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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1484 个数据集

医学影像CT医学图像分割队列研究公共卫生与流行病学

Low-Dose CT Images of Healthy Cohort (Healthy-Total-Body-CTs) — UC Davis uEXPLORER 30 名健康成人全身低剂量 CT 与 37 组织分割参考库

影像数据分割掩码原始数据元数据30 名健康成人（14 男 / 16 女；年龄 47 ± 13 岁）；135 studies / 111,778 图像

TCIA 受控访问集合：30 名健康志愿者在 uEXPLORER 全身 PET/CT 上采集 111,778 张低剂量 CT 图像（59.06GB），配 37 组织 NIfTI 自动分割与人口学表；三次版本迭代打磨元数据与文件命名，图像受限、分割与临床数据 CC BY 4.0

TCIA 集合 Healthy-Total-Body-CTs：uEXPLORER 全身 PET/CT 采集的 30 名健康志愿者低剂量 CT（DICOM，512×512×828 重建、0.9766×0.9766×2.344 mm³ 体素，90 分钟点 50 mAs / 其余点 5 mAs）+ 37 组织 NIfTI 分割（MOOSE 自动生成）+ 人口学 XLSX。明细见正文附录。 40

电子健康记录调查数据队列研究公共卫生与流行病学生理信号

Sex differences in age-related hearing loss — 韩国人群纯音听阈性别与年龄参考值

真实世界数据结构化数据原始数据4,084 名受试者（910 男 + 3,174 女）；注册完成听力问卷者 16,884 名（10,286 男 + 6,598 女）

韩国大邱法蒂玛医院 4,084 名健康筛查受检者的双耳六频段纯音听阈横断面数据——910 男 3,174 女，覆盖 0.25-8 kHz、Beltone 112 听力计 ANSI 1989 校准，用于建立年龄相关听力损失（presbycusis）的性别与年龄分层参考值

韩国大邱法蒂玛医院（Daegu Fatima Hospital）健康促进中心 2004-01 至 2010-04 就诊客户的双耳六频段纯音听阈（0.25/0.5/1/2/4/8 kHz，dB HL），单文件 hearing_thresholds.csv，14 列（性别、年龄、右耳 6 频、左耳 6 频） 41

电子健康记录临床电子病历队列研究时序数据调查数据

Supportive Periodontal Therapy Clinical Examination Data — 伯恩 883 患者 11,842 次牙周维护治疗的 26 年纵向临床检查记录

临床记录原始数据表格数据883 名牙周维护治疗（SPT）患者（女 489 / 男 394）；11,842 次 SPT 复诊；单中心 1985–2011（26 年）

瑞士伯恩 Medi School of Dental Hygiene 在 1985–2011 年间对 883 名牙周维护治疗（SPT）患者的 11,842 次复诊做常规临床检查所得的纵向结构化记录：逐诊记录现存牙数、探诊出血位点、各残余探诊深度区间位点数与距上次就诊时间，支撑一套在用 SPT 复诊间隔算法的推导与验证，CC BY 4.0 于 PhysioNet 首版公开

瑞士伯恩 Medi School of Dental Hygiene（MSDH）1985–2011 年 SPT 常规诊疗临床记录：4 个 RFC 4180 CSV（患者级 883×22 / 就诊级 11,842×15 / 派生级 11,842×44 / 人工编辑台账 63×12）+ 93 变量字典 + 3 对 R/Python 分析脚本，PhysioNet 公开托管，DOI 10.13026/cn9b-2632 35

医学影像病理图像多模态队列研究肿瘤学

CMB-AML — 癌症登月生物样本库急性髓系白血病影像集合

影像数据临床数据纵向随访原始数据16 受试（v9 集合级口径；放射 9 + 4 分片受试、病理受试合计后为 16）；Cancer Moonshot Biobank 项目级目标为 ≥1,000 名患者 / ≥10 个癌种

NCI Cancer Moonshot Biobank 的 AML 队列影像子集：放射部分 CC BY 4.0 公开、病理全切片 445GB 走 NIH 受控申请的双许可结构，DICOM tag (0012,0053) 内嵌「注册天数」把影像与临床事件对齐，Version 9 共 16 受试 / 52 studies / 2,868 张放射影像 / 448.08GB

TCIA 托管的 Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection（Version 9，2026/07/02 更新）：放射模态 XA/MR/CT/PT（DICOM, CC BY 4.0）+ 组织病理/全切片 Histopathology/WSI（JSON/SVS, NIH 受控）；配套基因组/表型/临床数据托管于 dbGaP，临床子集镜像于 CTDC，影像镜像于 IDC 37

医学影像CT医学图像分割评测基准

CT4Harmonization Multicentric Phantom — 多中心 3D 打印 CT 体模基准：跨厂商扫描仪协调与影像组学特征可复现性验证

影像数据人工标注基准数据0 名患者（体模数据集；IDC 记 Subjects=1，实为 1 具物理体模 phantom，非人体受试者）

瑞士 8 家中心、13 台 CT 扫描仪、4 家厂商在 5 档剂量下重复扫描同一具 3D 打印碘墨水肝脏体模的 1,378 个序列（649 次 CT 扫描、252.38 GB、CC BY 4.0）：它不含任何患者，却是所有跨中心影像组学模型与 CT 协调（harmonization）方法的受控标定物

瑞士 8 家中心 13 台 CT 扫描仪（Siemens 6 / Philips 2 / GE 3 / Toshiba 2）对同一具 3D 打印碘墨水纸基拟人肝体模的重复扫描：649 次 CT 扫描 × 最多 3 种重建（FBP/IR/DL）= 1,378 个 DICOM 序列（CT + SEG），5 档剂量 1/3/6/10/14 mGy，含肝脏 6 ROI/4 类组织真值分割掩码，共 252.38 GB 34

电子健康记录重症监护时序数据挑战赛数据集评测基准队列研究

MIT Critical Datathon 2023 — MIMIC-IV 派生脉搏血氧校正配对数据集

时序数据真实世界数据派生数据81,797 条 ICU SaO2-SpO2 配对（唯一患者/stay 数未披露；上游 MIMIC-IV v2.2 覆盖 50,920 名唯一患者，2008-2019）

2023 年 MIT Critical Datathon 竞赛配套的 SaO2-SpO2 配对数据集：从 MIMIC-IV v2.2 派生 81,797 条 ICU 配对，90 分钟窗口配对+138 变量+隐藏低氧血症规则标签，PhysioNet 凭据访问，是后续 BOLD 三库整合版的前身

MIMIC-IV v2.2 派生：ICU chartevents 中 SaO2（itemid 220227）与前 90 分钟内最近 SpO2（itemid 220277）配对，附 138 变量（人口学/SOFA 六系统/通气 FiO2/RRT/血管升压药/血常规凝血化学/生命体征）与 hidden_hypoxemia 规则标签 37

电子健康记录重症监护真实世界数据队列研究公共卫生与流行病学

BOLD, a blood-gas and oximetry linked dataset — 整合 MIMIC-III/IV 与 eICU 三库的脉搏血氧-动脉血气配对联数据集

真实世界数据时序数据原始数据44,907 名患者（49,099 对 SpO2–SaO2 测量：MIMIC-IV 4,921 对/4,778 患者；MIMIC-III 740 对/728 患者；eICU-CRD 43,438 对/

把三个 ICU 电子健康记录库里的脉搏血氧（SpO2）与动脉血气（SaO2）配对成 49,099 条 5 分钟窗口测量——聚焦血氧仪在深肤色人群中的系统性高估，为血氧仪去偏算法提供分析就绪的公平性数据基座

MIMIC-III（BIDMC 单中心）+ MIMIC-IV（BIDMC）+ eICU-CRD（美国多中心）三库 ICU 电子健康记录，经时间对齐与概念协调后横向拼接 31

医学图像分割病理图像评测基准肿瘤学多模态

PathSeg — 21 源汇编的 27.5 万级病理语义分割基准

影像数据人工标注开源数据未披露患者级计数；由 21 个公开病理分割数据集汇编，共 275,200 组 image–mask–label 三元组（160 层级标签；源数据集各自含其原始病例数）

从 21 个公开病理分割数据集协调出 275,200 组 image–mask–label 三元组、20 解剖区域×3 组织层级×61 对象类型共 160 层级标签；配套文本提示基础模型 PathSegmentor（FocalNet+PubMedBERT，450M）整体 Dice 0.671，超 BiomedParse 0.429

21 个公开病理图像分割数据集的协调汇编：BCSS、CoCaHis、CoNIC2022、CRAG、DigestPath2019、GlaS、Janowczyk、MIDOG、MoNuSAC、NuCLS、PanNuke、RINGS、SegPath、SICAPv2、TNBC、WSSS4LUAD、CoNSeP、CPM15、CPM17、Kumar、Lizard——统一为 40× WSI 裁 1024×1024 patch + 同尺寸二值掩码 + 层级标签三元组 34

医学影像眼科影像皮肤影像挑战赛数据集评测基准医学图像分割

SynthOCT 2026 — 皮肤 OCT 数字体模逆物理合成挑战赛

影像数据原始数据合成数据120 张体内人皮肤 OCT B-scan（男/女 × 两个年龄段 × 两个解剖部位的分层子集；原始 3D OCT 队列规模未披露）；参赛 12 队注册、6 队提交终稿

MICCAI 2026 / SASHIMI 2026 卫星赛事：参赛者不讲故事、不炫视觉，而是从 120 张体内人皮肤 OCT B-scan 反推光学散射体的三维空间分布，经固定物理虚拟扫描仪前向渲染出合成扫描，再用 OAC 光学衰减系数与散斑统计双轴物理一致性评分

Zenodo 记录 18095266（DATASET.zip，38.2 MB，含 .npy 对数幅度 + .png 预览，256×512 uint8，~51 dB 动态范围）+ SynthOCT 官方 GitHub Baseline 仓库 + MICCAI 2026 论文集挑战赛综述 37

医学影像病理图像医学图像分割评测基准乳腺癌肿瘤学

SiNuS — 首个公开的单核分割数据集：Dual-ISH 乳腺癌 HER2 分级

人工标注影像数据原始数据21 例乳腺癌患者（10 HER2-negative + 11 HER2-positive）；组织块 21 个；图像块 39 张

面向 ASCO/CAP HER2 分级的 Dual-ISH 乳腺癌单核（singular nuclei）分割数据集——39 张 1600×1200 图块、1856 个 inclusive 与 1284 个 exclusive 单核、三位专家独立标注，配二值/多色/NB 三类掩码与 GitHub 代码，CC BY 4.0 公开直链

Dual-ISH（双色原位杂交）染色的乳腺癌组织切片数字图像：Carl Zeiss AxioImager Z2 扫描、20× 放大（NA 0.80）、0.325 μm/pixel，39 张 1600×1200 像素 RGB 图块，含三专家独立勾边的单核 JSON 坐标、二值/多色/核边界三类掩码、逐图核形态学 CSV（area/perimeter/solidity/circularity） 34

CT医学图像分割图像分类肿瘤学评测基准

RCC-AID — TCGA 肾细胞癌 CT 体素级分割标注开源数据集

人工标注影像数据原始数据129 例 CT / 91 患者（v2.0.0；85 clear cell + 26 papillary + 18 chromophobe；v1.0.0 旧口径为 142 CT / 101 患者）

为 TCGA 三大肾癌队列（KIRC/KIRP/KICH）补齐公开病灶标注的 CT 分割数据集——自动分割初标+学生质检+放射科医师复核，Zenodo CC BY-4.0 直链开源，v2.0.0 修复静默转换失败后保留 129 例 91 患者

TCGA-RCC 三队列（TCGA-KIRC 透明细胞 / TCGA-KIRP 乳头状 / TCGA-KICH 嫌色细胞）经 TCIA 提供的增强 CT（DICOM 转换 NIfTI），配体素级分割掩码（0 背景 / 1 肾脏 / 2 肿瘤 / 3 囊肿）+ 病例级 metadata.csv + TCIA manifest 42

电子健康记录重症监护时序数据评测基准真实世界数据

Clinical Time Series Datasets for Trajectory Flow Matching Evaluation: ICU Sepsis, ICU Cardiac Arrest, and ICU GIB Cohorts — TFM 论文配套 ICU 血流动力学轨迹评测三队列

派生队列时序数据表格数据凭证访问三队列合计 70,553 名成人 ICU 患者：ICU Sepsis 3,362（2,689/336/337）+ ICU Cardiac Arrest 64,589（51,671/6,459/6,45

PhysioNet 凭证访问资源 v1.0.0——由 eICU CRD v2.0 与 MIMIC-III v1.4 派生的三组不规则采样 ICU 血流动力学轨迹队列（入监护室前 24 小时心率-血压完整配对），NeurIPS 2024 Spotlight 论文 TFM 官方评测集，0.8/0.1/0.1 固定划分，代码 MIT 开源

eICU Collaborative Research Database v2.0（ICU Sepsis、ICU Cardiac Arrest）与 MIMIC-III v1.4（ICU GIB）派生：入 ICU 前 24 小时心率-血压完整配对轨迹（z-score 标准化、时间轴归一化 [0,1]）+ 静态/动态条件变量（APACHE-IV 概率、去甲肾上腺素输注、CART 变量、血管活性药与血制品使用）+ ICU_MORT/HOSP_MORT 结局标签，三个 CSV 文件发放 39

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