脂肪细胞调控成纤维细胞功能及其缺失导致炎症性疾病中成纤维细胞功能障碍
该数据集来自 NCBI BioProject（编号 PRJNA974175），主题为脂肪细胞调控成纤维细胞功能，以及脂肪细胞缺失如何导致炎症性疾病中的成纤维细胞功能障碍
基本信息
资源简介
脂肪细胞调控成纤维细胞功能及其缺失导致炎症性疾病中成纤维细胞功能障碍
PRJNA974175 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物项目数据集，其英文标题为“Adipocytes regulate fibroblast function, and their loss contributes to fibroblast dysfunction in inflammatory diseases”。从标题可以看出，该数据集围绕脂肪细胞与成纤维细胞之间的调控关系展开，重点关注脂肪细胞如何影响成纤维细胞的功能，以及脂肪细胞缺失在炎症性疾病背景下如何导致成纤维细胞功能障碍。该数据集在本站被归类于肌肉骨骼系统疾病 / 其他类别，主题标签为“Phenotype or Genotype”，说明其内容与表型或基因型相关。整体而言，该数据集为研究脂肪细胞与成纤维细胞相互作用、以及炎症性疾病中细胞功能异常的机制提供了生物项目层面的数据组织入口。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，编号为 PRJNA974175。BioProject 是 NCBI 提供的一种生物数据集合形式，用于汇集与某一项单一研究计划相关的生物学数据，这些数据通常来自单一机构或一个联合体。BioProject 记录为用户提供了一个统一的位置，用以查找该项目所产生的多种数据类型之间的链接。该项目的标题明确指向脂肪细胞对成纤维细胞功能的调控作用，以及脂肪细胞缺失与炎症性疾病中成纤维细胞功能障碍之间的关联。这一背景表明，该数据集所对应的研究计划关注的是细胞间相互作用与疾病机制，尤其是脂肪细胞在维持成纤维细胞正常功能中的角色，以及当脂肪细胞缺失时可能引发的病理后果。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Phenotype or Genotype”，表明其数据内容涉及表型或基因型层面的信息。项目标题中提到的核心生物学对象包括脂肪细胞和成纤维细胞，研究焦点在于脂肪细胞对成纤维细胞功能的调控，以及脂肪细胞缺失对成纤维细胞功能障碍的影响，且这一过程与炎症性疾病相关。然而，关于该数据集具体包含哪些类型的数据文件、样本数量、测序平台、基因表达数据、表型测量指标或其他具体数据内容，源站未提供。因此，无法进一步描述其数据组成的具体细节。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，具体以 BioProject 记录的形式呈现，编号为 PRJNA974175。BioProject 记录本身并不直接包含所有原始数据，而是提供指向该项目所生成的各种数据类型的链接。该项目的发起机构、样本采集方式、实验设计、采集地点、时间范围等具体信息，源站未提供。因此，关于数据采集的具体流程和方法学细节，无法从现有信息中获知。
【适用场景】
基于该数据集的标题和主题标签，其适用场景可能包括：研究脂肪细胞与成纤维细胞之间相互作用的机制；探讨脂肪细胞缺失在炎症性疾病中对成纤维细胞功能的影响；以及从表型或基因型角度分析与该调控过程相关的生物学特征。该数据集属于肌肉骨骼系统疾病 / 其他分类，可能适用于与肌肉骨骼系统相关的炎症性疾病研究。然而，由于源站未提供具体的数据类型和实验细节，无法进一步明确其适用的具体分析场景或研究问题。
【使用方法】
该数据集以 NCBI BioProject 记录的形式提供，用户可以通过 BioProject 编号 PRJNA974175 在 NCBI 网站上访问该记录，并通过记录中提供的链接查找该项目所生成的各种数据类型。BioProject 的设计目的是为用户提供一个单一入口，以便发现和访问与某一研究计划相关的多样化数据。关于如何具体下载、处理或分析该数据集中的原始数据，源站未提供。因此，无法给出针对该数据集的具体使用步骤或分析建议。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject，属于公共生物数据资源。BioProject 记录本身提供的是项目层面的元数据和数据链接，而非经过统一质量控制的数据集合。关于该数据集的具体质量指标、数据完整性、可能的偏差或限制，源站未提供。此外，由于缺乏样本量、实验方法、数据生成平台等具体信息，无法对该数据集的质量进行进一步评估。用户在使用时应参考源站记录中链接的原始数据及其相关说明。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库的一部分。关于该数据集的具体引用方式、许可协议、使用条款或数据共享政策，源站未提供。用户在使用该数据集时，应遵循 NCBI 网站的一般使用条款，并参考 BioProject 记录中可能提供的引用信息。由于源站未提供具体的许可细节，无法在此进一步说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA974175
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们采用单细胞RNA测序技术，对来自16名未确诊关节炎个体的活体滑膜细胞进行了分析。本研究旨在为有兴趣研究关节炎滑膜的研究人员提供一个参考性的单细胞RNA测序数据集，提供健康滑膜细胞的测序数据，以便与病变滑膜组织的细胞进行对比。滑膜组织是在2019年至2021年间，从三个不同来源的遗体上采集的：国家疾病研究交流中心、与拉什大学和希望之礼的合作项目，以及布莱根妇女医院病理科。纳入本研究的患者年龄需在18至72岁之间，且未确诊患有关节炎或自身免疫性疾病。此外，本研究还包括批量RNA测序……（更多内容请参见dbGaP研究页面。）
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
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