PRJNA688546：通过连续活检与综合分析刻画晚期乳腺癌异质性与治疗耐药

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA688546

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集随附于手稿《通过连续活检和综合分析表征晚期乳腺癌异质性及治疗耐药性》。在本研究中，我们通过精准肿瘤学项目“分子与结构对治疗反应的连续测量”（SMMART），利用连续活检、多组学分析及纵向患者监测，探讨了一例转移性乳腺癌患者分子异质性的临床意义与后果。该案例研究描述了一位转移性乳腺癌患者，其肿瘤具有高度异质性，初诊时为ER阳性/HER2阴性，随后在转移性肝病灶（研究活检#1）中发现为ER阴性/HER2阳性，最终为三阴性……（更多内容请参见dbGaP研究页面。）

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。