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INFOBOX — CMB-AML 一屏速览
维度 内容 本质 NCI Cancer Moonshot Biobank 项目 AML 队列的 TCIA 影像子集(非独立项目、非挑战赛) 官方名 CMB-AML | Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection DOI 10.7937/PCTE-6M66 托管 The Cancer Imaging Archive (TCIA);配套数据在 dbGaP / IDC / CTDC 当前版 Version 9,更新 2026/07/02(Status: Public / Ongoing) 规模(v9) 16 受试 / 52 studies / 2,868 张放射影像;数据总量 448.08GB 模态 Histopathology, Whole Slide Image, XA, MR, CT, PT 许可 双许可:放射 CC BY 4.0(公开 1.59GB)|病理全切片 NIH Controlled Data Access Policy(受控 445GB) 关键机制 DICOM tag (0012,0053) 内嵌 “days from enrollment”,影像↔临床事件时间对齐 版本链 v1 2023/10/19 → v2 2024/03/04 → v3 2024/08/04 → v4 2024/08/28 → v5 2024/12/17 → v6 2025/05/09 → v7 2025/10/10 → v8 2026/05/29 → v9 2026/07/02 同族系列 CMB-AML / CMB-BRCA / CMB-CRC / CMB-GEC(四癌种,均 2026/07/02 更新) 库内互链 aml-cytomorphology(rid 906,AML 疾病域)、nct-crc-he-100k(rid 148,CMB-CRC 相近)、cmb-cmexam(rid 180,同名异义,勿混) 一句话 「一份生物样本库计划里最小的那一格:影像公开、病理上锁,用注册天数把两端对齐。」
CMB-AML 是一个"大计划里的小切片"。它的母体是 NCI(美国国家癌症研究所)的 Cancer Moonshot Biobank——一个目标覆盖至少 1,000 名患者、至少 10 个癌种、在多个 NCORP 社区肿瘤站点纵向采集生物样本与临床数据的宏大计划。而 CMB-AML 只是这个计划里 急性髓系白血病(AML) 那一个癌种的影像子集:Version 9 更新时,它装着 16 名受试、52 个 studies、2,868 张放射影像,总量 448.08GB。
它的两点独特之处值得先说清楚。第一,它是双许可的:你可能以为 448GB 都能直接下载,但其中 445GB 是组织病理全切片(WSI),走 NIH Controlled Data Access Policy 受控申请;真正 CC BY 4.0 公开可直取的放射部分只有 1.59GB。第二,它藏着一根"时间针":每条放射扫描的 DICOM 文件里都写着一个 tag (0012,0053)——days from enrollment(注册天数),正是这根针把 TCIA 上的影像与 Biobank Catalog 里的临床事件缝在同一根时间轴上,让"治疗前影像 vs 治疗后复发"这类纵向问题第一次有了可计算的对齐基准。
导语读法三则:
- 只想下数据:直奔 §6 获取与许可——先分清你要的是放射(公开)还是病理(受控),两者的门完全不同。
- 关心时间对齐机制:直奔 §5 与 §7——DICOM (0012,0053)、注册天数、Biobank Catalog 三段连读。
- 担心撞名:直奔 §9——CMB-AML 的 “CMB” 与库内 cmb-cmexam 的 “CMB” 不是一回事,读错会彻底走偏。
§0 导读:这个数据集解决什么问题
要理解 CMB-AML,先要理解它不是一个孤立发布的影像集,而是一个生物样本库计划的影像外设。Cancer Moonshot Biobank 的立意(S1 原文)是支持"对耐药性与敏感性的当下与未来研究",以及 NCI 资助的其他癌症研究,目标是加深研究者对癌症的理解、并干预癌症的发生与进展。为实现这点,项目在患者接受标准治疗的过程中纵向采集生物样本(医疗操作中取出的血液与组织)与关联数据,样本规模目标为至少 1,000 名患者、至少 10 个癌种,采集地点分布在多个 NCI Community Oncology Research Program(NCORP) 站点。
生物样本库的经典难题是"样本有了,但影像散落在别处"。CMB 的解法是把影像单独托管到 TCIA,并按癌种拆成集合。CMB-AML 就是 AML 这一格。它收录从 CMB-AML 队列受试者处获取的去标识化放射与组织病理影像;而配套的基因组、表型与临床数据则由 dbGaP 及其他 NCI 数据库托管(S1 原文)。
这样一来,就形成了 CMB-AML 最鲜明的两个工程特征:
特征一:数据被许可切成两半。 放射影像(XA/MR/CT/PT)走 CC BY 4.0,公开可下;组织病理与全切片影像走 NIH Controlled Data Access Policy,必须受控申请。这不是疏漏,而是病理切片更敏感、体积更大(445GB)的现实所决定的——公开的一半教你"看到什么",受控的一半才让你"看清细胞"。
特征二:时间对齐靠一个 DICOM tag。 生物样本库的影像若不与临床事件对齐,就只是孤立的图。CMB 的做法是在每份放射影像的 DICOM 里嵌入 tag (0012,0053) = days from enrollment——从入组日算起的天数。于是"第 45 天的 CT"与"第 45 天的用药记录"就能在 Biobank Catalog 里对上(S1 Introduction)。同时,为了让影像能在 DICOM 阅读器中正常显示,放射数据还保留了去标识化但保序的日期,使同一 study 内扫描之间的时间先后关系不丢失。
§0 读法三则:
- 这是"项目级(Biobank)+ 集合级(TCIA 目录)"双层结构:1,000 患者 / 10+ 癌种是项目目标,16 受试才是 CMB-AML 单集合的规模,任何把两者混用的表述都会夸大本条目。
- 全部数字标注到版本:本条目以 Version 9(2026/07/02) 为准;早期版本的受试/影像数差异已在 §4 与附录逐条存照。
- 检索这个数据集时,别用裸词 “CMB”——它会同时命中 Cancer Moonshot Biobank(本条目)与中文医疗评测基准 CMB/CMExam(库内 rid 180),两者的正确全称才唯一(§9)。
§1 数据集速览:十问十答
Q1:CMB-AML 的全名到底是什么?
官方全名为 CMB-AML | Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection(S1 页标题原文)。短名 CMB-AML 直接来自 TCIA 集合 URL。引用时使用 “Cancer Moonshot Biobank – Acute Myeloid Leukemia (CMB-AML)” 的写法(§6)。
Q2:它是谁做的?
主体是 National Cancer Institute(NCI) 主导的 Cancer Moonshot Biobank 项目;采集在多个 NCORP 站点进行;影像由 The Cancer Imaging Archive(TCIA) 托管;配套基因组/表型/临床数据托管于 dbGaP,影像镜像于 IDC,临床子集镜像于 CTDC(S1)。
Q3:规模有多大?
以当前 Version 9(2026/07/02) 计:16 受试 / 52 studies / 2,868 张放射影像;数据总量 448.08GB(S1 页顶汇总欄)。注意 16 是集合级去重受试数,放射与病理分片各有其子集。
Q4:都有什么模态?
汇总栏列出 Histopathology、Whole Slide Image、XA、MR、CT、PT 六类。其中放射部分可细分为两组:一组 XA/MR/CT(公开,CC BY 4.0),另一组 CT/MR/PT(其中头部影像标注 Restricted License,见 §6);组织病理/WSI 属受控部分(S1)。
Q5:许可为什么分成两半?
因为数据类型不同、敏感性与体量不同:放射影像走 CC BY 4.0 公开;组织病理全切片(445GB)走 NIH Controlled Data Access Policy,需受控申请(S1)。这不是临时设置,而是贯穿全版本链的稳定结构。
Q6:那个 “days from enrollment” 是什么?
是嵌在放射 DICOM 文件里的 tag (0012,0053),值是从入组(注册)日算起的天数。它让 TCIA 影像能与 Biobank Catalog 中的临床事件在时间上对齐(S1 Introduction)。这是 CMB 系列区别于普通影像集的关键设计。
Q7:版本更新有多频繁?
非常频繁且完整:从 v1(2023/10/19)到 v9(2026/07/02)共 9 个版本,平均每数月一次,每次多为"新增患者/切片"或"方法论调整(如 v3 的 ID 去前缀与 UID 哈希)"(S1 全版本表,详见 §4.3)。
Q8:CMB-AML 和别的 CMB 集合什么关系?
它们同属 Cancer Moonshot Biobank 项目,按癌种拆分:CMB-AML(白血病)、CMB-BRCA(乳腺)、CMB-CRC(结直肠)、CMB-GEC(胃食管) 四者均在 2026/07/02 更新,结构、许可与对齐机制一致(S2)。
Q9:库内有没有和它撞名的条目?
有,但不是同族:库内 cmb-cmexam(rid 180)的 “CMB” 指 Chinese Medical Benchmark(中文医疗评测基准),与本条目的 Cancer Moonshot Biobank 毫无关系(§9)。真同族是 TCIA 上的 CMB-BRCA/CRC/GEC(库内暂无)。
Q10:它适合我做什么?
适合:AML 影像-临床纵向对齐研究、多模态肿瘤影像建模、跨癌种生物样本库数据结构研究、WSI 与放射联合分析(需先取得受控病理数据)。不适合:把它当单一癌种的大规模训练主力(仅 16 受试,§9)。
§2 数据构成与规格
2.1 集合级构成:一句话拆成三层
CMB-AML 在 TCIA 上是一个 “Image Collection”(影像集合),其内部其实由许可不同的三层拼成。理解这三层,是理解本条目一切数字的前提:
| 层 | 内容 | 模态/格式 | 许可 | 体量(v9) |
|---|---|---|---|---|
| 层 A:公开放射 | 主要放射影像 | XA, MR, CT(DICOM) | CC BY 4.0 | 下载 1.59GB |
| 层 B:受限头部分片 | 头部相关放射 | CT, MR, PT(DICOM) | NIH Controlled(头部影像见 Restricted License) | 下载 1.49GB |
| 层 C:受控病理 | 组织病理 + 全切片 | Histopathology, WSI(JSON/SVS) | NIH Controlled Data Access Policy | 下载 445GB |
(数字均来自 S1 的 Version 9 数据访问表。)
这里有个容易被忽略的细节:放射部分本身也并非全部公开。v9 表把放射拆成两行,第一行 1.59GB 标 CC BY 4.0,第二行 1.49GB 标注了受限头部影像(View Images of the head (see Restricted License))。也就是说,“放射=公开"是一个近似说法,严格说是"放射中的主体公开,头部相关分片受限”。写论文引用时若不查证,很容易把头部影像误当公开数据。
2.2 受试数与子集口径
页顶汇总欄给出 Subjects = 16。但把 v9 表逐行拆开,会看到不同子集的受试数是分开列的:公开放射分片 9 受试、受限放射分片 4 受试、病理分片另计。16 是集合级去重后的口径——同一位受试可能在放射与病理部分都有数据,因此各分片受试数之和(9+4+病理)会大于 16。这一"分片 vs 集合"的双口径在 §4.4 与附录 S 有专门登记表。
2.3 模态与格式
- 放射模态:XA(X 光血管造影)、MR(磁共振)、CT(计算机断层)、PT(PET 正电子发射断层)。覆盖了从形态学到代谢的多层次成像。
- 病理模态:Histopathology(组织病理)与 Whole Slide Image(全切片图像)。
- 格式:放射为 DICOM;病理为 JSON + SVS(SVS 是 Aperio 系全切片格式)。
- 下载工具:放射需 TCIA Data Retriever;病理需 IBM-Aspera-Connect plugin(S1)。工具不同,是判断"你正在下的是哪一层"的实用标志。
2.4 时间元数据:藏在 DICOM 里的对齐针
CMB-AML 最有价值的规格不在图像分辨率,而在一个元数据 tag:
- DICOM tag (0012,0053) 内嵌 “days from enrollment (registration)”——从入组日算起的天数(S1 Introduction)。
- 作用:让 TCIA 上的影像与 Biobank Catalog 里的临床事件数据在时间上对齐。
- 补充机制:为了让影像在 DICOM 阅读器中正常显示,放射数据还保留了去标识化但保序的日期,确保同一 study 内扫描的先后关系不丢(S1 Note)。
这意味着研究者可以问出"第 N 天的影像对应哪次治疗/哪次复发"这类问题——而普通影像集只能给出一个孤立的采集时刻。
2.5 生物样本与配套数据的分工
CMB-AML 是"影像抽屉",不是"全数据抽屉"。完整拼图需要四处:
- TCIA(本条目):去标识化影像。
- dbGaP:基因组、表型与完整临床数据(受控访问)。
- CTDC(Cancer Moonshot Biobank):临床数据子集(开放访问)。
- IDC(Imaging Data Commons):影像(镜像/互通)。
(S1 External Resources 原文列出前三条,IDC/CRDC 作为更大基础设施。)
§3 CMB 项目与四癌种系列:家族图谱
3.1 母体:Cancer Moonshot Biobank
Cancer Moonshot Biobank 是 NCI 倡议,其定位(S1 原文)是"支持对耐药性与敏感性的当下与未来研究以及其他 NCI 资助的癌症研究",目标是增进研究者对癌症的理解、并干预癌症的发生与进展。执行方式:在患者接受标准治疗的过程中,纵向采集生物样本(血液 + 组织)与关联数据。规模目标:至少 1,000 名患者 / 至少 10 个癌种;地点:多个 NCORP 社区肿瘤站点。
这里必须强调一个口径纪律:1,000 患者 / 10+ 癌种是项目级目标,涵盖整个 Biobank;CMB-AML 只是其中 AML 一个癌种的影像子集,规模是 16 受试。把项目数字安到集合头上是常见错误(§8 坑 2)。
3.2 CMB 四癌种系列(TCIA 实测)
截至 2026/07/02,TCIA 上共有四个 CMB 影像集合(S2 集合总表):
| TCIA 集合 | 癌种(英文) | 癌种(中文) | 受试 | 模态 | 状态/更新 |
|---|---|---|---|---|---|
| CMB-AML | Acute Myeloid Leukemia | 急性髓系白血病 | 16 | Histopathology, WSI, XA, MR, CT, PT | Public / Ongoing, 2026/07/02 |
| CMB-BRCA | Breast Invasive Carcinoma | 乳腺浸润性癌 | 101 | Histopathology, WSI, MR, CT, MG, US, PT | Public / Ongoing, 2026/07/02 |
| CMB-CRC | Colorectal Cancer | 结直肠癌 | 102 | Histopathology, WSI, MR, CT, PT, US, NM, DX, XA | Public / Ongoing, 2026/07/02 |
| CMB-GEC | Gastroesophageal Cancer | 胃食管癌 | 27 | CT, MR, PT, Histopathology, WSI | Public / Ongoing, 2026/07/02 |
四点观察:
- 同一时间更新:四个集合均在 2026/07/02 更新,说明 Biobank 影像是统一发布节奏。
- 结构同构:四者都含 Histopathology + WSI + 放射模态,共享"双许可 + 注册天数对齐"的设计。
- 规模梯度:BRCA(101)与 CRC(102)是主力,GEC(27)次之,AML(16)最小——这与各癌种在 Biobank 中的入组分布相关。
- 模态丰度差异:CMB-CRC 的模态最多(含 NM 核医学、DX 数字摄影),CMB-GEC 以 CT/MR/PT 为主。
3.3 与库内同类项目的坐标系
CMB-AML 在千方库内属于"大型国家计划 + 多癌种生物样本库影像"这一族。可与以下类型互照:
- AML 疾病域:
aml-cytomorphology(rid 906)——同为 AML,但那是慕尼黑单细胞形态图像(cytomorphology,细胞形态学涂片),CMB-AML 是临床多模态影像(放射+病理)。两者是 AML 数据的两端:一端是细胞,一端是患者。 - 结直肠癌病理域:
nct-crc-he-100k(rid 148)——可与 CMB-CRC 形成"同癌种、不同设计"对照(NCT-CRC 是 10 万张结直肠癌 H&E patch,CMB-CRC 是 102 受试的临床纵向影像)。 - 假同族:
cmb-cmexam(rid 180)不属于本族(C=Chinese Medical Benchmark),仅作检索歧义警示(§9)。
§4 规模与版本链:448.08GB 是怎么长出来的
4.1 当前版硬数字(Version 9 × 2026/07/02)
- 受试:16
- Studies:52
- Images(放射):2,868
- 数据总量:448.08GB
- 模态:Histopathology, Whole Slide Image, XA, MR, CT, PT
- 地点:Blood;物种:Human
- 数据类别:Acute Myeloid Leukemia
- 状态:Public / Ongoing
- Views:12.8k
(以上为 S1 页顶汇总欄与 v9 访问表的直取数字。)
4.2 448.08GB 的内部配比
总量 448.08GB 中,445GB 是受控病理切片,公开放射仅 1.59GB(外加 1.49GB 受限头部放射)。换句话说:
- 病理部分占总量 约 99.3%;
- 公开可下的放射部分仅占 约 0.35%。
这个极端配比正是"双许可"存在的物质基础:体量最大的那部分恰恰是最敏感、最需要受控的。它也给"我以为能直接下 448GB"的使用者一个直接提醒(§8 坑 1)。
4.3 全版本链(S1 逐版实测)
| 版本 | 更新日期 | 版本说明与计数变化 |
|---|---|---|
| v1 | 2023/10/19 | 首发。放射 1 受试 / 2 studies / 6 series / 339 images(XA, CT);病理 1 受试 / 3 slides |
| v2 | 2024/03/04 | 追加既有患者数据。放射 1/5/15/687;病理 1/3/15/995 |
| v3 | 2024/08/04 | 放射 Patient ID 去前缀(CMB-AML-MSB-##### → MSB-#####);study/series/SOP/referenced SOP UID 全部哈希化;计数与 v2 同(1/5/15/687;1/3/15/995) |
| v4 | 2024/08/28 | Additional data。放射 4 受试 / 11 / 38 / 2,722;病理 4/10/65/3,704 |
| v5 | 2024/12/17 | 追加既有患者 5 张病理切片。放射 4/11/38/2,722;病理 4/10/65/3,704 |
| v6 | 2025/05/09 | 5 新放射患者 + 既有补数据;2 新病理患者 + 5 新切片。放射 8/15/49/2,825;病理 5/11/69/4,980 |
| v7 | 2025/10/10 | 5 新组织病理患者 + 8 新组织病理切片。放射 8/15/49/2,825;病理 5/11/69/4,980 |
| v8 | 2026/05/29 | Updated Restricted imaging portion(更新受限影像部分)。放射 8/15/49/2,825;病理 4/10/65/3,704 |
| v9 | 2026/07/02 | 当前版。1 新放射患者 + 既有 2 病理患者追加(5 新切片)。放射合计 9 + 4 = 16 受试 / 52 studies / 2,868 images |
4.4 版本链里的三条规律(也是三个坑)
- 受试数只增不减,但分片结构会变:从 v1 的 1 受试一路涨到 v9 的 16 受试。但注意 v8 的病理分片从 v7 的 5 受试"退回"到 4 受试——这不是删除数据,而是 v8 明确"更新了受限影像部分"后,病理分片的呈现口径发生了变化。引用务必锁定版本,否则数字对不上。
- v2 与 v3 计数完全相同:两版放射/病理计数一致,差异在 v3 的方法论变更(ID 去前缀 + UID 哈希化),不涉及数据量变化(S1 v3 说明)。看到"v2=v3"别以为抓错了。
- 病理分片受试数在部分版本行未单列:v9 的病理行在抓取内容中未明确给出受试数(仅显示格式与体量)。这是本条目的一处遗留疑点(附录 S 登记)。
§5 时间对齐机制:一根 DICOM 针缝合影像与临床
5.1 问题的来源
生物样本库的影像若不能与临床事件对齐,价值会大打折扣:你不知道这张 CT 是"确诊前"还是"耐药后"拍的,就无法用它研究疾病轨迹。CMB-AML 的解法是把"时间"直接写进影像文件本身。
5.2 机制明细
核心机制(S1 Introduction 原文):
- Biobank 在 TCIA 上的放射影像,每条扫描都含 “days from enrollment (registration)”,即从入组日算起的天数;
- 该值嵌入 DICOM tag (0012,0053);
- 作用:实现 TCIA 影像与 Biobank Catalog 中临床事件数据的时间对齐。
辅助机制(S1 Note 原文):
- 为使影像在 DICOM 阅读器中正常显示,放射数据还保留去标识化日期;
- 这些日期保持同一 study 内扫描之间的时间序列关系(保序但非真实日期)。
5.3 为什么这两个机制要并存
表面看 (0012,0053) 与"去标识化日期"功能重叠,实则分工不同:
- (0012,0053) = 与临床数据的桥梁:给出相对入组日的绝对天数,从而可与 Biobank Catalog 的临床事件对齐——这是跨数据源的语义锚点。
- 去标识化保序日期 = DICOM 阅读器可用性:很多 DICOM 阅读器依赖日期字段排序显示,若日期全部清空会显示异常;保留保序假日期,既满足合规(去标识化)又满足工程(可读)。
一句话:一个是给临床科学家用的(对齐),一个是给软件用的(显示)。
5.4 这套机制能支持什么研究
- 纵向轨迹建模:把同一受试的多次影像按注册天数排序,构建影像时间序列。
- 治疗-影像配对:将特定治疗事件(来自 Biobank Catalog/CTDC/dbGaP)映射到治疗前后的影像。
- 耐药/敏感性研究:这正是 Biobank 立项的初衷(S1)——把"影像表型变化"与"耐药发生"挂钩。
- 多模态融合:放射 + 病理 + 基因组在同一时间轴上联合分析。
5.5 使用注意
- 平台边界:(0012,0053) 只对放射影像明确说明;病理全切片(WSI)的时间对齐方式需另行核验(遗留疑点)。
- 数据源边界:临床事件明细不在 TCIA,需到 Biobank Catalog / CTDC / dbGaP 取,且后两者的访问门槛不同(CTDC 开放、dbGaP 受控)。
§6 获取与许可:双层双工具的门怎么进
6.1 结构总览
CMB-AML 的获取是"两层许可 + 两把工具":
| 层 | 许可 | 访问方式 | 下载工具 | v9 体量 |
|---|---|---|---|---|
| 放射(主体) | CC BY 4.0 | 公开直取 | TCIA Data Retriever | 1.59GB |
| 放射(头部) | NIH Controlled(Restricted License) | 受控 | TCIA Data Retriever | 1.49GB |
| 病理/全切片 | NIH Controlled Data Access Policy | 受控申请 | IBM-Aspera-Connect plugin | 445GB |
6.2 关键要点
- 公开放射走 CC BY 4.0:署名合规后可直接下载、可用、可再分发(须保留署名与 DOI)。
- 病理切片走 NIH Controlled Data Access Policy:需受控申请,非公开直取。这是体量最大、也最敏感的部分。
- 头部放射影像也受限:即使属放射层,头部影像分片仍标注 Restricted License(S1 v9 表)。别把"放射"一刀切当公开。
- 两把工具别搞混:放射用 TCIA Data Retriever,病理用 IBM-Aspera-Connect plugin。
6.3 配套数据的门(TCIA 之外)
- dbGaP:基因组、表型与完整临床数据——受控访问(S1)。
- CTDC(Cancer Moonshot Biobank):临床数据子集——开放访问(S1)。
- IDC(Imaging Data Commons):影像——CRDC 基础设施的一部分(S1)。
因此,一个完整研究可能需要在 TCIA(影像)、CTDC(临床开放子集)、dbGaP(基因组/完整临床受控)三处分别取证与申请。
6.4 引用与致谢(合规硬要求)
数据引用(S1 原文,须含 DOI):
Cancer Moonshot Biobank. (2023). Cancer Moonshot Biobank – Acute Myeloid Leukemia (CMB-AML) (Version 9) [dataset]. The Cancer Imaging Archive. https://doi.org/10.7937/pcte-6m66
致谢声明(S1 原文,Biobank 项目要求):
“Data used in this publication were generated by the National Cancer Institute’s Cancer Moonshot Biobank”
硬约束:TCIA 标注 Data Citation Required,使用者须遵守 TCIA Data Usage Policy and Restrictions,署名须含上述引用(含 DOI)(S1)。省略致谢声明是不合规的。
6.5 与其他类型许可的对照
| 类型 | 代表条目 | 获取门 |
|---|---|---|
| 完全开放下载 | nct-crc-he-100k(rid 148,H&E patch) | 公开直链 |
| 双许可(公开+受控) | CMB-AML(本条目) | 放射公开 / 病理与头部受控 |
| 请求制 | aml-cytomorphology(rid 906,需申请) | 邮件/表单申请 |
| 受控访问 | dbGaP 托管类型 | 机构受控申请 |
CMB-AML 的价值恰在于它同时展示公开与受控两端的对比,是研究"数据开放光谱"的教科书样本。
§7 任务与用法:能拿 CMB-AML 做什么
7.1 直接任务
- AML 影像-临床对齐研究:利用 (0012,0053) 注册天数,把影像序列与临床事件在时间轴对齐。
- 纵向影像轨迹建模:同一受试多次扫描的时序分析(需受控数据完整版)。
- 多模态肿瘤影像建模:放射(XA/MR/CT/PT)+ 病理(WSI)联合表示学习。
- 计算病理:WSI 分类/分割(需先取得受控病理数据)。
- 生物样本库数据科学:跨库(TCIA/dbGaP/CTDC/IDC)数据整合方法研究。
7.2 用法要点
- 先定层:想清楚你要的是公开放射(1.59GB)还是受控病理(445GB),两者路径完全不同。
- 锁定版本:引用与实验记录必须写明 “Version 9, updated 2026/07/02”,否则他人无法复现。
- 合规:公开部分依 CC BY 4.0 署名;受控部分遵守 NIH Controlled Data Access Policy 与 TCIA 政策;发布成果含 Biobank 致谢声明。
- 时间锚点:任何涉及"治疗前后"的分析,都必须通过 (0012,0053) 而非文件名/日期推断时间来定位。
7.3 与其他 AML / CRC 资源的分工
- 对照
aml-cytomorphology(rid 906):细胞形态学 vs 临床影像——前者研究"细胞长什么样",后者研究"患者经历了什么"。 - 对照
nct-crc-he-100k(rid 148):与 CMB-CRC 对照,理解"大规模 patch 分类数据集"与"小规模临床纵向集合"的不同设计目标。 - 对照大型国家计划:CMB 系列在理念上与 All of Us、AACR GENIE 等"多癌种国家队列"同族,但聚焦影像与生物样本的横向连接。
§8 避坑清单:八个已踩过的坑
坑 1:以为 448.08GB 都能直接下载。
CMB-AML 的 448.08GB 里,445GB 是走 NIH Controlled Data Access Policy 的病理切片,真正 CC BY 4.0 公开直下的放射只有 1.59GB。把"总量"当"可下量"会严重误判工作量。分层的正确说法见 §2.1。
坑 2:把 CMB 项目数字(1,000 患者 / 10+ 癌种)当成 CMB-AML 的规模。
1,000 患者 / 10+ 癌种是 Cancer Moonshot Biobank 项目级目标,涵盖整个 Biobank 所有癌种。CMB-AML 单个集合只有 16 受试。二者相差约两个数量级,混用会夸大本条目数据量近 60 倍。
坑 3:把放射一律当公开。
v9 表把放射拆成两行:一行 CC BY 4.0(1.59GB),一行标注 Restricted License(头部影像)(1.49GB)。"放射=CC BY 4.0"是近似说法,头部相关分片受限。引用开放范围时必须核对到分片。
坑 4:撞上 “CMB” 同名缩写。
本条目 CMB = Cancer Moonshot Biobank;库内 cmb-cmexam(rid 180)CMB = Chinese Medical Benchmark(中文医疗评测基准)。两者同名缩写、同两字母,检索极易混淆。正确全称才唯一(§9)。
坑 5:忽略版本口径,导致数字对不上。
CMB-AML 有 9 个版本,计数随版本变化(v1 仅 1 受试 339 images;v9 16 受试 2,868 images)。且 v8 病理分片受试从 v7 的 5 退回 4(受限部分更新所致)。任何引用必须写明版本号 + 更新日期,否则与他人的数字必然冲突。
坑 6:以为 v2 和 v3 抓重了。
v2(2024/03/04)与 v3(2024/08/04)的放射/病理计数完全相同(1/5/15/687;1/3/15/995),差异在 v3 做了 ID 去前缀 + UID 哈希化的方法论变更(S1 v3 说明)。看到"连续两版数字一样"要想到是元数据改造而非数据量变化。
坑 7:把项目级与集合级、分片级三级口径混用。
CMB-AML 至少有三级数字口径:项目级(1,000+ 患者)→ 集合级(16 受试)→ 分片级(公开放射 9 受试 / 受限放射 4 受试 / 病理另计)。三级之和与去重值不等(同一受试可跨层出现)。逐级标注口径是唯一不出错的写法。
坑 8:以为临床/基因组数据也在 TCIA。
TCIA 只托管影像。基因组、表型与完整临床数据在 dbGaP(受控),临床子集在 CTDC(开放),影像镜像在 IDC。想在 TCIA 一站点拿齐所有数据会落空(S1 External Resources)。
§9 与库内条目的关系
9.1 家族图谱
CMB-AML 在千方库内没有直接同族(TCIA 的 CMB-BRCA/CRC/GEC 尚未入库),但有多条关联线与一条高危歧义线:
| 库内条目 | rid | 关系类型 | 说明 |
|---|---|---|---|
aml-cytomorphology |
906 | 疾病域同族(AML) | 慕尼黑白血病单细胞形态图像;与 CMB-AML 构成"细胞形态 vs 临床影像"的两端 |
nct-crc-he-100k |
148 | 癌种/模态相近(结直肠癌病理 patch) | 可与 CMB-CRC 对照;理解"大规模 patch 分类"vs"小规模临床纵向集合" |
cmb-cmexam |
180 | ⚠️ 假同族(同名缩写) | “CMB”=Chinese Medical Benchmark,与 Cancer Moonshot Biobank 无任何关系;仅作检索歧义警示 |
hamlyn-datasets |
383 | 无关(LIKE 子串噪声) | LIKE ‘%aml%’ 命中 hamlyn 子串,非 AML 相关 |
9.2 建议互链点(库内条目 + rid)
- aml-cytomorphology(rid 906):AML 疾病域主互链。同病、异模态,互补性强。
- nct-crc-he-100k(rid 148):经 CMB-CRC 的桥梁互链(跨癌种病理方法对照)。
- 若日后入库 CMB-BRCA / CMB-CRC / CMB-GEC,应作为真同族优先互链(当前库内暂无)。
- 大型国家队列类条目(如 all-of-us、aacr-genie 等,若已入库)可作生态互链候选——rid 以主会话 DB 反查为准(R001 纪律:rid→slug 用 url_name 反查,绝不用位置对齐)。
9.3 检索路径建议
- 要 AML 影像:
CMB-AML/Cancer Moonshot Biobank/TCIA AML。 - 要中文医疗评测:
CMB会误导——应检索CMExam/Chinese Medical Benchmark。 - 要 AML 形态学:
aml-cytomorphology/AML cytomorphology。 - 要 CMB 其他癌种:
CMB-BRCA/CMB-CRC/CMB-GEC(TCIA,库内暂无)。
9.4 与库内家族的血缘声明
CMB-AML 与 CMB-BRCA/CRC/GEC 是"同项目、同结构、同更新节奏"的真同族(S2)。它们与库内 cmb-cmexam 属于纯同名巧合,正文(本节)明确消歧,frontmatter 的 relatedLink 只保留纯 URL、不写任何说明文字(遵守 R012)。
§10 DAIMS 评估与 AI-Ready 就绪度
10.1 DAIMS 全表
DAIMS(Data and AI Model Initiative for Medicine/Standards)用于评估数据集对 AI 训练的适配度。CMB-AML 逐维度评估如下:
| 维度 | 评分(★1-5) | 依据 |
|---|---|---|
| 数据可获得性 | ★★★☆☆ | 双许可:放射公开、病理受控;分片获取路径清晰但有门槛 |
| 规模充分性 | ★★☆☆☆ | 仅 16 受试 / 2,868 放射影像;单癌种样本极窄 |
| 模态丰富度 | ★★★★★ | Histopathology/WSI/XA/MR/CT/PT 六模态,跨形态学到代谢 |
| 标注/元数据质量 | ★★★★☆ | DICOM (0012,0053) 注册天数时间对齐;病理带 Pathology Metadata |
| 纵向性 | ★★★★☆ | 生物样本库核心设计,含治疗前后多次采集 |
| 许可清晰度 | ★★★★★ | 双许可边界明确,引用与致谢规范成文 |
| 版本可追溯性 | ★★★★★ | 9 版完整链,每版说明清楚,更新日期明确 |
| 跨库整合性 | ★★★★☆ | TCIA/dbGaP/CTDC/IDC 四库分工清晰,但需跨库导航 |
| 文档完备度 | ★★★★☆ | TCIA 页含 Introduction、Data Access、External Resources、引用政策 |
| 社区活跃度 | ★★☆☆☆ | TCIA 显示 12.8k views;无官方 benchmark/leaderboard |
| 伦理合规性 | ★★★★★ | 去标识化、受控访问、明确的使用政策与致谢要求 |
| 可复现性 | ★★★☆☆ | 版本锁定后影像可复现;临床/基因组受控部分可复现性受申请制约 |
10.2 就绪度小结
优点:模态最丰富、许可最清晰、版本链最完整、时间对齐机制独到——是一个工程质量高、治理规范的生物样本库影像集合。
短板:规模小(16 受试)是硬伤,适合做方法验证、数据整合示范、纵向对齐研究,但不适合作为单一癌种的大规模训练主力。
一句话定位:CMB-AML 是"小而规范、多模态齐全、时间对齐独到"的生物样本库影像切片——它的价值在方法与治理,而非体量。
10.3 与其他条目的 DAIMS 对照提示
- 同类标杆(大规模):
nct-crc-he-100k(rid 148)在规模维度远超 CMB-AML(10 万 patch),但模态单一(仅有 H&E patch),无纵向临床。 - 同类标杆(AML):
aml-cytomorphology(rid 906)在 AML 域互补,但聚焦形态学单细胞,无患者级影像轨迹。 - 结论:CMB-AML 的不可替代性在于 “患者级 + 多模态 + 时间对齐 + 双许可治理” 的组合,而非任何单项维度的绝对优势。
§11 总结
11.1 三句话总结
- CMB-AML 是 NCI Cancer Moonshot Biobank 项目 AML 队列在 TCIA 上的影像子集,官方名 CMB-AML | Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection,DOI 10.7937/PCTE-6M66。
- Version 9(2026/07/02)规模为 16 受试 / 52 studies / 2,868 张放射影像 / 448.08GB,模态含 Histopathology、WSI、XA、MR、CT、PT。
- 它的两个标志性特征是双许可结构(放射 CC BY 4.0 公开 / 病理全切片 445GB 走 NIH 受控)与时间对齐机制(DICOM tag (0012,0053) 内嵌 “days from enrollment”)。
11.2 适合谁
- 肿瘤影像-临床对齐研究者:需要把影像与临床事件挂上时间轴。
- 多模态肿瘤建模团队:需要放射 + 病理联合的临床数据。
- 生物样本库数据科学家:研究跨库(TCIA/dbGaP/CTDC/IDC)数据整合。
- 计算病理团队:可申请受控 WSI 数据做 AML 病理分析。
- 数据治理/开放科学研究:CMB-AML 是"公开+受控"双层许可的范本。
11.3 不适合谁
- 寻找单一癌种大规模训练集者:16 受试太小,应转向 TCGA/CPTAC 等。
- 不愿走受控申请流程者:主要体量(病理)在受控门后。
- 只想要纯图像 patch 者:CMB-AML 是患者级临床影像,不是 patch 库。
11.4 30 秒决策卡
| 你的需求 | 结论 |
|---|---|
| 要 AML 多模态临床影像 | 选它(放射公开即可开始) |
| 要 AML 大规模训练集 | 不选(仅 16 受试),配合其他 AML 数据 |
| 要 AML 病理 WSI | 选它,但须走 NIH 受控申请 |
| 要中文医疗评测基准 | 不选(那是 CMExam,别混淆) |
| 要研究影像-临床时间对齐 | 选它((0012,0053) 机制独到) |
FAQ(高频问答 20 问)
A. 基础认知
Q1:CMB-AML 是数据集还是项目?
是数据集(TCIA 集合),属于一个大项目(Cancer Moonshot Biobank)的 AML 影像子集。
Q2:官方全名?
CMB-AML | Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection。
Q3:谁发布的?
NCI 的 Cancer Moonshot Biobank 项目,影像托管于 TCIA。
Q4:DOI 是什么?
10.7937/PCTE-6M66。
Q5:CMB 是什么意思?
Cancer Moonshot Biobank(癌症登月生物样本库)。注意与库里 CMExam 的 “Chinese Medical Benchmark” 不同。
B. 数据与规模
Q6:有多少受试?
集合级 16 受试(Version 9)。
Q7:有多少影像?
2,868 张放射影像(52 studies)。病理有独立的全切片计数。
Q8:总量多大?
448.08GB。
Q9:有哪些模态?
Histopathology、Whole Slide Image、XA、MR、CT、PT。
Q10:有多少个版本?
9 个,从 v1(2023/10/19)到 v9(2026/07/02)。
C. 许可与获取
Q11:能直接下载吗?
公开放射部分(1.59GB)可以;病理全切片(445GB)与头部放射需受控申请。
Q12:为什么分两半?
数据类型不同:放射公开(CC BY 4.0),病理敏感且体量大(NIHC 受控)。
Q13:怎么下载放射?
TCIA Data Retriever。
Q14:怎么下载病理?
IBM-Aspera-Connect plugin + 受控申请。
Q15:临床/基因组数据在哪?
dbGaP(受控)、CTDC(开放子集)、IDC(影像)。
D. 时间对齐
Q16:days from enrollment 是什么?
DICOM tag (0012,0053),从入组日算起的天数。
Q17:为什么重要?
让影像与 Biobank Catalog 的临床事件时间对齐。
Q18:病理切片也有这机制吗?
TCIA 页对放射明确说明;病理的时间对齐方式需另行核验(遗留疑点)。
E. 库内关系
Q19:库内 cmb-cmexam 是同一系列吗?
不是。“CMB” 在库内是 Chinese Medical Benchmark,与本条目无关系。
Q20:库内哪些 AML 条目相关?
aml-cytomorphology(rid 906,AML 细胞形态),与本条目构成疾病域互补。
事实清单(硬事实 30 条)
- 官方名:CMB-AML | Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection(S1)。
- DOI:10.7937/PCTE-6M66(S1)。
- 当前版本:Version 9,更新 2026/07/02(S1)。
- 受试数:16(S1)。
- Studies:52(S1)。
- 放射影像数:2,868(S1)。
- 数据总量:448.08GB(S1)。
- 地点:Blood;物种:Human(S1)。
- 数据类别:Acute Myeloid Leukemia(S1)。
- 状态:Public / Ongoing(S1)。
- 模态:Histopathology, Whole Slide Image, XA, MR, CT, PT(S1)。
- 公开放射下载体量:1.59GB(CC BY 4.0)(S1)。
- 受限头部放射下载体量:1.49GB(Restricted)(S1)。
- 受控病理下载体量:445GB(NIH Controlled)(S1)。
- 公开放射受试:9(S1 v9 表)。
- 受限放射受试:4(S1 v9 表)。
- 时间对齐 tag:(0012,0053)(S1 Introduction)。
- 对齐语义:days from enrollment / registration(S1)。
- 保留去标识化保序日期(S1 Note)。
- 放射下载工具:TCIA Data Retriever(S1)。
- 病理下载工具:IBM-Aspera-Connect plugin(S1)。
- 项目目标:≥1,000 患者 / ≥10 癌种(S1)。
- 采集站点:多个 NCORP 站点(S1)。
- 基因组/表型/完整临床:dbGaP 受控(S1)。
- 临床子集:CTDC 开放(S1)。
- 影像镜像:IDC(S1)。
- 引用要求:Data Citation Required,含 DOI(S1)。
- 致谢声明:Data used…generated by NCI’s Cancer Moonshot Biobank(S1)。
- 同族四癌种:AML/BRCA/CRC/GEC,均 2026/07/02 更新(S2)。
- CMB-BRCA=101、CMB-CRC=102、CMB-GEC=27 受试(S2)。
术语表(18 条)
- CMB-AML:Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection,本文主角。
- Cancer Moonshot Biobank(CMB):NCI 主导的多癌种纵向生物样本库项目。
- NCI:National Cancer Institute,美国国家癌症研究所。
- TCIA:The Cancer Imaging Archive,癌症影像档案,影像托管方。
- AML:Acute Myeloid Leukemia,急性髓系白血病。
- NCORP:NCI Community Oncology Research Program,社区肿瘤研究网络。
- dbGaP:The Database of Genotypes and Phenotypes,基因型与表型数据库。
- CTDC:Cancer Moonshot Biobank 的临床数据子集开放平台。
- IDC:Imaging Data Commons,影像数据共享基础设施。
- CRDC:Cancer Research Data Commons,NCI 数据共享生态。
- DICOM:医学数字成像与通信标准,放射影像格式。
- DICOM tag (0012,0053):临床试次标识相关 tag,此处承载 days from enrollment。
- days from enrollment:从入组日算起的天数,CMB 时间对齐锚点。
- WSI:Whole Slide Image,全切片图像。
- SVS:Aperio 系全切片图像格式。
- Histopathology:组织病理学。
- XA:X-ray Angiography,X 光血管造影。
- NIH Controlled Data Access Policy:NIH 受控数据访问政策,病理切片的访问门。
附录
附录 A:条目信息速查卡
| 项 | 值 |
|---|---|
| slug | cmb-aml |
| 官方名 | CMB-AML \ |
| DOI | 10.7937/PCTE-6M66 |
| 版本 | Version 9(2026/07/02) |
| 受试/studies/影像 | 16 / 52 / 2,868 |
| 总量 | 448.08GB |
| 模态 | Histopathology, WSI, XA, MR, CT, PT |
| 许可 | 双许可:放射 CC BY 4.0 / 病理 NIH 受控 |
| 时间对齐 | DICOM (0012,0053) days from enrollment |
| 库内互链 | aml-cytomorphology(906), nct-crc-he-100k(148) |
附录 B:DAIMS 评估全表
见 §10.1(12 维度评分表),此处不重复。
附录 C:逐项证据链自证
| 事实 | 证据来源 |
|---|---|
| 官方名/DOI/规模 | S1 页顶汇总欄 |
| v9 分片与许可 | S1 Version 9 数据访问表 |
| 全版本链 | S1 各版本段落 |
| 时间对齐机制 | S1 Introduction 与 Note |
| 项目背景(1,000 患者/10 癌种/NCORP) | S1 Introduction |
| 配套数据托管方 | S1 External Resources |
| 引用与致谢 | S1 Citations & Data Usage Policy |
| 四癌种系列 | S2 集合总表 |
| 库内撞名与相关 | DB 查询(rid 180/906/148) |
附录 D:数据获取决策树
- 你要放射还是病理?
- 放射 → 到 TCIA 用 Data Retriever;注意头部影像受限。
- 病理 → 申请 NIH Controlled Data Access;用 IBM-Aspera-Connect 下载。
- 你要临床/基因组吗?
- 开放子集 → CTDC;完整/受控 → dbGaP。
- 你要影像镜像 → IDC。
- 引用时写入 Version 9 + DOI + 致谢声明。
附录 E:时间对齐使用规范
- 用 (0012,0053) 的天数,而非文件名/日期推断时间来定位扫描。
- 跨库对齐时,以 Biobank Catalog 的临床事件为准。
- 保序假日期仅用于 DICOM 显示排序,不可当作真实日期。
附录 F:双许可登记表
| 层 | 许可 | 体量 | 下载工具 | 是否公开 |
|---|---|---|---|---|
| 公开放射 | CC BY 4.0 | 1.59GB | TCIA Data Retriever | 是 |
| 受限放射(头部) | Restricted | 1.49GB | TCIA Data Retriever | 否 |
| 病理全切片 | NIH Controlled | 445GB | IBM-Aspera-Connect | 否 |
附录 G:版本链登记表
见 §4.3 全表(v1-v9)。
附录 H:CMB 四癌种登记表
见 §3.2 全表。
附录 I:CMB-AML 与 cmb-cmexam 消歧表
| 项 | CMB-AML(本条目) | cmb-cmexam(rid 180) |
|---|---|---|
| CMB 全称 | Cancer Moonshot Biobank | Chinese Medical Benchmark |
| 类型 | 影像集合 | 中文医疗评测基准 |
| 宿主 | TCIA(NCI) | 中文基准(问答/考试) |
| 关系 | — | 无关系(同名巧合) |
附录 J:双口径登记表
| 口径 | 数值 | 来源 |
|---|---|---|
| 项目级受试目标 | ≥1,000 患者 / ≥10 癌种 | S1 Introduction |
| 集合级受试 | 16 | S1 页顶 |
| 公开放射受试 | 9 | S1 v9 表 |
| 受限放射受试 | 4 | S1 v9 表 |
| 病理受试(v9 概要行) | 未单列(遗留疑点) | S1 v9 表 |
| 放射影像数 | 2,868 | S1 v9 表 |
| 总量 | 448.08GB | S1 页顶 |
附录 K:许可条款细读
- CC BY 4.0(公开放射):可共享、可改编,须署名、须含 DOI、须标示修改、不得暗示背书。
- NIH Controlled(病理/头部):须受控申请、遵守访问政策、限制再分发。
- TCIA Data Usage Policy:Data Citation Required,须遵守 Restrictions。
附录 L:证据来源清单
- S1: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/cmb-aml/
- S2: https://www.cancerimagingarchive.net/collections/
- 失败源: https://www.cancerimagingarchive.net/cancer-moonshot-biobank-imaging/(404)
附录 M:与库内 aml-cytomorphology 的关系声明
aml-cytomorphology(rid 906)是慕尼黑白血病单细胞形态图像,与 CMB-AML 同属 AML 疾病域但模态与设计不同(细胞形态 vs 患者临床影像)。二者互补,建议正文互链。
附录 N:检索关键词组合
CMB-AML Cancer Moonshot BiobankTCIA Acute Myeloid Leukemia CMB10.7937/PCTE-6M66Cancer Moonshot Biobank imaging- 消歧:
CMExam Chinese Medical Benchmark(区别于本条目)
附录 O:坑点档案
见 §8 全表(坑 1-8)。
附录 P:维护计划与触发点
- CMB 系列为 Ongoing,随版本更新刷新规模数字。
- 触发点:TCIA 发布 v10 时,更新 §4 数字并追加版本链行。
- 触发点:CMB-BRCA/CRC/GEC 入库千方时,补真同族互链。
附录 Q:缩写速查
见术语表(§术语表 18 条)。此处不重复。
附录 R:本条目生产档案
- 代理:agent-a-cmbaml
- 开工:2026-10-09T10:00
- 来源:WebFetch 2 次成功、1 次 404(均在预算内)
- 分片:5 部分拼装
- slug 查重:无撞库(cmb-cmexam 为假同族)
附录 S:基于本数据集的检查清单(10 项)
- 确认版本号与更新日期。
- 区分要取的是公开放射还是受控病理。
- 检查头部影像是否落在受限分片。
- 用 (0012,0053) 而非日期做时间锚点。
- 临床事件以 Biobank Catalog 为准。
- 跨库取证:TCIA/dbGaP/CTDC/IDC。
- 遵守 CC BY 4.0 署名(含 DOI)。
- 受控数据遵守 NIH 政策。
- 发布成果含 Biobank 致谢声明。
- 来源全称避免 “CMB” 裸词歧义。
附录 T:AML 数据资源坐标
| 资源 | 类型 | 粒度 | 库内 |
|---|---|---|---|
| CMB-AML | 临床多模态影像 | 患者级 | 本条目 |
| aml-cytomorphology | 单细胞形态图像 | 细胞级 | rid 906 |
| 未来 CMB 同族 | 临床影像 | 患者级 | 待入库 |
附录 U:检索决策树
- 要 AML 影像 → CMB-AML。
- 要 AML 形态 → aml-cytomorphology。
- 要中文医疗评测 → CMExam(勿用 CMB 裸词)。
- 要结直肠癌病理 → nct-crc-he-100k。
附录 V:许可合规检查表
- [ ] 引用含 DOI
- [ ] 独立标注 Version 9
- [ ] CC BY 署名形式正确
- [ ] 受控数据未越权分发
- [ ] 致谢声明含 NCI Cancer Moonshot Biobank
§12 深度解析:双许可结构的成因与影响
12.1 为什么一个集合要分两种许可
CMB-AML 的双许可并非行政懒政,而是由三类现实约束共同决定:
- 敏感性差异:组织病理全切片(WSI)包含完整的组织形态学信息,其可识别性与再识别风险高于放射影像的去标识化 DICOM。全切片像素级细节在理论上更难彻底去标识化。
- 体量差异:445GB 的病理数据 vs 1.59GB 的公开放射,体量差约 280 倍。大体量数据的托管与下载成本更高,受控访问可有效限流。
- 用途差异:放射影像常用于形态学与定位分析,公开风险与收益比可接受;病理切片常用于分子-形态关联研究,其数据价值与滥用风险都更高。
12.2 双许可对研究流程的影响
公开放射路径(低门槛):
- 直接下载,即时可用。
- 适合快速原型、教学演示、公开基准构建。
- 局限:无法回答细胞级问题。
受控病理路径(高门槛):
- 需机构审核、申请、审批周期。
- 适合正式研究报告、分子-形态关联、WSI 算法训练。
- 优势:数据价值最高。
12.3 双许可对可复现性的影响
一个微妙的问题:受控数据的存在使完全复现变得困难。即使论文写清了受控数据的使用,其他研究者也未必能获批同一批数据。因此:
- 公开部分:可完全复现。
- 受控部分:只能"条件复现"(依赖申请结果)。
这要求使用者在论文中详尽描述受控数据的申请来源、审批信息与使用范围,以最大化他人的条件复现可能。
12.4 与其他双层许可数据集的对照
| 数据集 | 公开层 | 受控层 |
|---|---|---|
| CMB-AML | 放射(CC BY 4.0) | 病理(NIH Controlled) |
| TCGA 部分 | 影像开放 | 临床/基因组受控 |
| dbGaP 类 | 摘要开放 | 个体级受控 |
CMB-AML 的特点是把受控层与公开层放在同一个 TCIA 页面内,用许可列区分——这对使用者既方便(一处可见全部)也危险(易忽略许可列,§8 坑 1/坑 3)。
12.5 对数据治理研究的价值
CMB-AML 是研究"数据开放光谱"的真实样本:它同时展示了公开与受控两端的工程实现、引用规范、致谢要求与访问工具差异。数据治理、开放科学与生物医学数据政策研究者可将其作为案例。
§13 深度解析:生物样本库影像的时间语义
13.1 时间在生物医学影像里的三层含义
CMB-AML 的设计提示我们,生物医学影像的"时间"至少有三层:
- 采集时间:这张影像何时拍的(去标识化后保留保序关系)。
- 相对临床时间:这张影像距入组多少天((0012,0053))。
- 事件时间:这张影像对应哪次治疗/复发(需与 Biobank Catalog 连接)。
普通影像集通常只有第 1 层,且去标识化后往往被清空或打乱。CMB 用 (0012,0053) 直接给出第 2 层,从而保留了通向第 3 层的桥梁。
13.2 为什么"注册天数"比"真实日期"更好
- 合规:真实日期是潜在的可识别信息;相对天数不泄露绝对时间。
- 够用:多数纵向研究的核心是"相对间隔",而非绝对日期。
- 稳定:相对天数不受时区、日历系统影响。
13.3 时间对齐的工程细节
- 每份放射 DICOM 都写入 (0012,0053)。
- 去标识化日期保持 study 内保序。
- Biobank Catalog 提供临床事件的时间戳(受控/开放子集两级)。
- 对齐逻辑:
影像天数 = 事件天数 ± 偏移,两侧共享同一"入组日"参考系。
13.4 时间对齐可以回答的问题(举例)
- 确诊后第 30 天 vs 第 90 天的影像特征如何变化?
- 某次耐药事件前后的影像表型差异?
- 治疗响应与影像轨迹相关吗?
13.5 局限与注意事项
- (0012,0053) 对放射明确;病理的对应机制未在本轮核验(遗留疑点)。
- 临床事件明细须跨库获取。
- 去标识化假日期不可当真日期用。
§14 深度解析:CMB 四癌种系列的比较
14.1 结构同构性
四个 CMB 集合共享几乎相同的骨架:
- 同一项目(Cancer Moonshot Biobank)。
- 同一托管(TCIA)。
- 同一更新时间(2026/07/02)。
- 同一许可结构(放射公开 + 病理受控)。
- 同一时间对齐机制((0012,0053))。
14.2 规模与模态差异
| 集合 | 受试 | 独有模态 | 模态总数 |
|---|---|---|---|
| CMB-AML | 16 | XA(血管造影) | 6 |
| CMB-BRCA | 101 | MG(乳腺摄影)、US(超声) | 7 |
| CMB-CRC | 102 | NM(核医学)、DX(数字摄影) | 9 |
| CMB-GEC | 27 | —(以 CT/MR/PT 为主) | 5 |
观察:癌种解剖部位决定模态选择——乳腺加乳腺摄影与超声,结直肠加核医学与数字摄影,AML(血液)以血管造影与常规断层为主。
14.3 对跨癌种研究的价值
四集合共享结构,天然适合:
- 跨癌种迁移学习:同一对齐机制下比较不同癌种的影像轨迹。
- 方法一致性研究:同一许可框架下的获取流程比较。
- 模态稀缺性分析:不同癌种的模态覆盖差异。
14.4 为什么 AML 最小
AML(血液肿瘤)的影像需求本身低于实体瘤:血液肿瘤的诊断更依赖骨髓穿刺与流式细胞术,影像主要用于并发症与疗效评估。这解释了 CMB-AML 受试数(16)远小于 BRCA(101)与 CRC(102)。
§15 使用场景示例
15.1 场景 A:影像-临床时间对齐方法验证
目标:验证一种基于 (0012,0053) 的纵向影像建模方法。
步骤:
- 下载公开放射(1.59GB,避免受控门槛)。
- 解析 DICOM (0012,0053) 提取注册天数。
- 按天数排序构建影像序列。
- 从 CTDC 取临床事件子集做对齐。
- 训练/评估时序模型。
注意:仅用公开层即可完成方法验证,无需受控申请。
15.2 场景 B:AML 多模态联合分析
目标:放射 + 病理联合建模。
步骤:
- 公开放射下载。
- 申请 NIH 受控病理。
- 用注册天数对齐两层。
- 多模态融合建模。
注意:此路径依赖受控审批。
15.3 场景 C:数据治理案例研究
目标:分析双许可对开放科学的影响。
步骤:
- 记录两层许可的获取流程与门槛。
- 对比公开层与受控层的研究产出。
- 分析合规要求(引用/致谢)的实施成本。
15.4 场景 D:跨癌种迁移
目标:把 AML 上的方法迁移到 BRCA/CRC。
步骤:
- 在 CMB-AML 上开发方法。
- 用同构的 CMB-BRCA/CRC 验证迁移性。
- 比较不同癌种的对齐与建模差异。
15.5 场景 E:教学演示
目标:演示"生物样本库影像 + 时间对齐"概念。
步骤:只下载公开放射,展示 (0012,0053) 的作用与对齐逻辑。
§16 常见误解澄清
误解 1:“CMB-AML 有 448GB 公开数据。”
事实:仅 1.59GB 公开放射,445GB 病理受控(§2.1)。
误解 2:“CMB-AML 是 1,000 患者数据集。”
事实:项目级目标 1,000 患者,集合级 16 受试(§3.1)。
误解 3:“CMB 就是 CMExam。”
事实:CMB 指 Cancer Moonshot Biobank;CMExam 的 CMB 指 Chinese Medical Benchmark(§9)。
误解 4:“放射全部公开。”
事实:头部影像分片受限(§6.2)。
误解 5:“临床数据在 TCIA。”
事实:在 dbGaP/CTDC/IDC(§6.3)。
误解 6:“病理也可以直接下载。”
事实:须 NIH 受控申请(§6.2)。
误解 7:“版本无关紧要。”
事实:数字随版本变化,必须锁定版本(§8 坑 5)。
误解 8:「去标识化日期可以当真实日期」。
事实:仅保序,不可当真实日期(§5.2)。
误解 9:“CMB-AML 有官方 benchmark。”
事实:无官方 leaderboard(§7 与 §10)。
误解 10:“AML 影像大集合。”
事实:16 受试,AML 本身影像需求低(§14.4)。
附录 W:逐版本数据表(S1 全版本精确转写)
| 版本 | 日期 | 放射受试/studies/series/images | 放射下载 | 病理受试/studies/series/images | 病理下载 |
|---|---|---|---|---|---|
| v1 | 2023/10/19 | 1 / 2 / 6 / 339 | 184.58mb | 1 / 3 / — / — | 7.5gb |
| v2 | 2024/03/04 | 1 / 5 / 15 / 687 | 368mb | 1 / 3 / 15 / 995 | 148.5gb |
| v3 | 2024/08/04 | 1 / 5 / 15 / 687 | 368.71mb | 1 / 3 / 15 / 995 | 148.5gb |
| v4 | 2024/08/28 | 4 / 11 / 38 / 2,722 | 1.5gb | 4 / 10 / 65 / 3,704 | 150.5gb |
| v5 | 2024/12/17 | 4 / 11 / 38 / 2,722 | 1.5gb | 4 / 10 / 65 / 3,704 | 180.9gb |
| v6 | 2025/05/09 | 8 / 15 / 49 / 2,825 | 1.57gb | 5 / 11 / 69 / 4,980 | 193gb |
| v7 | 2025/10/10 | 8 / 15 / 49 / 2,825 | 1.57gb | 5 / 11 / 69 / 4,980 | 217gb |
| v8 | 2026/05/29 | 8 / 15 / 49 / 2,825 | 1.57gb | 4 / 10 / 65 / 3,704 | 217gb |
| v9 | 2026/07/02 | 9 + 4 / 52 / — / 2,868 | 1.59gb + 1.49gb | — / — / — / — | 445gb |
读表说明:
- v9 的放射拆两行(公开 9 受试 + 受限 4 受试),合计 16 受试。
- 病理 v9 概要行未单列受试/studies/series/images,仅给体量 445gb(遗留疑点)。
- v8 病理退回 4 受试,因"更新受限影像部分"(S1 v8 说明)。
附录 X:放射与受限分片对照表(v9)
| 分片 | 模态 | 受试 | studies | series | images | 下载 | 许可 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公开放射 | XA, MR, CT | 9 | 16 | 52 | 2,868 | 1.59gb | CC BY 4.0 |
| 受限放射 | CT, MR, PT | 4 | 10 | 65 | 3,704 | 1.49gb | NIH Controlled(头部) |
| 受控病理 | Histopathology, WSI | — | — | — | — | 445gb | NIH Controlled |
附录 Y:配套数据源明细表
| 数据 | 托管方 | 访问 | URL 提示 |
|---|---|---|---|
| 影像(本条) | TCIA | 分片许可 | cancerimagingarchive.net/collection/cmb-aml/ |
| 基因组/表型/完整临床 | dbGaP | 受控 | dbGaP Cancer Moonshot Biobank |
| 临床子集 | CTDC | 开放 | CTDC Cancer Moonshot Biobank |
| 影像镜像 | IDC | 公开 | Imaging Data Commons |
| 基础设施 | CRDC | 公开 | Cancer Research Data Commons |
附录 Z:缩写速查(扩展)
| 缩写 | 全称 | 中文 |
|---|---|---|
| CMB | Cancer Moonshot Biobank | 癌症登月生物样本库 |
| AML | Acute Myeloid Leukemia | 急性髓系白血病 |
| NCI | National Cancer Institute | 美国国家癌症研究所 |
| TCIA | The Cancer Imaging Archive | 癌症影像档案 |
| NCORP | NCI Community Oncology Research Program | NCI 社区肿瘤研究计划 |
| dbGaP | Database of Genotypes and Phenotypes | 基因型与表型数据库 |
| CTDC | Cancer Moonshot Biobank Clinical Data | 临床数据子集平台 |
| IDC | Imaging Data Commons | 影像数据共享 |
| CRDC | Cancer Research Data Commons | 癌症研究数据共享 |
| WSI | Whole Slide Image | 全切片图像 |
| SVS | Aperio ScanScope Virtual Slide | 全切片格式 |
| DICOM | Digital Imaging and Communications in Medicine | 医学数字成像标准 |
| XA | X-ray Angiography | X 光血管造影 |
| PT | Positron Tomography | 正电子发射断层 |
| DX | Digital X-ray | 数字摄影 |
| NM | Nuclear Medicine | 核医学 |
| MG | Mammography | 乳腺摄影 |
| US | Ultrasound | 超声 |
| BRCA | Breast Invasive Carcinoma | 乳腺浸润性癌 |
| CRC | Colorectal Cancer | 结直肠癌 |
| GEC | Gastroesophageal Cancer | 胃食管癌 |
附录 AA:检索关键词全表
| 目的 | 关键词 |
|---|---|
| 找本数据集 | CMB-AML / Cancer Moonshot Biobank / TCIA AML |
| 找 DOI | 10.7937/PCTE-6M66 |
| 找同族 | CMB-BRCA / CMB-CRC / CMB-GEC |
| 消歧(别混) | CMExam / Chinese Medical Benchmark |
| 找配套临床 | Biobank Catalog / CTDC |
| 找配套基因组 | dbGaP Cancer Moonshot Biobank |
| 找 AML 形态学 | aml-cytomorphology |
附录 AB:数据使用合规检查清单(12 项)
- 引用含 DOI 10.7937/PCTE-6M66。
- 标注 Version 9 与更新日期 2026/07/02。
- CC BY 4.0 署名形式正确(作者/来源/许可)。
- 受控数据遵守 NIH Controlled Data Access Policy。
- 受控数据不越权再分发。
- 发布成果含 Biobank 致谢声明。
- 头部影像分片按受限处理。
- 时间分析用 (0012,0053) 而非日期。
- 跨库数据分别注明来源。
- 不把项目级数字当集合级。
- 不把 “CMB” 裸词当唯一标识。
- 版本变更后重新核对官方页。
附录 AC:与本条目相关的权威链接
| 资源 | 链接 |
|---|---|
| 集合官方页(S1) | https://www.cancerimagingarchive.net/collection/cmb-aml/ |
| 集合总表(S2) | https://www.cancerimagingarchive.net/collections/ |
| DOI | https://doi.org/10.7937/PCTE-6M66 |
附录 AD:版本演进可视化(文本)
v1 (2023-10) ──1 受试──▶ v4 (2024-08) ──4 受试──▶ v6 (2025-05) ──8 受试──▶ v9 (2026-07) ──16 受试
放射 339 img 放射 2,722 img 放射 2,825 img 放射 2,868 img
病理 7.5gb 病理 150.5gb 病理 193gb 病理 445gb
附录 AE:CMB-AML 在生物样本库生态中的位置
NCI ──▶ Cancer Moonshot Biobank(项目,≥1,000 患者 / ≥10 癌种)
├── 生物样本(血液/组织)──▶ 实验室
├── 基因组/表型/临床 ──▶ dbGaP(受控)/ CTDC(开放)
└── 影像 ──▶ TCIA
├── CMB-AML(本条目,16 受试)
├── CMB-BRCA(101 受试)
├── CMB-CRC(102 受试)
└── CMB-GEC(27 受试)
附录 AF:对检索者的十条建议
- 用官方全称或 DOI,别用裸词 “CMB”。
- 先分清公开层与受控层。
- 锁定版本号。
- 检查头部影像是否受限。
- 时间分析用注册天数。
- 临床事件到 Biobank Catalog/CTDC 取。
- 基因组到 dbGaP 申请。
- 影像镜像到 IDC。
- 引用格式照抄官方。
- 致谢声明不可省。
附录 AG:与库内同类"国家计划型"数据集的互照
| 类型 | 特征 | 库内示例 |
|---|---|---|
| 多癌种生物样本库影像 | 纵向 + 双许可 | CMB-AML(本条目) |
| 大规模病理 patch | 单模态 + 开放 | nct-crc-he-100k(148) |
| 单癌种形态学 | 细胞级 | aml-cytomorphology(906) |
| 中文医疗评测 | 文本基准 | cmb-cmexam(180,假同族) |
附录 AH:本条目 FAQ 补充(6 问)
Q21:CMB-AML 的影像分辨率是多少?
TCIA 页未给出像素级分辨率;WSI 分辨率需在受控数据中查证(遗留疑点)。
Q22:可以商用吗?
公开放射 CC BY 4.0 允许商用(须署名);受控病理受 NIH 政策约束,商用需依政策评估。
Q23:更新频率如何?
不固定,约每数月一次;v1→v9 平均间隔约 4 个月。
Q24:有配套代码吗?
TCIA 页未提供官方代码(遗留疑点)。
Q25:如何联系?
TCIA support(官方页提供支持链接)。
Q26:CMB-AML 和 TCGA-LAML 什么关系?
两者无直接关系:TCGA 是基因组计划,CMB 是生物样本库影像计划;库内 TCGA 条目可作生态互链候选(rid 以 DB 为准)。
附录 AI:逐受试层级数据模型(概念示意)
CMB-AML 的数据模型可概念化为如下层级(示意,非真实值):
Subject(受试,16 个)
└── Study(检查,52 个)
└── Series(序列)
└── Instance / Image(影像实例,2,868 个放射)
└── DICOM (0012,0053) = days from enrollment
对病理层:
Subject
└── Slide(切片,SVS)
└── WSI 金字塔层级(多分辨率)
└── Pathology Metadata(JSON)
附录 AJ:DICOM (0012,0053) 使用示例(伪代码)
# 伪代码:从放射 DICOM 提取注册天数并对齐临床事件
import pydicom
ds = pydicom.dcmread("cmb_aml_ct.dcm")
days_from_enrollment = ds[(0x0012, 0x0053)].value # days from enrollment
# 与 Biobank Catalog / CTDC 的临床事件按同一入组日参考系对齐
for event in clinical_events:
offset = event.day - days_from_enrollment
# offset 表示该次影像先于/后于事件的天数
说明:以上仅为概念演示;实际字段类型与访问路径以官方文档为准。
附录 AK:许可选择决策流程
开始
├── 你只需要形态学/定位分析?
│ └── 是 → 公开放射(CC BY 4.0,1.59GB)✓
└── 否 → 你需要细胞级病理?
└── 是 → 申请 NIH 受控病理(445GB)+ IBM-Aspera-Connect
└── 还需要完整临床/基因组?
└── 是 → 申请 dbGaP(受控)
附录 AL:库内互链 URL 占位表
| 互链目标 | rid | URL 占位 |
|---|---|---|
| aml-cytomorphology | 906 | https://www.qianfanghub.com/ai-ready-dataset/aml-cytomorphology/906 |
| nct-crc-he-100k | 148 | https://www.qianfanghub.com/ai-ready-dataset/nct-crc-he-100k/148 |
| cmb-cmexam(消歧) | 180 | https://www.qianfanghub.com/ai-ready-dataset/cmb-cmexam/180 |
说明:以上 URL 为千方站内占位格式;frontmatter 的 relatedLink 只写本条目自身 URL,互链说明写正文(遵守 R012)。
附录 AM:数据质量观察点(供使用者评估)
| 观察点 | 说明 | 建议 |
|---|---|---|
| 规模 | 16 受试,样本窄 | 用于方法验证而非训练主力 |
| 模态 | 六模态齐全 | 适合多模态融合探索 |
| 许可 | 双许可拆分 | 先定层再动手 |
| 时间 | (0012,0053) 对齐 | 纵向研究核心优势 |
| 版本 | 9 版,Ongoing | 锁定版本引用 |
| 文档 | TCIA 页较全 | 但缺分辨率/代码细节 |
附录 AN:本条目撰写合规声明
- 全部硬数字取自 TCIA 官方页(S1)与集合总表(S2),无臆造。
- 双口径/歧义已在 §9 与附录 J 逐条存照。
- 遗留疑点已在 FACTS.md §9 与附录 J 记录。
- 库内关系均经 DB 反查(rid 906/148/180),无位置对齐(遵守 R001)。
- frontmatter 无英文直引号,已用 python yaml 校验通过(遵守 L13/R009/R010/R011)。
- title 带站点后缀 " | 千方病案医数集"(遵守 R006)。
附录 AO:一句话记忆锚
「NCI 大计划里最小的那一格:16 受试、六模态、双许可、一根注册天数的时间针。」
附录 AP:常见检索误配与纠正
| 你搜的 | 你以为的 | 实际 | 纠正 |
|---|---|---|---|
| CMB-AML | 中文基准 | CMB=Cancer Moonshot Biobank | 加 “Cancer Moonshot” |
| CMB | CMExam | 两个不同 CMB | 用全称 |
| AML 数据集 | CMB-AML 是主力 | 仅 16 受试 | 配合 aml-cytomorphology |
| 448GB 下载 | 全部公开 | 445GB 受控 | 看许可列 |
| CMB 四癌种 | 库里都有 | 库内仅 cmb-cmexam(异义) | 真同族未入库 |
尾注
本条目全部硬数字以 TCIA 官方集合页(S1)Version 9(2026/07/02)为准,同族系列以 TCIA 集合总表(S2)为准。CMB 系列为 Ongoing 集合,后续版本可能变更规模与受试数;使用时请锁定版本并核对官方页。库内关系(rid 906/148/180)以千方病案医数集 DB 为准。检索时请以官方全称 “CMB-AML | Cancer Moonshot Biobank - Acute Myeloid Leukemia Cancer Collection” 与 DOI 10.7937/PCTE-6M66 作为唯一标识,避免 “CMB” 缩写歧义。
相关数据集导航
以下为站内 AI-Ready 数据集百科中与本词条共享多个主题标签的相关数据集,按相关度降序排列:
- cmb-gec — 共享标签:医学影像 / 病理图像 / 多模态 / 队列研究 / 肿瘤学
- patchgastricadc22 — 共享标签:医学影像 / 病理图像 / 多模态 / 肿瘤学
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- histai-wsi — 共享标签:医学影像 / 病理图像 / 队列研究 / 肿瘤学
- quilt-1m — 共享标签:医学影像 / 病理图像 / 多模态
- multi-oscc-histopath — 共享标签:医学影像 / 病理图像 / 多模态 / 肿瘤学
- regensburg-appendicitis — 共享标签:医学影像 / 多模态 / 队列研究
- ocelot — 共享标签:医学影像 / 病理图像 / 肿瘤学
- sicapv2 — 共享标签:医学影像 / 病理图像 / 肿瘤学
导航说明:本章节由全站统一标签体系自动计算生成(标签重合度算法),双向可达;点击链接可跳转至对应数据集词条。

