乳腺癌
乳腺癌是发生于乳腺导管或小叶上皮细胞的恶性肿瘤，常见病理类型包括浸润性导管癌和小叶癌。其发病与遗传因素（如BRCA1/2突变）、激素暴露、生活方式等多种内外源因素相关。典型临床表现包括乳房无痛性肿块、乳头溢液、皮肤橘皮样改变及腋窝淋巴结肿大。诊断主要依靠乳腺X线摄影、超声、MRI及空芯针穿刺活检，并通过免疫组化检测ER、PR、HER2表达指导分型与治疗。治疗策略整合手术、放射治疗、化疗、内分泌治疗及靶向治疗，强调基于分子亚型的个体化综合管理。乳腺癌已成为精准医学与真实世界研究的重点病种，全球疾病负担持续上升，早期筛查与全程管理显著改善患者预后。
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PRJNA750125：加尼妥单抗和二甲双胍联合标准新辅助治疗用于2/3期乳腺癌：I-SPY2适应性随机平台试验结果
该数据集来自I-SPY2新辅助平台试验，针对高危早期乳腺癌，评估Ganitumab与Metformin联合标准新辅助治疗的疗效
PRJNA635931：乳腺癌与甲状腺癌细胞中甲状腺激素受体β的共同抑瘤信号
该数据集来自 NCBI，聚焦甲状腺激素受体β（TRβ）在乳腺癌与甲状腺癌细胞中的共同抑瘤信号。研究将 TRβ 导入 MDA-MB-468 基底样乳腺癌细胞系并进行 RNA-sequencing，以确定转录组信号变化；TRβ 表达的 MDA-MB-468 细胞经 PCA-PAM50 评分及间充质细胞角
PRJEB123214：CD95（Fas）敲除并回补野生型或截短型CD95的人MDA-MB-231乳腺癌细胞系RNA测序
BioProject 是收集与单一计划相关的生物数据，这些数据来源于单一组织或联盟；BioProject 记录为用户提供一个单一位置，用于查找该项目产生的不同数据类型的链接
PRJNA1532421：稳定过表达PGK1的THP-1来源巨噬细胞样细胞与空载体对照的bulk RNA测序
BioProject 汇集与单一计划相关的生物数据，可源自单一组织或联盟；其记录为用户提供统一入口，用于查找该项目生成的不同数据类型链接（来源 NCBI）
PRJNA1534148：声遗传学控制与肿瘤基因组编辑协同导向CAR-T疗法对抗实体瘤
其原始描述指出，BioProject 是与单一倡议相关的生物数据集合，来源于单一组织或联合体；BioProject 记录为用户提供一个统一入口，用于查找该项目产生的多种数据类型
HCC1395肿瘤与配对正常HCC1395BL的全外显子测序及HCC1395的bulk RNA-seq
数据以原始序列读段（Raw sequence reads）形式提供，属于肿瘤/乳腺癌方向。可用于乳腺癌相关的体细胞变异识别、肿瘤与正常样本比较分析，以及结合转录组信息开展表达与变异整合研究（来源 NCBI）
SSEA4 与化疗耐药相关的乳腺癌 PDX miRNA 数据集
该数据集来自 NCBI，属于肿瘤/乳腺癌分类，主题为转录组或基因表达。数据包含四个样本组，分别为从人乳腺癌细胞小鼠异种移植瘤中分离的 SSEA4- 和 SSEA4+ 细胞组分，每个组分设两个技术重复
PRJNA227137：乳腺癌亚型与正常组织的mRNA测序
该数据集来自NCBI，包含乳腺癌三种亚型（TNBC、Non-TNBC、HER2阳性）及正常组织的mRNA测序数据，样本由Baylor College of Medicine提供并经IRB程序使用
PRJNA688545：通过连续活检与综合分析刻画晚期乳腺癌异质性与治疗耐药
在本研究中，我们通过精准肿瘤学项目 Serial Measurements of Molecular and Architectural Responses to Therapy（SMMART），对一名转移性乳腺癌患者进行连续活检、多组学分析和纵向患者监测，讨论了其分子异质性的临床意义与后果
PRJNA688546：通过连续活检与综合分析刻画晚期乳腺癌异质性与治疗耐药
研究通过连续活检、多组学分析和纵向患者监测，在 SMMART 精准肿瘤学项目中探讨一例转移性乳腺癌患者的分子异质性及其临床意义
人类PAR-CLIP数据集
该数据集来自 NCBI，属于肿瘤/乳腺癌分类，核心为在 MCF7 细胞中开展的 argonaute-2 光激活核糖核苷增强交联免疫沉淀（AGO2-PAR-CLIP）实验，用于生成经生化验证的 miRNA 结合位点集合
PRJNA246530：浆液性卵巢肿瘤分子亚型揭示与乳腺固有癌亚型的多重关联
该数据集来自 NCBI，包含 59 例新鲜冷冻卵巢肿瘤的全局基因表达谱数据，使用 Illumina HT12 Bead Arrays 检测
