MH7A滑膜成纤维细胞Dex与Dex+plexo处理的RNA-seq
该数据集来自NCBI，为MH7A人滑膜成纤维细胞的RNA-seq原始测序读段。研究比较单独使用地塞米松（Dex）与Dex联合plexo处理后的转录组变化，测序在Illumina NovaSeq X Plus平台完成，并识别两组间的差异表达基因，开展GO和KEGG功能富集分析
基本信息
资源简介
MH7A滑膜成纤维细胞Dex与Dex+plexo处理的RNA-seq
该数据集来自NCBI，为MH7A人滑膜成纤维细胞的RNA-seq原始测序读段。研究比较单独使用地塞米松（Dex）与Dex联合plexo处理后的转录组变化，测序在Illumina NovaSeq X Plus平台完成，并识别两组间的差异表达基因，开展GO和KEGG功能富集分析。数据可用于探索plexo与Dex在滑膜成纤维细胞中的协同或叠加效应，以及类风湿关节炎相关分子通路研究（来源 ncbi.nlm.nih.gov）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本研究旨在比较单独使用地塞米松（Dex）与Dex联合plexo处理的人类风湿关节炎滑膜成纤维细胞MH7A的转录组变化。MH7A细胞在相同条件下培养并接受Dex或Dex+plexo处理。提取总RNA，制备RNA测序（RNA-seq）文库，并在Illumina NovaSeq X Plus平台上测序。识别两组之间的差异表达基因（DEGs），随后进行功能富集分析（GO和KEGG），以探索在Dex治疗中加入plexo所影响的分子通路。该数据集为plexo与Dex在滑膜成纤维细胞中的潜在协同或叠加效应提供了转录组学见解。
【主题与分类】
主题标签：Raw sequence reads。本站分类：肌肉骨骼系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1542084
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1542084
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在比较单独使用地塞米松（Dex）与地塞米松联合plexo处理人类风湿关节炎滑膜成纤维细胞MH7A后的转录组变化。在相同条件下培养MH7A细胞，并分别以Dex或Dex+plexo处理。提取总RNA，构建RNA测序（RNA-seq）文库，并在Illumina NovaSeq X Plus平台上进行测序。鉴定两组间的差异表达基因（DEGs），随后进行功能富集分析（GO和KEGG），以探究在Dex处理基础上加入plexo所影响的分子通路。该数据集为plexo与Dex在滑膜成纤维细胞中潜在的协同或叠加效应提供了转录组学见解。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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