MYH9-iPSCs基因组校正逆转细胞骨架包涵体并恢复血小板生成

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1417814

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究利用靶向基因组编辑技术探究MYH9相关疾病(MYH9-RD)的病理生理机制。我们采用Illumina MiSeq平台进行深度测序，以验证CRISPR/Cas9介导的患者来源诱导多能干细胞(iPSCs)中MYH9突变的校正效果。该数据集包含来自三个不同同源细胞系的高覆盖度测序结果：1. 亲本细胞系(MUi010-A)：携带杂合MYH9突变的患者来源iPSCs。2. 校正细胞系(H9、H10、D10)：经基因组编辑将MYH9突变恢复为野生型的同源iPSCs。3. 对照细胞系(MUi028-A)：用于基线基因组比较的健康正常对照iPSC系。分析重点在于确认目标位点的精确校正，并评估是否存在非预期的靶向插入缺失，以确保用于研究NMMHC-IIA聚集和血小板生成的同源模型的完整性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。