PRJEB123214:CD95(Fas)敲除并回补野生型或截短型CD95的人MDA-MB-231乳腺癌细胞系RNA测序
BioProject 是收集与单一计划相关的生物数据,这些数据来源于单一组织或联盟;BioProject 记录为用户提供一个单一位置,用于查找该项目产生的不同数据类型的链接

基本信息
资源简介
PRJEB123214:CD95(Fas)敲除并回补野生型或截短型CD95的人MDA-MB-231乳腺癌细胞系RNA测序
CD95TNBC (ID 1530080) - BioProject - NCBI
该源站标题为“CD95TNBC (ID 1530080) - BioProject - NCBI”,标签为 Other。BioProject 是收集与单一计划相关的生物数据,这些数据来源于单一组织或联盟;BioProject 记录为用户提供一个单一位置,用于查找该项目产生的不同数据类型的链接。以上为基于所给事实的中文摘要(来源 NCBI)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):BioProject 是与单一研究计划相关的一组生物学数据,源自单一机构或一个联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口,以便找到指向该项目所生成的各种数据类型的链接。
【主题与分类】
主题标签:Other。本站分类:肿瘤/乳腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB123214
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB123214
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对人工三阴性乳腺癌(TNBC)细胞系MDA-MB-231进行了RNAseq分析,以研究CD95在这些癌细胞中发挥的抗炎作用。将亲本(野生型)MDA-MB-231细胞的基因表达谱与CD95缺陷(CD95敲除,CD95 KO)细胞的基因表达谱进行了比较。为阐明CD95表达是否影响转录调控以及参与该调控的胞内结构域,分别用全长CD95或缺失死亡结构域和C端区域的截短CD95突变体对CD95 KO细胞进行重建,并将其转录组谱与CD95 KO细胞进行了比较。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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