共 3407 个数据集

PRJNA1465291:TGF-β2刺激下人真皮淋巴内皮细胞Nogo-B敲低RNA-seq分析

PRJNA1465291:TGF-β2刺激下人真皮淋巴内皮细胞Nogo-B敲低RNA-seq分析

时间序列回归Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI,为TGF-β2刺激下人真皮淋巴内皮细胞(HDLECs)中Nogo-B敲低的RNA-seq分析。HDLECs经shNogo-B或对照shGFP转导后,用TGF-β2处理72小时,提取总RNA进行高通量测序,并开展比较转录组分析

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PRJNA1242320:NUDT21通过可变多聚腺苷酸化塑造ARDS巨噬细胞转录组

PRJNA1242320:NUDT21通过可变多聚腺苷酸化塑造ARDS巨噬细胞转录组

基因组Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI,主题为转录组或基因表达,聚焦ARDS中巨噬细胞炎症的转录后调控机制。研究围绕可变多聚腺苷酸化(APA)及其关键调控因子NUDT21展开,采用polyA-click seq(PAC)比较分析APA,旨在鉴定巨噬细胞中受NUDT21调控的APA基因

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PRJNA1040858:成年皮肤中MDP-单核细胞分化的趋同演化促进朗格汉斯细胞网络修复[scRNA-seq]

PRJNA1040858:成年皮肤中MDP-单核细胞分化的趋同演化促进朗格汉斯细胞网络修复[scRNA-seq]

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1040858),主题为成体皮肤中 MDP-单核细胞分化的趋同演化允许 Langerhans 细胞网络修复,采用 scRNA-seq 技术,属于转录组或基因表达类数据

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PRJNA1542070:血小板衍生外泌体负载地塞米松处理软骨的转录组分析

PRJNA1542070:血小板衍生外泌体负载地塞米松处理软骨的转录组分析

基因组分类Raw sequence reads

数据围绕经血小板衍生外泌体负载地塞米松处理的软骨开展转录组分析,提供原始序列读长,可用于研究该处理对软骨基因表达的影响。源站未提供样本量、物种、测序平台及具体分析结论等信息(来源 NCBI)

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PRJNA1211681:KAT6B缺失导致发育过程中过早骨化并促进成骨细胞分化

PRJNA1211681:KAT6B缺失导致发育过程中过早骨化并促进成骨细胞分化

基因组预测Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI BioProject,编号 PRJNA1211681,主题为转录组或基因表达,聚焦 KAT6B 缺失导致发育过程中过早骨化并促进成骨细胞分化这一生物学问题

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PRJNA1443362:类风湿关节炎肠道微生物组

PRJNA1443362:类风湿关节炎肠道微生物组

基因组分类Metagenome

该数据集来自 NCBI BioProject,聚焦类风湿关节炎患者的肠道微生物组。研究对 16S rRNA 基因 V3-V4 高变区进行 Illumina MiSeq 测序,以刻画患者与健康对照的肠道微生物组成差异,并识别与疾病活动相关的菌群结构变化

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脂肪细胞调控成纤维细胞功能及其缺失导致炎症性疾病中成纤维细胞功能障碍

脂肪细胞调控成纤维细胞功能及其缺失导致炎症性疾病中成纤维细胞功能障碍

基因组分类Phenotype or Genotype

该数据集来自 NCBI BioProject(编号 PRJNA974175),主题为脂肪细胞调控成纤维细胞功能,以及脂肪细胞缺失如何导致炎症性疾病中的成纤维细胞功能障碍

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MH7A滑膜成纤维细胞Dex与Dex+plexo处理的RNA-seq

MH7A滑膜成纤维细胞Dex与Dex+plexo处理的RNA-seq

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自NCBI,为MH7A人滑膜成纤维细胞的RNA-seq原始测序读段。研究比较单独使用地塞米松(Dex)与Dex联合plexo处理后的转录组变化,测序在Illumina NovaSeq X Plus平台完成,并识别两组间的差异表达基因,开展GO和KEGG功能富集分析

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MYH9-iPSCs基因组校正逆转细胞骨架包涵体并恢复血小板生成

MYH9-iPSCs基因组校正逆转细胞骨架包涵体并恢复血小板生成

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自NCBI,包含利用Illumina MiSeq平台对患者来源iPSCs中CRISPR/Cas9介导的MYH9突变校正进行深度测序验证的高覆盖度测序结果

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PRJNA147101:Atf3-/-与WT BMDMs经LPS处理4小时的应答

PRJNA147101:Atf3-/-与WT BMDMs经LPS处理4小时的应答

时间序列分类Transcriptome or Gene expression

数据主题为转录组或基因表达,可用于分析 Atf3 在巨噬细胞炎症应答中的调控作用及相关差异表达基因。本站将其归类于肌肉骨骼系统疾病/其他(来源 NCBI)

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PRJNA1368813:单细胞与bulk RNA-seq联合揭示骨髓炎免疫景观变化

PRJNA1368813:单细胞与bulk RNA-seq联合揭示骨髓炎免疫景观变化

时间序列分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI,包含小鼠胫骨骨髓炎的时间序列转录组测序数据及单细胞测序数据,用于解析骨髓炎免疫微环境。研究通过模糊C均值聚类识别与疾病进展相关的基因集,利用ImmuCellAI-mouse进行免疫细胞浸润分析,并借助单细胞测序刻画免疫细胞亚群,鉴定在骨髓炎小鼠中显现的关键细胞亚型

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PRJNA1354591:韩国唾液微生物组16S全长测序

PRJNA1354591:韩国唾液微生物组16S全长测序

基因组Raw sequence reads

该数据集包含来自健康韩国个体唾液样本的全长16S rRNA基因测序数据,旨在建立正常生理条件下韩国人群唾液微生物组的综合参考(骨架)数据集

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