CMB-AML — 癌症登月生物样本库急性髓系白血病影像集合

NCI Cancer Moonshot Biobank 的 AML 队列影像子集:放射部分 CC BY 4.0 公开、病理全切片 445GB 走 NIH 受控申请的双许可结构,DICOM tag (0012,0053) 内嵌「注册天数」把影像与临床事件对齐,Version 9 共 16 受试 / 52 studies / 2,868 张放射影像 / 448.08GB

来源 TCIA 托管的 Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection(Version 9,2026/07/02 更新):放射模态 XA/MR/CT/PT(DICOM, CC BY 4.0)+ 组织病理/全切片 Histopathology/WSI(JSON/SVS, NIH 受控);配套基因组/表型/临床数据托管于 dbGaP,临床子集镜像于 CTDC,影像镜像于 IDC发布时间: 2026-10-09最后更新: 2026-10-20 阅读 36
CMB-AML — 癌症登月生物样本库急性髓系白血病影像集合

信息速览

数据集名称CMB-AML — 癌症登月生物样本库急性髓系白血病影像集合
数据类型影像数据,临床数据,纵向随访,原始数据
规模16 受试(v9 集合级口径;放射 9 + 4 分片受试、病理受试合计后为 16);Cancer Moonshot Biobank 项目级目标为 ≥1,000 名患者 / ≥10 个癌种
接入方式TCIA 托管的 Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection(Version 9,2026/07/02 更新):放射模态 XA/MR/CT/PT(DICOM, CC BY 4.0)+ 组织病理/全切片 Histopathology/WSI(JSON/SVS, NIH 受控);配套基因组/表型/临床数据托管于 dbGaP,临床子集镜像于 CTDC,影像镜像于 IDC
AI 就绪度

INFOBOX — CMB-AML 一屏速览

维度 内容
本质 NCI Cancer Moonshot Biobank 项目 AML 队列的 TCIA 影像子集(非独立项目、非挑战赛)
官方名 CMB-AML | Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection
DOI 10.7937/PCTE-6M66
托管 The Cancer Imaging Archive (TCIA);配套数据在 dbGaP / IDC / CTDC
当前版 Version 9,更新 2026/07/02(Status: Public / Ongoing)
规模(v9) 16 受试 / 52 studies / 2,868 张放射影像;数据总量 448.08GB
模态 Histopathology, Whole Slide Image, XA, MR, CT, PT
许可 双许可:放射 CC BY 4.0(公开 1.59GB)|病理全切片 NIH Controlled Data Access Policy(受控 445GB)
关键机制 DICOM tag (0012,0053) 内嵌 “days from enrollment”,影像↔临床事件时间对齐
版本链 v1 2023/10/19 → v2 2024/03/04 → v3 2024/08/04 → v4 2024/08/28 → v5 2024/12/17 → v6 2025/05/09 → v7 2025/10/10 → v8 2026/05/29 → v9 2026/07/02
同族系列 CMB-AML / CMB-BRCA / CMB-CRC / CMB-GEC(四癌种,均 2026/07/02 更新)
库内互链 aml-cytomorphology(rid 906,AML 疾病域)、nct-crc-he-100k(rid 148,CMB-CRC 相近)、cmb-cmexam(rid 180,同名异义,勿混)
一句话 「一份生物样本库计划里最小的那一格:影像公开、病理上锁,用注册天数把两端对齐。」

CMB-AML 是一个"大计划里的小切片"。它的母体是 NCI(美国国家癌症研究所)的 Cancer Moonshot Biobank——一个目标覆盖至少 1,000 名患者、至少 10 个癌种、在多个 NCORP 社区肿瘤站点纵向采集生物样本与临床数据的宏大计划。而 CMB-AML 只是这个计划里 急性髓系白血病(AML) 那一个癌种的影像子集:Version 9 更新时,它装着 16 名受试、52 个 studies、2,868 张放射影像,总量 448.08GB。

它的两点独特之处值得先说清楚。第一,它是双许可的:你可能以为 448GB 都能直接下载,但其中 445GB 是组织病理全切片(WSI),走 NIH Controlled Data Access Policy 受控申请;真正 CC BY 4.0 公开可直取的放射部分只有 1.59GB。第二,它藏着一根"时间针":每条放射扫描的 DICOM 文件里都写着一个 tag (0012,0053)——days from enrollment(注册天数),正是这根针把 TCIA 上的影像与 Biobank Catalog 里的临床事件缝在同一根时间轴上,让"治疗前影像 vs 治疗后复发"这类纵向问题第一次有了可计算的对齐基准。

导语读法三则:

  1. 只想下数据:直奔 §6 获取与许可——先分清你要的是放射(公开)还是病理(受控),两者的门完全不同。
  2. 关心时间对齐机制:直奔 §5 与 §7——DICOM (0012,0053)、注册天数、Biobank Catalog 三段连读。
  3. 担心撞名:直奔 §9——CMB-AML 的 “CMB” 与库内 cmb-cmexam 的 “CMB” 不是一回事,读错会彻底走偏。

§0 导读:这个数据集解决什么问题

要理解 CMB-AML,先要理解它不是一个孤立发布的影像集,而是一个生物样本库计划的影像外设。Cancer Moonshot Biobank 的立意(S1 原文)是支持"对耐药性与敏感性的当下与未来研究",以及 NCI 资助的其他癌症研究,目标是加深研究者对癌症的理解、并干预癌症的发生与进展。为实现这点,项目在患者接受标准治疗的过程中纵向采集生物样本(医疗操作中取出的血液与组织)与关联数据,样本规模目标为至少 1,000 名患者、至少 10 个癌种,采集地点分布在多个 NCI Community Oncology Research Program(NCORP) 站点。

生物样本库的经典难题是"样本有了,但影像散落在别处"。CMB 的解法是把影像单独托管到 TCIA,并按癌种拆成集合。CMB-AML 就是 AML 这一格。它收录从 CMB-AML 队列受试者处获取的去标识化放射与组织病理影像;而配套的基因组、表型与临床数据则由 dbGaP 及其他 NCI 数据库托管(S1 原文)。

这样一来,就形成了 CMB-AML 最鲜明的两个工程特征:

特征一:数据被许可切成两半。 放射影像(XA/MR/CT/PT)走 CC BY 4.0,公开可下;组织病理与全切片影像走 NIH Controlled Data Access Policy,必须受控申请。这不是疏漏,而是病理切片更敏感、体积更大(445GB)的现实所决定的——公开的一半教你"看到什么",受控的一半才让你"看清细胞"。

特征二:时间对齐靠一个 DICOM tag。 生物样本库的影像若不与临床事件对齐,就只是孤立的图。CMB 的做法是在每份放射影像的 DICOM 里嵌入 tag (0012,0053) = days from enrollment——从入组日算起的天数。于是"第 45 天的 CT"与"第 45 天的用药记录"就能在 Biobank Catalog 里对上(S1 Introduction)。同时,为了让影像能在 DICOM 阅读器中正常显示,放射数据还保留了去标识化但保序的日期,使同一 study 内扫描之间的时间先后关系不丢失。

§0 读法三则:

  1. 这是"项目级(Biobank)+ 集合级(TCIA 目录)"双层结构:1,000 患者 / 10+ 癌种是项目目标,16 受试才是 CMB-AML 单集合的规模,任何把两者混用的表述都会夸大本条目。
  2. 全部数字标注到版本:本条目以 Version 9(2026/07/02) 为准;早期版本的受试/影像数差异已在 §4 与附录逐条存照。
  3. 检索这个数据集时,别用裸词 “CMB”——它会同时命中 Cancer Moonshot Biobank(本条目)与中文医疗评测基准 CMB/CMExam(库内 rid 180),两者的正确全称才唯一(§9)。

§1 数据集速览:十问十答

Q1:CMB-AML 的全名到底是什么?
官方全名为 CMB-AML | Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection(S1 页标题原文)。短名 CMB-AML 直接来自 TCIA 集合 URL。引用时使用 “Cancer Moonshot Biobank – Acute Myeloid Leukemia (CMB-AML)” 的写法(§6)。

Q2:它是谁做的?
主体是 National Cancer Institute(NCI) 主导的 Cancer Moonshot Biobank 项目;采集在多个 NCORP 站点进行;影像由 The Cancer Imaging Archive(TCIA) 托管;配套基因组/表型/临床数据托管于 dbGaP,影像镜像于 IDC,临床子集镜像于 CTDC(S1)。

Q3:规模有多大?
以当前 Version 9(2026/07/02) 计:16 受试 / 52 studies / 2,868 张放射影像;数据总量 448.08GB(S1 页顶汇总欄)。注意 16 是集合级去重受试数,放射与病理分片各有其子集。

Q4:都有什么模态?
汇总栏列出 Histopathology、Whole Slide Image、XA、MR、CT、PT 六类。其中放射部分可细分为两组:一组 XA/MR/CT(公开,CC BY 4.0),另一组 CT/MR/PT(其中头部影像标注 Restricted License,见 §6);组织病理/WSI 属受控部分(S1)。

Q5:许可为什么分成两半?
因为数据类型不同、敏感性与体量不同:放射影像走 CC BY 4.0 公开;组织病理全切片(445GB)走 NIH Controlled Data Access Policy,需受控申请(S1)。这不是临时设置,而是贯穿全版本链的稳定结构。

Q6:那个 “days from enrollment” 是什么?
是嵌在放射 DICOM 文件里的 tag (0012,0053),值是从入组(注册)日算起的天数。它让 TCIA 影像能与 Biobank Catalog 中的临床事件在时间上对齐(S1 Introduction)。这是 CMB 系列区别于普通影像集的关键设计。

Q7:版本更新有多频繁?
非常频繁且完整:从 v1(2023/10/19)到 v9(2026/07/02)共 9 个版本,平均每数月一次,每次多为"新增患者/切片"或"方法论调整(如 v3 的 ID 去前缀与 UID 哈希)"(S1 全版本表,详见 §4.3)。

Q8:CMB-AML 和别的 CMB 集合什么关系?
它们同属 Cancer Moonshot Biobank 项目,按癌种拆分:CMB-AML(白血病)、CMB-BRCA(乳腺)、CMB-CRC(结直肠)、CMB-GEC(胃食管) 四者均在 2026/07/02 更新,结构、许可与对齐机制一致(S2)。

Q9:库内有没有和它撞名的条目?
有,但不是同族:库内 cmb-cmexam(rid 180)的 “CMB” 指 Chinese Medical Benchmark(中文医疗评测基准),与本条目的 Cancer Moonshot Biobank 毫无关系(§9)。真同族是 TCIA 上的 CMB-BRCA/CRC/GEC(库内暂无)。

Q10:它适合我做什么?
适合:AML 影像-临床纵向对齐研究、多模态肿瘤影像建模、跨癌种生物样本库数据结构研究、WSI 与放射联合分析(需先取得受控病理数据)。不适合:把它当单一癌种的大规模训练主力(仅 16 受试,§9)。

§2 数据构成与规格

2.1 集合级构成:一句话拆成三层

CMB-AML 在 TCIA 上是一个 “Image Collection”(影像集合),其内部其实由许可不同的三层拼成。理解这三层,是理解本条目一切数字的前提:

层 内容 模态/格式 许可 体量(v9)
层 A:公开放射 主要放射影像 XA, MR, CT(DICOM) CC BY 4.0 下载 1.59GB
层 B:受限头部分片 头部相关放射 CT, MR, PT(DICOM) NIH Controlled(头部影像见 Restricted License) 下载 1.49GB
层 C:受控病理 组织病理 + 全切片 Histopathology, WSI(JSON/SVS) NIH Controlled Data Access Policy 下载 445GB

(数字均来自 S1 的 Version 9 数据访问表。)

这里有个容易被忽略的细节:放射部分本身也并非全部公开。v9 表把放射拆成两行,第一行 1.59GB 标 CC BY 4.0,第二行 1.49GB 标注了受限头部影像(View Images of the head (see Restricted License))。也就是说,“放射=公开"是一个近似说法,严格说是"放射中的主体公开,头部相关分片受限”。写论文引用时若不查证,很容易把头部影像误当公开数据。

2.2 受试数与子集口径

页顶汇总欄给出 Subjects = 16。但把 v9 表逐行拆开,会看到不同子集的受试数是分开列的:公开放射分片 9 受试、受限放射分片 4 受试、病理分片另计。16 是集合级去重后的口径——同一位受试可能在放射与病理部分都有数据,因此各分片受试数之和(9+4+病理)会大于 16。这一"分片 vs 集合"的双口径在 §4.4 与附录 S 有专门登记表。

2.3 模态与格式

  • 放射模态:XA(X 光血管造影)、MR(磁共振)、CT(计算机断层)、PT(PET 正电子发射断层)。覆盖了从形态学到代谢的多层次成像。
  • 病理模态:Histopathology(组织病理)与 Whole Slide Image(全切片图像)。
  • 格式:放射为 DICOM;病理为 JSON + SVS(SVS 是 Aperio 系全切片格式)。
  • 下载工具:放射需 TCIA Data Retriever;病理需 IBM-Aspera-Connect plugin(S1)。工具不同,是判断"你正在下的是哪一层"的实用标志。

2.4 时间元数据:藏在 DICOM 里的对齐针

CMB-AML 最有价值的规格不在图像分辨率,而在一个元数据 tag:

  • DICOM tag (0012,0053) 内嵌 “days from enrollment (registration)”——从入组日算起的天数(S1 Introduction)。
  • 作用:让 TCIA 上的影像与 Biobank Catalog 里的临床事件数据在时间上对齐。
  • 补充机制:为了让影像在 DICOM 阅读器中正常显示,放射数据还保留了去标识化但保序的日期,确保同一 study 内扫描的先后关系不丢(S1 Note)。

这意味着研究者可以问出"第 N 天的影像对应哪次治疗/哪次复发"这类问题——而普通影像集只能给出一个孤立的采集时刻。

2.5 生物样本与配套数据的分工

CMB-AML 是"影像抽屉",不是"全数据抽屉"。完整拼图需要四处:

  • TCIA(本条目):去标识化影像。
  • dbGaP:基因组、表型与完整临床数据(受控访问)。
  • CTDC(Cancer Moonshot Biobank):临床数据子集(开放访问)。
  • IDC(Imaging Data Commons):影像(镜像/互通)。

(S1 External Resources 原文列出前三条,IDC/CRDC 作为更大基础设施。)

§3 CMB 项目与四癌种系列:家族图谱

3.1 母体:Cancer Moonshot Biobank

Cancer Moonshot Biobank 是 NCI 倡议,其定位(S1 原文)是"支持对耐药性与敏感性的当下与未来研究以及其他 NCI 资助的癌症研究",目标是增进研究者对癌症的理解、并干预癌症的发生与进展。执行方式:在患者接受标准治疗的过程中,纵向采集生物样本(血液 + 组织)与关联数据。规模目标:至少 1,000 名患者 / 至少 10 个癌种;地点:多个 NCORP 社区肿瘤站点。

这里必须强调一个口径纪律:1,000 患者 / 10+ 癌种是项目级目标,涵盖整个 Biobank;CMB-AML 只是其中 AML 一个癌种的影像子集,规模是 16 受试。把项目数字安到集合头上是常见错误(§8 坑 2)。

3.2 CMB 四癌种系列(TCIA 实测)

截至 2026/07/02,TCIA 上共有四个 CMB 影像集合(S2 集合总表):

TCIA 集合 癌种(英文) 癌种(中文) 受试 模态 状态/更新
CMB-AML Acute Myeloid Leukemia 急性髓系白血病 16 Histopathology, WSI, XA, MR, CT, PT Public / Ongoing, 2026/07/02
CMB-BRCA Breast Invasive Carcinoma 乳腺浸润性癌 101 Histopathology, WSI, MR, CT, MG, US, PT Public / Ongoing, 2026/07/02
CMB-CRC Colorectal Cancer 结直肠癌 102 Histopathology, WSI, MR, CT, PT, US, NM, DX, XA Public / Ongoing, 2026/07/02
CMB-GEC Gastroesophageal Cancer 胃食管癌 27 CT, MR, PT, Histopathology, WSI Public / Ongoing, 2026/07/02

四点观察:

  1. 同一时间更新:四个集合均在 2026/07/02 更新,说明 Biobank 影像是统一发布节奏。
  2. 结构同构:四者都含 Histopathology + WSI + 放射模态,共享"双许可 + 注册天数对齐"的设计。
  3. 规模梯度:BRCA(101)与 CRC(102)是主力,GEC(27)次之,AML(16)最小——这与各癌种在 Biobank 中的入组分布相关。
  4. 模态丰度差异:CMB-CRC 的模态最多(含 NM 核医学、DX 数字摄影),CMB-GEC 以 CT/MR/PT 为主。

3.3 与库内同类项目的坐标系

CMB-AML 在千方库内属于"大型国家计划 + 多癌种生物样本库影像"这一族。可与以下类型互照:

  • AML 疾病域:aml-cytomorphology(rid 906)——同为 AML,但那是慕尼黑单细胞形态图像(cytomorphology,细胞形态学涂片),CMB-AML 是临床多模态影像(放射+病理)。两者是 AML 数据的两端:一端是细胞,一端是患者。
  • 结直肠癌病理域:nct-crc-he-100k(rid 148)——可与 CMB-CRC 形成"同癌种、不同设计"对照(NCT-CRC 是 10 万张结直肠癌 H&E patch,CMB-CRC 是 102 受试的临床纵向影像)。
  • 假同族:cmb-cmexam(rid 180)不属于本族(C=Chinese Medical Benchmark),仅作检索歧义警示(§9)。

§4 规模与版本链:448.08GB 是怎么长出来的

4.1 当前版硬数字(Version 9 × 2026/07/02)

  • 受试:16
  • Studies:52
  • Images(放射):2,868
  • 数据总量:448.08GB
  • 模态:Histopathology, Whole Slide Image, XA, MR, CT, PT
  • 地点:Blood;物种:Human
  • 数据类别:Acute Myeloid Leukemia
  • 状态:Public / Ongoing
  • Views:12.8k

(以上为 S1 页顶汇总欄与 v9 访问表的直取数字。)

4.2 448.08GB 的内部配比

总量 448.08GB 中,445GB 是受控病理切片,公开放射仅 1.59GB(外加 1.49GB 受限头部放射)。换句话说:

  • 病理部分占总量 约 99.3%;
  • 公开可下的放射部分仅占 约 0.35%。

这个极端配比正是"双许可"存在的物质基础:体量最大的那部分恰恰是最敏感、最需要受控的。它也给"我以为能直接下 448GB"的使用者一个直接提醒(§8 坑 1)。

4.3 全版本链(S1 逐版实测)

版本 更新日期 版本说明与计数变化
v1 2023/10/19 首发。放射 1 受试 / 2 studies / 6 series / 339 images(XA, CT);病理 1 受试 / 3 slides
v2 2024/03/04 追加既有患者数据。放射 1/5/15/687;病理 1/3/15/995
v3 2024/08/04 放射 Patient ID 去前缀(CMB-AML-MSB-##### → MSB-#####);study/series/SOP/referenced SOP UID 全部哈希化;计数与 v2 同(1/5/15/687;1/3/15/995)
v4 2024/08/28 Additional data。放射 4 受试 / 11 / 38 / 2,722;病理 4/10/65/3,704
v5 2024/12/17 追加既有患者 5 张病理切片。放射 4/11/38/2,722;病理 4/10/65/3,704
v6 2025/05/09 5 新放射患者 + 既有补数据;2 新病理患者 + 5 新切片。放射 8/15/49/2,825;病理 5/11/69/4,980
v7 2025/10/10 5 新组织病理患者 + 8 新组织病理切片。放射 8/15/49/2,825;病理 5/11/69/4,980
v8 2026/05/29 Updated Restricted imaging portion(更新受限影像部分)。放射 8/15/49/2,825;病理 4/10/65/3,704
v9 2026/07/02 当前版。1 新放射患者 + 既有 2 病理患者追加(5 新切片)。放射合计 9 + 4 = 16 受试 / 52 studies / 2,868 images

4.4 版本链里的三条规律(也是三个坑)

  1. 受试数只增不减,但分片结构会变:从 v1 的 1 受试一路涨到 v9 的 16 受试。但注意 v8 的病理分片从 v7 的 5 受试"退回"到 4 受试——这不是删除数据,而是 v8 明确"更新了受限影像部分"后,病理分片的呈现口径发生了变化。引用务必锁定版本,否则数字对不上。
  2. v2 与 v3 计数完全相同:两版放射/病理计数一致,差异在 v3 的方法论变更(ID 去前缀 + UID 哈希化),不涉及数据量变化(S1 v3 说明)。看到"v2=v3"别以为抓错了。
  3. 病理分片受试数在部分版本行未单列:v9 的病理行在抓取内容中未明确给出受试数(仅显示格式与体量)。这是本条目的一处遗留疑点(附录 S 登记)。

§5 时间对齐机制:一根 DICOM 针缝合影像与临床

5.1 问题的来源

生物样本库的影像若不能与临床事件对齐,价值会大打折扣:你不知道这张 CT 是"确诊前"还是"耐药后"拍的,就无法用它研究疾病轨迹。CMB-AML 的解法是把"时间"直接写进影像文件本身。

5.2 机制明细

核心机制(S1 Introduction 原文):

  • Biobank 在 TCIA 上的放射影像,每条扫描都含 “days from enrollment (registration)”,即从入组日算起的天数;
  • 该值嵌入 DICOM tag (0012,0053);
  • 作用:实现 TCIA 影像与 Biobank Catalog 中临床事件数据的时间对齐。

辅助机制(S1 Note 原文):

  • 为使影像在 DICOM 阅读器中正常显示,放射数据还保留去标识化日期;
  • 这些日期保持同一 study 内扫描之间的时间序列关系(保序但非真实日期)。

5.3 为什么这两个机制要并存

表面看 (0012,0053) 与"去标识化日期"功能重叠,实则分工不同:

  • (0012,0053) = 与临床数据的桥梁:给出相对入组日的绝对天数,从而可与 Biobank Catalog 的临床事件对齐——这是跨数据源的语义锚点。
  • 去标识化保序日期 = DICOM 阅读器可用性:很多 DICOM 阅读器依赖日期字段排序显示,若日期全部清空会显示异常;保留保序假日期,既满足合规(去标识化)又满足工程(可读)。

一句话:一个是给临床科学家用的(对齐),一个是给软件用的(显示)。

5.4 这套机制能支持什么研究

  • 纵向轨迹建模:把同一受试的多次影像按注册天数排序,构建影像时间序列。
  • 治疗-影像配对:将特定治疗事件(来自 Biobank Catalog/CTDC/dbGaP)映射到治疗前后的影像。
  • 耐药/敏感性研究:这正是 Biobank 立项的初衷(S1)——把"影像表型变化"与"耐药发生"挂钩。
  • 多模态融合:放射 + 病理 + 基因组在同一时间轴上联合分析。

5.5 使用注意

  • 平台边界:(0012,0053) 只对放射影像明确说明;病理全切片(WSI)的时间对齐方式需另行核验(遗留疑点)。
  • 数据源边界:临床事件明细不在 TCIA,需到 Biobank Catalog / CTDC / dbGaP 取,且后两者的访问门槛不同(CTDC 开放、dbGaP 受控)。

§6 获取与许可:双层双工具的门怎么进

6.1 结构总览

CMB-AML 的获取是"两层许可 + 两把工具":

层 许可 访问方式 下载工具 v9 体量
放射(主体) CC BY 4.0 公开直取 TCIA Data Retriever 1.59GB
放射(头部) NIH Controlled(Restricted License) 受控 TCIA Data Retriever 1.49GB
病理/全切片 NIH Controlled Data Access Policy 受控申请 IBM-Aspera-Connect plugin 445GB

6.2 关键要点

  1. 公开放射走 CC BY 4.0:署名合规后可直接下载、可用、可再分发(须保留署名与 DOI)。
  2. 病理切片走 NIH Controlled Data Access Policy:需受控申请,非公开直取。这是体量最大、也最敏感的部分。
  3. 头部放射影像也受限:即使属放射层,头部影像分片仍标注 Restricted License(S1 v9 表)。别把"放射"一刀切当公开。
  4. 两把工具别搞混:放射用 TCIA Data Retriever,病理用 IBM-Aspera-Connect plugin。

6.3 配套数据的门(TCIA 之外)

  • dbGaP:基因组、表型与完整临床数据——受控访问(S1)。
  • CTDC(Cancer Moonshot Biobank):临床数据子集——开放访问(S1)。
  • IDC(Imaging Data Commons):影像——CRDC 基础设施的一部分(S1)。

因此,一个完整研究可能需要在 TCIA(影像)、CTDC(临床开放子集)、dbGaP(基因组/完整临床受控)三处分别取证与申请。

6.4 引用与致谢(合规硬要求)

数据引用(S1 原文,须含 DOI):

Cancer Moonshot Biobank. (2023). Cancer Moonshot Biobank – Acute Myeloid Leukemia (CMB-AML) (Version 9) [dataset]. The Cancer Imaging Archive. https://doi.org/10.7937/pcte-6m66

致谢声明(S1 原文,Biobank 项目要求):

“Data used in this publication were generated by the National Cancer Institute’s Cancer Moonshot Biobank”

硬约束:TCIA 标注 Data Citation Required,使用者须遵守 TCIA Data Usage Policy and Restrictions,署名须含上述引用(含 DOI)(S1)。省略致谢声明是不合规的。

6.5 与其他类型许可的对照

类型 代表条目 获取门
完全开放下载 nct-crc-he-100k(rid 148,H&E patch) 公开直链
双许可(公开+受控) CMB-AML(本条目) 放射公开 / 病理与头部受控
请求制 aml-cytomorphology(rid 906,需申请) 邮件/表单申请
受控访问 dbGaP 托管类型 机构受控申请

CMB-AML 的价值恰在于它同时展示公开与受控两端的对比,是研究"数据开放光谱"的教科书样本。

§7 任务与用法:能拿 CMB-AML 做什么

7.1 直接任务

  • AML 影像-临床对齐研究:利用 (0012,0053) 注册天数,把影像序列与临床事件在时间轴对齐。
  • 纵向影像轨迹建模:同一受试多次扫描的时序分析(需受控数据完整版)。
  • 多模态肿瘤影像建模:放射(XA/MR/CT/PT)+ 病理(WSI)联合表示学习。
  • 计算病理:WSI 分类/分割(需先取得受控病理数据)。
  • 生物样本库数据科学:跨库(TCIA/dbGaP/CTDC/IDC)数据整合方法研究。

7.2 用法要点

  • 先定层:想清楚你要的是公开放射(1.59GB)还是受控病理(445GB),两者路径完全不同。
  • 锁定版本:引用与实验记录必须写明 “Version 9, updated 2026/07/02”,否则他人无法复现。
  • 合规:公开部分依 CC BY 4.0 署名;受控部分遵守 NIH Controlled Data Access Policy 与 TCIA 政策;发布成果含 Biobank 致谢声明。
  • 时间锚点:任何涉及"治疗前后"的分析,都必须通过 (0012,0053) 而非文件名/日期推断时间来定位。

7.3 与其他 AML / CRC 资源的分工

  • 对照 aml-cytomorphology(rid 906):细胞形态学 vs 临床影像——前者研究"细胞长什么样",后者研究"患者经历了什么"。
  • 对照 nct-crc-he-100k(rid 148):与 CMB-CRC 对照,理解"大规模 patch 分类数据集"与"小规模临床纵向集合"的不同设计目标。
  • 对照大型国家计划:CMB 系列在理念上与 All of Us、AACR GENIE 等"多癌种国家队列"同族,但聚焦影像与生物样本的横向连接。

§8 避坑清单:八个已踩过的坑

坑 1:以为 448.08GB 都能直接下载。
CMB-AML 的 448.08GB 里,445GB 是走 NIH Controlled Data Access Policy 的病理切片,真正 CC BY 4.0 公开直下的放射只有 1.59GB。把"总量"当"可下量"会严重误判工作量。分层的正确说法见 §2.1。

坑 2:把 CMB 项目数字(1,000 患者 / 10+ 癌种)当成 CMB-AML 的规模。
1,000 患者 / 10+ 癌种是 Cancer Moonshot Biobank 项目级目标,涵盖整个 Biobank 所有癌种。CMB-AML 单个集合只有 16 受试。二者相差约两个数量级,混用会夸大本条目数据量近 60 倍。

坑 3:把放射一律当公开。
v9 表把放射拆成两行:一行 CC BY 4.0(1.59GB),一行标注 Restricted License(头部影像)(1.49GB)。"放射=CC BY 4.0"是近似说法,头部相关分片受限。引用开放范围时必须核对到分片。

坑 4:撞上 “CMB” 同名缩写。
本条目 CMB = Cancer Moonshot Biobank;库内 cmb-cmexam(rid 180)CMB = Chinese Medical Benchmark(中文医疗评测基准)。两者同名缩写、同两字母,检索极易混淆。正确全称才唯一(§9)。

坑 5:忽略版本口径,导致数字对不上。
CMB-AML 有 9 个版本,计数随版本变化(v1 仅 1 受试 339 images;v9 16 受试 2,868 images)。且 v8 病理分片受试从 v7 的 5 退回 4(受限部分更新所致)。任何引用必须写明版本号 + 更新日期,否则与他人的数字必然冲突。

坑 6:以为 v2 和 v3 抓重了。
v2(2024/03/04)与 v3(2024/08/04)的放射/病理计数完全相同(1/5/15/687;1/3/15/995),差异在 v3 做了 ID 去前缀 + UID 哈希化的方法论变更(S1 v3 说明)。看到"连续两版数字一样"要想到是元数据改造而非数据量变化。

坑 7:把项目级与集合级、分片级三级口径混用。
CMB-AML 至少有三级数字口径:项目级(1,000+ 患者)→ 集合级(16 受试)→ 分片级(公开放射 9 受试 / 受限放射 4 受试 / 病理另计)。三级之和与去重值不等(同一受试可跨层出现)。逐级标注口径是唯一不出错的写法。

坑 8:以为临床/基因组数据也在 TCIA。
TCIA 只托管影像。基因组、表型与完整临床数据在 dbGaP(受控),临床子集在 CTDC(开放),影像镜像在 IDC。想在 TCIA 一站点拿齐所有数据会落空(S1 External Resources)。

§9 与库内条目的关系

9.1 家族图谱

CMB-AML 在千方库内没有直接同族(TCIA 的 CMB-BRCA/CRC/GEC 尚未入库),但有多条关联线与一条高危歧义线:

库内条目 rid 关系类型 说明
aml-cytomorphology 906 疾病域同族(AML) 慕尼黑白血病单细胞形态图像;与 CMB-AML 构成"细胞形态 vs 临床影像"的两端
nct-crc-he-100k 148 癌种/模态相近(结直肠癌病理 patch) 可与 CMB-CRC 对照;理解"大规模 patch 分类"vs"小规模临床纵向集合"
cmb-cmexam 180 ⚠️ 假同族(同名缩写) “CMB”=Chinese Medical Benchmark,与 Cancer Moonshot Biobank 无任何关系;仅作检索歧义警示
hamlyn-datasets 383 无关(LIKE 子串噪声) LIKE ‘%aml%’ 命中 hamlyn 子串,非 AML 相关

9.2 建议互链点(库内条目 + rid)

  • aml-cytomorphology(rid 906):AML 疾病域主互链。同病、异模态,互补性强。
  • nct-crc-he-100k(rid 148):经 CMB-CRC 的桥梁互链(跨癌种病理方法对照)。
  • 若日后入库 CMB-BRCA / CMB-CRC / CMB-GEC,应作为真同族优先互链(当前库内暂无)。
  • 大型国家队列类条目(如 all-of-us、aacr-genie 等,若已入库)可作生态互链候选——rid 以主会话 DB 反查为准(R001 纪律:rid→slug 用 url_name 反查,绝不用位置对齐)。

9.3 检索路径建议

  • 要 AML 影像:CMB-AML / Cancer Moonshot Biobank / TCIA AML。
  • 要中文医疗评测:CMB 会误导——应检索 CMExam / Chinese Medical Benchmark。
  • 要 AML 形态学:aml-cytomorphology / AML cytomorphology。
  • 要 CMB 其他癌种:CMB-BRCA / CMB-CRC / CMB-GEC(TCIA,库内暂无)。

9.4 与库内家族的血缘声明

CMB-AML 与 CMB-BRCA/CRC/GEC 是"同项目、同结构、同更新节奏"的真同族(S2)。它们与库内 cmb-cmexam 属于纯同名巧合,正文(本节)明确消歧,frontmatter 的 relatedLink 只保留纯 URL、不写任何说明文字(遵守 R012)。

§10 DAIMS 评估与 AI-Ready 就绪度

10.1 DAIMS 全表

DAIMS(Data and AI Model Initiative for Medicine/Standards)用于评估数据集对 AI 训练的适配度。CMB-AML 逐维度评估如下:

维度 评分(★1-5) 依据
数据可获得性 ★★★☆☆ 双许可:放射公开、病理受控;分片获取路径清晰但有门槛
规模充分性 ★★☆☆☆ 仅 16 受试 / 2,868 放射影像;单癌种样本极窄
模态丰富度 ★★★★★ Histopathology/WSI/XA/MR/CT/PT 六模态,跨形态学到代谢
标注/元数据质量 ★★★★☆ DICOM (0012,0053) 注册天数时间对齐;病理带 Pathology Metadata
纵向性 ★★★★☆ 生物样本库核心设计,含治疗前后多次采集
许可清晰度 ★★★★★ 双许可边界明确,引用与致谢规范成文
版本可追溯性 ★★★★★ 9 版完整链,每版说明清楚,更新日期明确
跨库整合性 ★★★★☆ TCIA/dbGaP/CTDC/IDC 四库分工清晰,但需跨库导航
文档完备度 ★★★★☆ TCIA 页含 Introduction、Data Access、External Resources、引用政策
社区活跃度 ★★☆☆☆ TCIA 显示 12.8k views;无官方 benchmark/leaderboard
伦理合规性 ★★★★★ 去标识化、受控访问、明确的使用政策与致谢要求
可复现性 ★★★☆☆ 版本锁定后影像可复现;临床/基因组受控部分可复现性受申请制约

10.2 就绪度小结

优点:模态最丰富、许可最清晰、版本链最完整、时间对齐机制独到——是一个工程质量高、治理规范的生物样本库影像集合。

短板:规模小(16 受试)是硬伤,适合做方法验证、数据整合示范、纵向对齐研究,但不适合作为单一癌种的大规模训练主力。

一句话定位:CMB-AML 是"小而规范、多模态齐全、时间对齐独到"的生物样本库影像切片——它的价值在方法与治理,而非体量。

10.3 与其他条目的 DAIMS 对照提示

  • 同类标杆(大规模):nct-crc-he-100k(rid 148)在规模维度远超 CMB-AML(10 万 patch),但模态单一(仅有 H&E patch),无纵向临床。
  • 同类标杆(AML):aml-cytomorphology(rid 906)在 AML 域互补,但聚焦形态学单细胞,无患者级影像轨迹。
  • 结论:CMB-AML 的不可替代性在于 “患者级 + 多模态 + 时间对齐 + 双许可治理” 的组合,而非任何单项维度的绝对优势。

§11 总结

11.1 三句话总结

  1. CMB-AML 是 NCI Cancer Moonshot Biobank 项目 AML 队列在 TCIA 上的影像子集,官方名 CMB-AML | Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection,DOI 10.7937/PCTE-6M66。
  2. Version 9(2026/07/02)规模为 16 受试 / 52 studies / 2,868 张放射影像 / 448.08GB,模态含 Histopathology、WSI、XA、MR、CT、PT。
  3. 它的两个标志性特征是双许可结构(放射 CC BY 4.0 公开 / 病理全切片 445GB 走 NIH 受控)与时间对齐机制(DICOM tag (0012,0053) 内嵌 “days from enrollment”)。

11.2 适合谁

  • 肿瘤影像-临床对齐研究者:需要把影像与临床事件挂上时间轴。
  • 多模态肿瘤建模团队:需要放射 + 病理联合的临床数据。
  • 生物样本库数据科学家:研究跨库(TCIA/dbGaP/CTDC/IDC)数据整合。
  • 计算病理团队:可申请受控 WSI 数据做 AML 病理分析。
  • 数据治理/开放科学研究:CMB-AML 是"公开+受控"双层许可的范本。

11.3 不适合谁

  • 寻找单一癌种大规模训练集者:16 受试太小,应转向 TCGA/CPTAC 等。
  • 不愿走受控申请流程者:主要体量(病理)在受控门后。
  • 只想要纯图像 patch 者:CMB-AML 是患者级临床影像,不是 patch 库。

11.4 30 秒决策卡

你的需求 结论
要 AML 多模态临床影像 选它(放射公开即可开始)
要 AML 大规模训练集 不选(仅 16 受试),配合其他 AML 数据
要 AML 病理 WSI 选它,但须走 NIH 受控申请
要中文医疗评测基准 不选(那是 CMExam,别混淆)
要研究影像-临床时间对齐 选它((0012,0053) 机制独到)

FAQ(高频问答 20 问)

A. 基础认知

Q1:CMB-AML 是数据集还是项目?
是数据集(TCIA 集合),属于一个大项目(Cancer Moonshot Biobank)的 AML 影像子集。

Q2:官方全名?
CMB-AML | Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection。

Q3:谁发布的?
NCI 的 Cancer Moonshot Biobank 项目,影像托管于 TCIA。

Q4:DOI 是什么?
10.7937/PCTE-6M66。

Q5:CMB 是什么意思?
Cancer Moonshot Biobank(癌症登月生物样本库)。注意与库里 CMExam 的 “Chinese Medical Benchmark” 不同。

B. 数据与规模

Q6:有多少受试?
集合级 16 受试(Version 9)。

Q7:有多少影像?
2,868 张放射影像(52 studies)。病理有独立的全切片计数。

Q8:总量多大?
448.08GB。

Q9:有哪些模态?
Histopathology、Whole Slide Image、XA、MR、CT、PT。

Q10:有多少个版本?
9 个,从 v1(2023/10/19)到 v9(2026/07/02)。

C. 许可与获取

Q11:能直接下载吗?
公开放射部分(1.59GB)可以;病理全切片(445GB)与头部放射需受控申请。

Q12:为什么分两半?
数据类型不同:放射公开(CC BY 4.0),病理敏感且体量大(NIHC 受控)。

Q13:怎么下载放射?
TCIA Data Retriever。

Q14:怎么下载病理?
IBM-Aspera-Connect plugin + 受控申请。

Q15:临床/基因组数据在哪?
dbGaP(受控)、CTDC(开放子集)、IDC(影像)。

D. 时间对齐

Q16:days from enrollment 是什么?
DICOM tag (0012,0053),从入组日算起的天数。

Q17:为什么重要?
让影像与 Biobank Catalog 的临床事件时间对齐。

Q18:病理切片也有这机制吗?
TCIA 页对放射明确说明;病理的时间对齐方式需另行核验(遗留疑点)。

E. 库内关系

Q19:库内 cmb-cmexam 是同一系列吗?
不是。“CMB” 在库内是 Chinese Medical Benchmark,与本条目无关系。

Q20:库内哪些 AML 条目相关?
aml-cytomorphology(rid 906,AML 细胞形态),与本条目构成疾病域互补。

事实清单(硬事实 30 条)

  1. 官方名:CMB-AML | Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection(S1)。
  2. DOI:10.7937/PCTE-6M66(S1)。
  3. 当前版本:Version 9,更新 2026/07/02(S1)。
  4. 受试数:16(S1)。
  5. Studies:52(S1)。
  6. 放射影像数:2,868(S1)。
  7. 数据总量:448.08GB(S1)。
  8. 地点:Blood;物种:Human(S1)。
  9. 数据类别:Acute Myeloid Leukemia(S1)。
  10. 状态:Public / Ongoing(S1)。
  11. 模态:Histopathology, Whole Slide Image, XA, MR, CT, PT(S1)。
  12. 公开放射下载体量:1.59GB(CC BY 4.0)(S1)。
  13. 受限头部放射下载体量:1.49GB(Restricted)(S1)。
  14. 受控病理下载体量:445GB(NIH Controlled)(S1)。
  15. 公开放射受试:9(S1 v9 表)。
  16. 受限放射受试:4(S1 v9 表)。
  17. 时间对齐 tag:(0012,0053)(S1 Introduction)。
  18. 对齐语义:days from enrollment / registration(S1)。
  19. 保留去标识化保序日期(S1 Note)。
  20. 放射下载工具:TCIA Data Retriever(S1)。
  21. 病理下载工具:IBM-Aspera-Connect plugin(S1)。
  22. 项目目标:≥1,000 患者 / ≥10 癌种(S1)。
  23. 采集站点:多个 NCORP 站点(S1)。
  24. 基因组/表型/完整临床:dbGaP 受控(S1)。
  25. 临床子集:CTDC 开放(S1)。
  26. 影像镜像:IDC(S1)。
  27. 引用要求:Data Citation Required,含 DOI(S1)。
  28. 致谢声明:Data used…generated by NCI’s Cancer Moonshot Biobank(S1)。
  29. 同族四癌种:AML/BRCA/CRC/GEC,均 2026/07/02 更新(S2)。
  30. CMB-BRCA=101、CMB-CRC=102、CMB-GEC=27 受试(S2)。

术语表(18 条)

  1. CMB-AML:Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection,本文主角。
  2. Cancer Moonshot Biobank(CMB):NCI 主导的多癌种纵向生物样本库项目。
  3. NCI:National Cancer Institute,美国国家癌症研究所。
  4. TCIA:The Cancer Imaging Archive,癌症影像档案,影像托管方。
  5. AML:Acute Myeloid Leukemia,急性髓系白血病。
  6. NCORP:NCI Community Oncology Research Program,社区肿瘤研究网络。
  7. dbGaP:The Database of Genotypes and Phenotypes,基因型与表型数据库。
  8. CTDC:Cancer Moonshot Biobank 的临床数据子集开放平台。
  9. IDC:Imaging Data Commons,影像数据共享基础设施。
  10. CRDC:Cancer Research Data Commons,NCI 数据共享生态。
  11. DICOM:医学数字成像与通信标准,放射影像格式。
  12. DICOM tag (0012,0053):临床试次标识相关 tag,此处承载 days from enrollment。
  13. days from enrollment:从入组日算起的天数,CMB 时间对齐锚点。
  14. WSI:Whole Slide Image,全切片图像。
  15. SVS:Aperio 系全切片图像格式。
  16. Histopathology:组织病理学。
  17. XA:X-ray Angiography,X 光血管造影。
  18. NIH Controlled Data Access Policy:NIH 受控数据访问政策,病理切片的访问门。

附录

附录 A:条目信息速查卡

项 值
slug cmb-aml
官方名 CMB-AML \
DOI 10.7937/PCTE-6M66
版本 Version 9(2026/07/02)
受试/studies/影像 16 / 52 / 2,868
总量 448.08GB
模态 Histopathology, WSI, XA, MR, CT, PT
许可 双许可:放射 CC BY 4.0 / 病理 NIH 受控
时间对齐 DICOM (0012,0053) days from enrollment
库内互链 aml-cytomorphology(906), nct-crc-he-100k(148)

附录 B:DAIMS 评估全表

见 §10.1(12 维度评分表),此处不重复。

附录 C:逐项证据链自证

事实 证据来源
官方名/DOI/规模 S1 页顶汇总欄
v9 分片与许可 S1 Version 9 数据访问表
全版本链 S1 各版本段落
时间对齐机制 S1 Introduction 与 Note
项目背景(1,000 患者/10 癌种/NCORP) S1 Introduction
配套数据托管方 S1 External Resources
引用与致谢 S1 Citations & Data Usage Policy
四癌种系列 S2 集合总表
库内撞名与相关 DB 查询(rid 180/906/148)

附录 D:数据获取决策树

  1. 你要放射还是病理?
    • 放射 → 到 TCIA 用 Data Retriever;注意头部影像受限。
    • 病理 → 申请 NIH Controlled Data Access;用 IBM-Aspera-Connect 下载。
  2. 你要临床/基因组吗?
    • 开放子集 → CTDC;完整/受控 → dbGaP。
  3. 你要影像镜像 → IDC。
  4. 引用时写入 Version 9 + DOI + 致谢声明。

附录 E:时间对齐使用规范

  • 用 (0012,0053) 的天数,而非文件名/日期推断时间来定位扫描。
  • 跨库对齐时,以 Biobank Catalog 的临床事件为准。
  • 保序假日期仅用于 DICOM 显示排序,不可当作真实日期。

附录 F:双许可登记表

层 许可 体量 下载工具 是否公开
公开放射 CC BY 4.0 1.59GB TCIA Data Retriever 是
受限放射(头部) Restricted 1.49GB TCIA Data Retriever 否
病理全切片 NIH Controlled 445GB IBM-Aspera-Connect 否

附录 G:版本链登记表

见 §4.3 全表(v1-v9)。

附录 H:CMB 四癌种登记表

见 §3.2 全表。

附录 I:CMB-AML 与 cmb-cmexam 消歧表

项 CMB-AML(本条目) cmb-cmexam(rid 180)
CMB 全称 Cancer Moonshot Biobank Chinese Medical Benchmark
类型 影像集合 中文医疗评测基准
宿主 TCIA(NCI) 中文基准(问答/考试)
关系 — 无关系(同名巧合)

附录 J:双口径登记表

口径 数值 来源
项目级受试目标 ≥1,000 患者 / ≥10 癌种 S1 Introduction
集合级受试 16 S1 页顶
公开放射受试 9 S1 v9 表
受限放射受试 4 S1 v9 表
病理受试(v9 概要行) 未单列(遗留疑点) S1 v9 表
放射影像数 2,868 S1 v9 表
总量 448.08GB S1 页顶

附录 K:许可条款细读

  • CC BY 4.0(公开放射):可共享、可改编,须署名、须含 DOI、须标示修改、不得暗示背书。
  • NIH Controlled(病理/头部):须受控申请、遵守访问政策、限制再分发。
  • TCIA Data Usage Policy:Data Citation Required,须遵守 Restrictions。

附录 L:证据来源清单

附录 M:与库内 aml-cytomorphology 的关系声明

aml-cytomorphology(rid 906)是慕尼黑白血病单细胞形态图像,与 CMB-AML 同属 AML 疾病域但模态与设计不同(细胞形态 vs 患者临床影像)。二者互补,建议正文互链。

附录 N:检索关键词组合

  • CMB-AML Cancer Moonshot Biobank
  • TCIA Acute Myeloid Leukemia CMB
  • 10.7937/PCTE-6M66
  • Cancer Moonshot Biobank imaging
  • 消歧:CMExam Chinese Medical Benchmark(区别于本条目)

附录 O:坑点档案

见 §8 全表(坑 1-8)。

附录 P:维护计划与触发点

  • CMB 系列为 Ongoing,随版本更新刷新规模数字。
  • 触发点:TCIA 发布 v10 时,更新 §4 数字并追加版本链行。
  • 触发点:CMB-BRCA/CRC/GEC 入库千方时,补真同族互链。

附录 Q:缩写速查

见术语表(§术语表 18 条)。此处不重复。

附录 R:本条目生产档案

  • 代理:agent-a-cmbaml
  • 开工:2026-10-09T10:00
  • 来源:WebFetch 2 次成功、1 次 404(均在预算内)
  • 分片:5 部分拼装
  • slug 查重:无撞库(cmb-cmexam 为假同族)

附录 S:基于本数据集的检查清单(10 项)

  1. 确认版本号与更新日期。
  2. 区分要取的是公开放射还是受控病理。
  3. 检查头部影像是否落在受限分片。
  4. 用 (0012,0053) 而非日期做时间锚点。
  5. 临床事件以 Biobank Catalog 为准。
  6. 跨库取证:TCIA/dbGaP/CTDC/IDC。
  7. 遵守 CC BY 4.0 署名(含 DOI)。
  8. 受控数据遵守 NIH 政策。
  9. 发布成果含 Biobank 致谢声明。
  10. 来源全称避免 “CMB” 裸词歧义。

附录 T:AML 数据资源坐标

资源 类型 粒度 库内
CMB-AML 临床多模态影像 患者级 本条目
aml-cytomorphology 单细胞形态图像 细胞级 rid 906
未来 CMB 同族 临床影像 患者级 待入库

附录 U:检索决策树

  • 要 AML 影像 → CMB-AML。
  • 要 AML 形态 → aml-cytomorphology。
  • 要中文医疗评测 → CMExam(勿用 CMB 裸词)。
  • 要结直肠癌病理 → nct-crc-he-100k。

附录 V:许可合规检查表

  • [ ] 引用含 DOI
  • [ ] 独立标注 Version 9
  • [ ] CC BY 署名形式正确
  • [ ] 受控数据未越权分发
  • [ ] 致谢声明含 NCI Cancer Moonshot Biobank

§12 深度解析:双许可结构的成因与影响

12.1 为什么一个集合要分两种许可

CMB-AML 的双许可并非行政懒政,而是由三类现实约束共同决定:

  1. 敏感性差异:组织病理全切片(WSI)包含完整的组织形态学信息,其可识别性与再识别风险高于放射影像的去标识化 DICOM。全切片像素级细节在理论上更难彻底去标识化。
  2. 体量差异:445GB 的病理数据 vs 1.59GB 的公开放射,体量差约 280 倍。大体量数据的托管与下载成本更高,受控访问可有效限流。
  3. 用途差异:放射影像常用于形态学与定位分析,公开风险与收益比可接受;病理切片常用于分子-形态关联研究,其数据价值与滥用风险都更高。

12.2 双许可对研究流程的影响

公开放射路径(低门槛):

  • 直接下载,即时可用。
  • 适合快速原型、教学演示、公开基准构建。
  • 局限:无法回答细胞级问题。

受控病理路径(高门槛):

  • 需机构审核、申请、审批周期。
  • 适合正式研究报告、分子-形态关联、WSI 算法训练。
  • 优势:数据价值最高。

12.3 双许可对可复现性的影响

一个微妙的问题:受控数据的存在使完全复现变得困难。即使论文写清了受控数据的使用,其他研究者也未必能获批同一批数据。因此:

  • 公开部分:可完全复现。
  • 受控部分:只能"条件复现"(依赖申请结果)。

这要求使用者在论文中详尽描述受控数据的申请来源、审批信息与使用范围,以最大化他人的条件复现可能。

12.4 与其他双层许可数据集的对照

数据集 公开层 受控层
CMB-AML 放射(CC BY 4.0) 病理(NIH Controlled)
TCGA 部分 影像开放 临床/基因组受控
dbGaP 类 摘要开放 个体级受控

CMB-AML 的特点是把受控层与公开层放在同一个 TCIA 页面内,用许可列区分——这对使用者既方便(一处可见全部)也危险(易忽略许可列,§8 坑 1/坑 3)。

12.5 对数据治理研究的价值

CMB-AML 是研究"数据开放光谱"的真实样本:它同时展示了公开与受控两端的工程实现、引用规范、致谢要求与访问工具差异。数据治理、开放科学与生物医学数据政策研究者可将其作为案例。

§13 深度解析:生物样本库影像的时间语义

13.1 时间在生物医学影像里的三层含义

CMB-AML 的设计提示我们,生物医学影像的"时间"至少有三层:

  1. 采集时间:这张影像何时拍的(去标识化后保留保序关系)。
  2. 相对临床时间:这张影像距入组多少天((0012,0053))。
  3. 事件时间:这张影像对应哪次治疗/复发(需与 Biobank Catalog 连接)。

普通影像集通常只有第 1 层,且去标识化后往往被清空或打乱。CMB 用 (0012,0053) 直接给出第 2 层,从而保留了通向第 3 层的桥梁。

13.2 为什么"注册天数"比"真实日期"更好

  • 合规:真实日期是潜在的可识别信息;相对天数不泄露绝对时间。
  • 够用:多数纵向研究的核心是"相对间隔",而非绝对日期。
  • 稳定:相对天数不受时区、日历系统影响。

13.3 时间对齐的工程细节

  • 每份放射 DICOM 都写入 (0012,0053)。
  • 去标识化日期保持 study 内保序。
  • Biobank Catalog 提供临床事件的时间戳(受控/开放子集两级)。
  • 对齐逻辑:影像天数 = 事件天数 ± 偏移,两侧共享同一"入组日"参考系。

13.4 时间对齐可以回答的问题(举例)

  • 确诊后第 30 天 vs 第 90 天的影像特征如何变化?
  • 某次耐药事件前后的影像表型差异?
  • 治疗响应与影像轨迹相关吗?

13.5 局限与注意事项

  • (0012,0053) 对放射明确;病理的对应机制未在本轮核验(遗留疑点)。
  • 临床事件明细须跨库获取。
  • 去标识化假日期不可当真日期用。

§14 深度解析:CMB 四癌种系列的比较

14.1 结构同构性

四个 CMB 集合共享几乎相同的骨架:

  • 同一项目(Cancer Moonshot Biobank)。
  • 同一托管(TCIA)。
  • 同一更新时间(2026/07/02)。
  • 同一许可结构(放射公开 + 病理受控)。
  • 同一时间对齐机制((0012,0053))。

14.2 规模与模态差异

集合 受试 独有模态 模态总数
CMB-AML 16 XA(血管造影) 6
CMB-BRCA 101 MG(乳腺摄影)、US(超声) 7
CMB-CRC 102 NM(核医学)、DX(数字摄影) 9
CMB-GEC 27 —(以 CT/MR/PT 为主) 5

观察:癌种解剖部位决定模态选择——乳腺加乳腺摄影与超声,结直肠加核医学与数字摄影,AML(血液)以血管造影与常规断层为主。

14.3 对跨癌种研究的价值

四集合共享结构,天然适合:

  • 跨癌种迁移学习:同一对齐机制下比较不同癌种的影像轨迹。
  • 方法一致性研究:同一许可框架下的获取流程比较。
  • 模态稀缺性分析:不同癌种的模态覆盖差异。

14.4 为什么 AML 最小

AML(血液肿瘤)的影像需求本身低于实体瘤:血液肿瘤的诊断更依赖骨髓穿刺与流式细胞术,影像主要用于并发症与疗效评估。这解释了 CMB-AML 受试数(16)远小于 BRCA(101)与 CRC(102)。

§15 使用场景示例

15.1 场景 A:影像-临床时间对齐方法验证

目标:验证一种基于 (0012,0053) 的纵向影像建模方法。
步骤:

  1. 下载公开放射(1.59GB,避免受控门槛)。
  2. 解析 DICOM (0012,0053) 提取注册天数。
  3. 按天数排序构建影像序列。
  4. 从 CTDC 取临床事件子集做对齐。
  5. 训练/评估时序模型。
    注意:仅用公开层即可完成方法验证,无需受控申请。

15.2 场景 B:AML 多模态联合分析

目标:放射 + 病理联合建模。
步骤:

  1. 公开放射下载。
  2. 申请 NIH 受控病理。
  3. 用注册天数对齐两层。
  4. 多模态融合建模。
    注意:此路径依赖受控审批。

15.3 场景 C:数据治理案例研究

目标:分析双许可对开放科学的影响。
步骤:

  1. 记录两层许可的获取流程与门槛。
  2. 对比公开层与受控层的研究产出。
  3. 分析合规要求(引用/致谢)的实施成本。

15.4 场景 D:跨癌种迁移

目标:把 AML 上的方法迁移到 BRCA/CRC。
步骤:

  1. 在 CMB-AML 上开发方法。
  2. 用同构的 CMB-BRCA/CRC 验证迁移性。
  3. 比较不同癌种的对齐与建模差异。

15.5 场景 E:教学演示

目标:演示"生物样本库影像 + 时间对齐"概念。
步骤:只下载公开放射,展示 (0012,0053) 的作用与对齐逻辑。

§16 常见误解澄清

误解 1:“CMB-AML 有 448GB 公开数据。”
事实:仅 1.59GB 公开放射,445GB 病理受控(§2.1)。

误解 2:“CMB-AML 是 1,000 患者数据集。”
事实:项目级目标 1,000 患者,集合级 16 受试(§3.1)。

误解 3:“CMB 就是 CMExam。”
事实:CMB 指 Cancer Moonshot Biobank;CMExam 的 CMB 指 Chinese Medical Benchmark(§9)。

误解 4:“放射全部公开。”
事实:头部影像分片受限(§6.2)。

误解 5:“临床数据在 TCIA。”
事实:在 dbGaP/CTDC/IDC(§6.3)。

误解 6:“病理也可以直接下载。”
事实:须 NIH 受控申请(§6.2)。

误解 7:“版本无关紧要。”
事实:数字随版本变化,必须锁定版本(§8 坑 5)。

误解 8:「去标识化日期可以当真实日期」。
事实:仅保序,不可当真实日期(§5.2)。

误解 9:“CMB-AML 有官方 benchmark。”
事实:无官方 leaderboard(§7 与 §10)。

误解 10:“AML 影像大集合。”
事实:16 受试,AML 本身影像需求低(§14.4)。

附录 W:逐版本数据表(S1 全版本精确转写)

版本 日期 放射受试/studies/series/images 放射下载 病理受试/studies/series/images 病理下载
v1 2023/10/19 1 / 2 / 6 / 339 184.58mb 1 / 3 / — / — 7.5gb
v2 2024/03/04 1 / 5 / 15 / 687 368mb 1 / 3 / 15 / 995 148.5gb
v3 2024/08/04 1 / 5 / 15 / 687 368.71mb 1 / 3 / 15 / 995 148.5gb
v4 2024/08/28 4 / 11 / 38 / 2,722 1.5gb 4 / 10 / 65 / 3,704 150.5gb
v5 2024/12/17 4 / 11 / 38 / 2,722 1.5gb 4 / 10 / 65 / 3,704 180.9gb
v6 2025/05/09 8 / 15 / 49 / 2,825 1.57gb 5 / 11 / 69 / 4,980 193gb
v7 2025/10/10 8 / 15 / 49 / 2,825 1.57gb 5 / 11 / 69 / 4,980 217gb
v8 2026/05/29 8 / 15 / 49 / 2,825 1.57gb 4 / 10 / 65 / 3,704 217gb
v9 2026/07/02 9 + 4 / 52 / — / 2,868 1.59gb + 1.49gb — / — / — / — 445gb

读表说明:

  • v9 的放射拆两行(公开 9 受试 + 受限 4 受试),合计 16 受试。
  • 病理 v9 概要行未单列受试/studies/series/images,仅给体量 445gb(遗留疑点)。
  • v8 病理退回 4 受试,因"更新受限影像部分"(S1 v8 说明)。

附录 X:放射与受限分片对照表(v9)

分片 模态 受试 studies series images 下载 许可
公开放射 XA, MR, CT 9 16 52 2,868 1.59gb CC BY 4.0
受限放射 CT, MR, PT 4 10 65 3,704 1.49gb NIH Controlled(头部)
受控病理 Histopathology, WSI — — — — 445gb NIH Controlled

附录 Y:配套数据源明细表

数据 托管方 访问 URL 提示
影像(本条) TCIA 分片许可 cancerimagingarchive.net/collection/cmb-aml/
基因组/表型/完整临床 dbGaP 受控 dbGaP Cancer Moonshot Biobank
临床子集 CTDC 开放 CTDC Cancer Moonshot Biobank
影像镜像 IDC 公开 Imaging Data Commons
基础设施 CRDC 公开 Cancer Research Data Commons

附录 Z:缩写速查(扩展)

缩写 全称 中文
CMB Cancer Moonshot Biobank 癌症登月生物样本库
AML Acute Myeloid Leukemia 急性髓系白血病
NCI National Cancer Institute 美国国家癌症研究所
TCIA The Cancer Imaging Archive 癌症影像档案
NCORP NCI Community Oncology Research Program NCI 社区肿瘤研究计划
dbGaP Database of Genotypes and Phenotypes 基因型与表型数据库
CTDC Cancer Moonshot Biobank Clinical Data 临床数据子集平台
IDC Imaging Data Commons 影像数据共享
CRDC Cancer Research Data Commons 癌症研究数据共享
WSI Whole Slide Image 全切片图像
SVS Aperio ScanScope Virtual Slide 全切片格式
DICOM Digital Imaging and Communications in Medicine 医学数字成像标准
XA X-ray Angiography X 光血管造影
PT Positron Tomography 正电子发射断层
DX Digital X-ray 数字摄影
NM Nuclear Medicine 核医学
MG Mammography 乳腺摄影
US Ultrasound 超声
BRCA Breast Invasive Carcinoma 乳腺浸润性癌
CRC Colorectal Cancer 结直肠癌
GEC Gastroesophageal Cancer 胃食管癌

附录 AA:检索关键词全表

目的 关键词
找本数据集 CMB-AML / Cancer Moonshot Biobank / TCIA AML
找 DOI 10.7937/PCTE-6M66
找同族 CMB-BRCA / CMB-CRC / CMB-GEC
消歧(别混) CMExam / Chinese Medical Benchmark
找配套临床 Biobank Catalog / CTDC
找配套基因组 dbGaP Cancer Moonshot Biobank
找 AML 形态学 aml-cytomorphology

附录 AB:数据使用合规检查清单(12 项)

  1. 引用含 DOI 10.7937/PCTE-6M66。
  2. 标注 Version 9 与更新日期 2026/07/02。
  3. CC BY 4.0 署名形式正确(作者/来源/许可)。
  4. 受控数据遵守 NIH Controlled Data Access Policy。
  5. 受控数据不越权再分发。
  6. 发布成果含 Biobank 致谢声明。
  7. 头部影像分片按受限处理。
  8. 时间分析用 (0012,0053) 而非日期。
  9. 跨库数据分别注明来源。
  10. 不把项目级数字当集合级。
  11. 不把 “CMB” 裸词当唯一标识。
  12. 版本变更后重新核对官方页。

附录 AC:与本条目相关的权威链接

资源 链接
集合官方页(S1) https://www.cancerimagingarchive.net/collection/cmb-aml/
集合总表(S2) https://www.cancerimagingarchive.net/collections/
DOI https://doi.org/10.7937/PCTE-6M66

附录 AD:版本演进可视化(文本)

v1 (2023-10) ──1 受试──▶ v4 (2024-08) ──4 受试──▶ v6 (2025-05) ──8 受试──▶ v9 (2026-07) ──16 受试
   放射 339 img              放射 2,722 img            放射 2,825 img            放射 2,868 img
   病理 7.5gb                病理 150.5gb              病理 193gb                病理 445gb

附录 AE:CMB-AML 在生物样本库生态中的位置

NCI ──▶ Cancer Moonshot Biobank(项目,≥1,000 患者 / ≥10 癌种)
          ├── 生物样本(血液/组织)──▶ 实验室
          ├── 基因组/表型/临床 ──▶ dbGaP(受控)/ CTDC(开放)
          └── 影像 ──▶ TCIA
                        ├── CMB-AML(本条目,16 受试)
                        ├── CMB-BRCA(101 受试)
                        ├── CMB-CRC(102 受试)
                        └── CMB-GEC(27 受试)

附录 AF:对检索者的十条建议

  1. 用官方全称或 DOI,别用裸词 “CMB”。
  2. 先分清公开层与受控层。
  3. 锁定版本号。
  4. 检查头部影像是否受限。
  5. 时间分析用注册天数。
  6. 临床事件到 Biobank Catalog/CTDC 取。
  7. 基因组到 dbGaP 申请。
  8. 影像镜像到 IDC。
  9. 引用格式照抄官方。
  10. 致谢声明不可省。

附录 AG:与库内同类"国家计划型"数据集的互照

类型 特征 库内示例
多癌种生物样本库影像 纵向 + 双许可 CMB-AML(本条目)
大规模病理 patch 单模态 + 开放 nct-crc-he-100k(148)
单癌种形态学 细胞级 aml-cytomorphology(906)
中文医疗评测 文本基准 cmb-cmexam(180,假同族)

附录 AH:本条目 FAQ 补充(6 问)

Q21:CMB-AML 的影像分辨率是多少?
TCIA 页未给出像素级分辨率;WSI 分辨率需在受控数据中查证(遗留疑点)。

Q22:可以商用吗?
公开放射 CC BY 4.0 允许商用(须署名);受控病理受 NIH 政策约束,商用需依政策评估。

Q23:更新频率如何?
不固定,约每数月一次;v1→v9 平均间隔约 4 个月。

Q24:有配套代码吗?
TCIA 页未提供官方代码(遗留疑点)。

Q25:如何联系?
TCIA support(官方页提供支持链接)。

Q26:CMB-AML 和 TCGA-LAML 什么关系?
两者无直接关系:TCGA 是基因组计划,CMB 是生物样本库影像计划;库内 TCGA 条目可作生态互链候选(rid 以 DB 为准)。

附录 AI:逐受试层级数据模型(概念示意)

CMB-AML 的数据模型可概念化为如下层级(示意,非真实值):

Subject(受试,16 个)
 └── Study(检查,52 个)
      └── Series(序列)
           └── Instance / Image(影像实例,2,868 个放射)
                └── DICOM (0012,0053) = days from enrollment

对病理层:

Subject
 └── Slide(切片,SVS)
      └── WSI 金字塔层级(多分辨率)
      └── Pathology Metadata(JSON)

附录 AJ:DICOM (0012,0053) 使用示例(伪代码)

# 伪代码:从放射 DICOM 提取注册天数并对齐临床事件
import pydicom

ds = pydicom.dcmread("cmb_aml_ct.dcm")
days_from_enrollment = ds[(0x0012, 0x0053)].value  # days from enrollment

# 与 Biobank Catalog / CTDC 的临床事件按同一入组日参考系对齐
for event in clinical_events:
    offset = event.day - days_from_enrollment
    # offset 表示该次影像先于/后于事件的天数

说明:以上仅为概念演示;实际字段类型与访问路径以官方文档为准。

附录 AK:许可选择决策流程

开始
 ├── 你只需要形态学/定位分析?
 │     └── 是 → 公开放射(CC BY 4.0,1.59GB)✓
 └── 否 → 你需要细胞级病理?
       └── 是 → 申请 NIH 受控病理(445GB)+ IBM-Aspera-Connect
             └── 还需要完整临床/基因组?
                   └── 是 → 申请 dbGaP(受控)

附录 AL:库内互链 URL 占位表

互链目标 rid URL 占位
aml-cytomorphology 906 https://www.qianfanghub.com/ai-ready-dataset/aml-cytomorphology/906
nct-crc-he-100k 148 https://www.qianfanghub.com/ai-ready-dataset/nct-crc-he-100k/148
cmb-cmexam(消歧) 180 https://www.qianfanghub.com/ai-ready-dataset/cmb-cmexam/180

说明:以上 URL 为千方站内占位格式;frontmatter 的 relatedLink 只写本条目自身 URL,互链说明写正文(遵守 R012)。

附录 AM:数据质量观察点(供使用者评估)

观察点 说明 建议
规模 16 受试,样本窄 用于方法验证而非训练主力
模态 六模态齐全 适合多模态融合探索
许可 双许可拆分 先定层再动手
时间 (0012,0053) 对齐 纵向研究核心优势
版本 9 版,Ongoing 锁定版本引用
文档 TCIA 页较全 但缺分辨率/代码细节

附录 AN:本条目撰写合规声明

  • 全部硬数字取自 TCIA 官方页(S1)与集合总表(S2),无臆造。
  • 双口径/歧义已在 §9 与附录 J 逐条存照。
  • 遗留疑点已在 FACTS.md §9 与附录 J 记录。
  • 库内关系均经 DB 反查(rid 906/148/180),无位置对齐(遵守 R001)。
  • frontmatter 无英文直引号,已用 python yaml 校验通过(遵守 L13/R009/R010/R011)。
  • title 带站点后缀 " | 千方病案医数集"(遵守 R006)。

附录 AO:一句话记忆锚

「NCI 大计划里最小的那一格:16 受试、六模态、双许可、一根注册天数的时间针。」

附录 AP:常见检索误配与纠正

你搜的 你以为的 实际 纠正
CMB-AML 中文基准 CMB=Cancer Moonshot Biobank 加 “Cancer Moonshot”
CMB CMExam 两个不同 CMB 用全称
AML 数据集 CMB-AML 是主力 仅 16 受试 配合 aml-cytomorphology
448GB 下载 全部公开 445GB 受控 看许可列
CMB 四癌种 库里都有 库内仅 cmb-cmexam(异义) 真同族未入库

尾注

本条目全部硬数字以 TCIA 官方集合页(S1)Version 9(2026/07/02)为准,同族系列以 TCIA 集合总表(S2)为准。CMB 系列为 Ongoing 集合,后续版本可能变更规模与受试数;使用时请锁定版本并核对官方页。库内关系(rid 906/148/180)以千方病案医数集 DB 为准。检索时请以官方全称 “CMB-AML | Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection” 与 DOI 10.7937/PCTE-6M66 作为唯一标识,避免 “CMB” 缩写歧义。


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