALF单细胞图谱
该数据集来自NCBI,为CARDS与非ARDS患者两个时间点的支气管肺泡灌洗液(BALF)单细胞转录组数据,共纳入8例重症ARDS患者(4例CARDS、4例非CARDS,含2例细菌性肺炎和2例真菌性肺炎)

基本信息
资源简介
CARDS与非ARDS患者两个时间点BALF单细胞图谱
该数据集来自NCBI,为CARDS与非ARDS患者两个时间点的支气管肺泡灌洗液(BALF)单细胞转录组数据,共纳入8例重症ARDS患者(4例CARDS、4例非CARDS,含2例细菌性肺炎和2例真菌性肺炎)。源站描述显示,研究聚焦IL1B+中性粒细胞在CARDS病情加重时增多、与不良预后相关,并涉及脂肪酸代谢重编程及其通过caspase依赖途径促进M1巨噬细胞分泌TNF。数据可用于探索中性粒细胞-巨噬细胞互作在CARDS发生机制中的作用(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):在本研究中,对CARDS患者BALF进行单细胞测序得到以下结果:(1)在病情加重的CARDS患者BALF中,IL1B+中性粒细胞显著增加,这与CARDS患者的不良预后相关,并且与其他类型中性粒细胞相比,该类型中性粒细胞发生了脂肪酸代谢重编程,这可能与其高炎症反应有关。(2)IL1B+中性粒细胞通过caspase依赖途径促进高炎症型M1巨噬细胞分泌TNF,提示中性粒细胞-巨噬细胞相互作用在CARDS发生机制中发挥重要作用。总体设计:本研究共纳入8例重症ARDS患者,包括4例CARDS患者和4例非CARDS患者(2例细菌性肺炎、2例真菌性肺炎),其中2例患者接受了w
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:呼吸系统疾病/肺炎。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1004268
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
本研究对CARDS患者BALF进行单细胞测序,结果如下:(1)在病情加重的CARDS患者BALF中,IL1B+中性粒细胞显著增多,这与CARDS患者不良预后相关,且该类中性粒细胞与其他类型中性粒细胞相比发生了脂肪酸代谢重编程,这可能与其高炎症反应有关。(2)IL1B+中性粒细胞通过caspase依赖性途径促进高炎症型M1巨噬细胞分泌TNF,提示中性粒细胞-巨噬细胞相互作用在CARDS发生机制中发挥重要作用。总体设计:本研究共纳入8例重症ARDS患者,包括4例CARDS患者和4例非CARDS患者(2例细菌性肺炎、2例真菌性肺炎),其中2例患者接受ECMO治疗,除1例患者未接受激素治疗外,其余患者均接受激素治疗。每例患者均保留入住ICU时(t1)和出现MS变化值≥1分时(t2)的BALF。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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