PRJNA635931：乳腺癌与甲状腺癌细胞中甲状腺激素受体β的共同抑瘤信号

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA635931

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数据说明

甲状腺激素受体β（TRβ）在多种实体瘤中是一种抑癌因子，尤其在乳腺癌和甲状腺癌中最为显著。深入理解TRβ抑制肿瘤发生的分子机制，有助于揭示TRβ所促进的核心抑癌程序。在此，我们将TRβ引入MDA-MB-468基底样乳腺癌细胞系，并进行RNA测序以确定转录组信号的变化。表达TRβ的MDA-MB-468细胞通过PCA-PAM50评分及间充质细胞角蛋白的抑制，表现出更强的上皮特征。上皮-间充质转化通路也显著减弱。还将MDA-MB-468数据集与甲状腺癌细胞系SW1736的RNA测序结果进行比较，以确定在两种组织类型中受TRβ调控的基因。共享基因集显示硬脂酸生物合成上调，这是一种已知能抑制乳腺肿瘤发生的脂质，染色质重塑通路也同样上调。

这些数据为TRβ抑制乳腺肿瘤发生的分子机制提供了新的见解，并提示其在乳腺癌和甲状腺癌中具有共同的代谢作用，以及TRβ在维持上皮细胞身份中的作用。总体设计：对稳定过表达TRβ的乳腺癌细胞进行转录组分析，并与同样过表达TRβ的甲状腺癌细胞（GSE150364）进行比较。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。