PRJNA1040858：成年皮肤中MDP-单核细胞分化的趋同演化促进朗格汉斯细胞网络修复[scRNA-seq]
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1040858），主题为成体皮肤中 MDP-单核细胞分化的趋同演化允许 Langerhans 细胞网络修复，采用 scRNA-seq 技术，属于转录组或基因表达类数据
![PRJNA1040858: Convergent evolution of MDP-monocyte differentiation in adult skin permits repair of the Langerhans cell network [scRNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/96874.jpg)
基本信息
资源简介
PRJNA1040858：成年皮肤中MDP-单核细胞分化的趋同演化促进朗格汉斯细胞网络修复[scRNA-seq]
PRJNA1040858 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录，其完整英文名称为“Convergent evolution of MDP-monocyte differentiation in adult skin permits repair of the Langerhans cell network [scRNA-seq]”。该项目聚焦于成体皮肤中 MDP-单核细胞分化的趋同演化现象，以及这一过程如何允许 Langerhans 细胞网络得以修复，所采用的技术为单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）。从数据主题来看，它归属于转录组或基因表达类别，本站将其归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类之下。该项目为研究者提供了一个集中入口，用以发现和链接围绕这一单一研究计划所产生的多种数据类型。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 1040858。BioProject 是围绕某一单项研究计划而组织的生物数据集合，这些计划通常来自单一机构或联合体。BioProject 记录的核心作用，是为用户提供一个统一的位置，以便查找该项目所产生的各类数据及其链接。就本项目而言，其研究主题涉及成体皮肤中 MDP-单核细胞分化的趋同演化，以及该过程对 Langerhans 细胞网络修复的允许作用。这一主题将免疫细胞分化、皮肤组织修复与演化生物学视角结合在一起，属于转录组或基因表达研究范畴。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其内容属于转录组或基因表达类数据。项目名称中明确标注了 scRNA-seq，说明所采用的技术路线为单细胞 RNA 测序。该技术通常用于在单个细胞水平上测量基因表达情况，从而揭示细胞群体内部的异质性、细胞类型组成以及分化过程中的表达变化。结合项目标题，可以理解该数据旨在从单细胞转录组层面刻画成体皮肤中 MDP-单核细胞的分化过程及其与 Langerhans 细胞网络修复之间的关系。除上述信息外，源站未提供关于样本数量、测序平台、数据量或具体分析结果的进一步说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，具体记录为 NCBI BioProject 中的 ID 1040858。BioProject 作为生物数据集合，其记录本身并不一定直接包含所有原始数据文件，而是提供指向该项目所生成的各种数据类型的链接。因此，该项目的原始测序数据、表达矩阵或其他衍生文件可能分布在 NCBI 的其他相关数据库中，并通过该 BioProject 记录进行关联。关于样本采集地点、采集时间、物种来源、伦理审批信息等具体细节，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签和项目名称，该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是涉及单细胞水平基因表达分析的工作。具体而言，可能适用于研究成体皮肤中免疫细胞分化、MDP-单核细胞谱系、Langerhans 细胞网络修复以及趋同演化等方向的科研人员。由于本站将其归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他，该数据也可能被用于与肌肉骨骼系统疾病相关的交叉研究背景中，作为参考或对比数据。此外，对单细胞 RNA 测序方法学、皮肤免疫学或比较演化生物学感兴趣的研究者，也可能将该数据集纳入分析或元分析。需要说明的是，以上适用场景是基于项目主题和分类所作的合理组织，源站未提供关于具体应用案例或推荐用途的说明。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 记录进行访问，用户可借助项目 ID 1040858 在 NCBI 网站上定位到该记录，并通过记录中提供的链接跳转至相关的数据资源。由于 BioProject 的设计目的是集中呈现与单一研究计划相关的多种数据类型，使用者通常需要根据自身需求，从链接指向的数据库（如 SRA、GEO 等）中获取原始测序数据或表达数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共生物数据资源。其质量与限制取决于原始研究的设计、实验操作和数据处理过程，但源站未提供关于数据质量评估、批次效应、测序深度、细胞数量、覆盖度或验证实验等信息。此外，该记录本身是项目层面的描述，并不等同于经过统一质控的分析就绪数据集。使用者在使用前应自行评估数据的适用性和可靠性。关于该数据集的已知限制、偏倚或注意事项，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可协议或使用条款，源站未提供。使用者应参考 NCBI BioProject 记录页面以及相关原始数据所在数据库的通用引用规范和使用政策。如需引用该数据集，建议直接访问 NCBI BioProject 记录（ID 1040858）以获取最新的引用信息和许可说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1040858
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
朗格汉斯细胞（LCs）是一种独特的吞噬细胞群体，在胚胎皮肤中被编程，以在表皮屏障部位维持组织和免疫稳态。在组织驻留巨噬细胞中，LCs独具特色，不仅参与皮肤神经支配和修复，还作为迁移性专业抗原呈递细胞发挥作用，而这一能力传统上被归因于树突状细胞（DC）。我们目前对这些决定这种二分性的分子通路、它们何时建立，以及招募至成体皮肤微环境的前体细胞是否能够获取在子宫内就已设定的相同指导信号，仍缺乏深入了解。在小鼠成体皮肤中破坏胚胎来源细胞后，追踪单核细胞来源的（m）LCs分化，揭示了表皮内在本质上的异质性，以及MDP-单核细胞被选择绕过指定巨噬细胞命运的基因程序。通过采用一种成体皮肤独有的过程，随后EpCAM+前体细胞经由毛囊Notch配体和芳香烃受体（Ahr）信号传导而发生的外在特化，共同决定了向驻留mLCs的定向分化。
利用独特的人类LC数据集，我们证明了新生儿人类皮肤中胚胎来源的(e)LCs保留了其巨噬细胞起源的转录证据，而在婴儿皮肤中增殖后，这一证据被一种独特的类似DC的免疫模块所取代。因此，成人皮肤中单核细胞的趋同分化利用了新的分子途径，以复制eLC在出生后皮肤中向更具免疫原性的类似DC细胞的 conditioning。总体设计：致死性照射的雄性CD45.2 C57BL/6小鼠接受了雌性CD45.1 C57BL/6骨髓细胞、CD4 T细胞，以及通过尾静脉注射给药的CD8 Matahari (Mh) T细胞。在骨髓移植后3周，使用10X Genomics平台对供体和宿主的CD11b+MHCII+髓系细胞，以及从表皮中通过FACS纯化的CD45-角质形成细胞进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
