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电子病历与文本数据集

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病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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共 1822 个数据集

生理信号脑电信号神经科学可穿戴传感评测基准

NeBULA — 40 名健康被试、127 导 hd-EEG + 11 肌 sEMG 的三目标伸手任务标准数据集

原始数据人工标注时序数据40 名健康成人入组（20 男 / 20 女；44.6 ± 13.2 岁；招募区间 25-80 岁）；公开释出 39 名（缺 sub-28）

意大利 IIT Rehab Technologies 实验室用自研触摸面板 + 上肢外骨骼原型，采集 40 名健康成人 3 目标 × 3 辅助水平 × 10 重复的伸手动作 EEG-EMG 双模 BIDS 数据，Figshare 与 NEMAR nm000322 双通道公开，是神经康复辅助技术客观评估与伸手运动解码的基线资源

Brain Products actiCHamp 128 通道放大器 + actiCAP 主动电极帽采集的 127 导 hd-EEG（1000 Hz，FCz 在线参考，Fpz 接地）+ 11 肌同步 sEMG + IIT 自研可调触摸面板触发的 Go 线索事件表 + 上肢外骨骼三档辅助运行日志，全部整理为 EEG-BIDS 1.9.0 目录 23

基因组学与多组学神经科学单细胞基因组学转录组测序数据阿尔茨海默病

PsychAD — 1,494 例供体 632 万核背外侧前额叶单核转录组跨疾病图谱

原始数据受控访问数据组学数据1,494 例已故供体（MSSM 1,042 + HBCC 300 + RADC 152）；6,320,459 个细胞核

NIA 资助 PsychAD 联盟 2019 年启动，以 10x 3′ v3.1 + 核哈希多重标记产出的 DLPFC snRNA-seq 图谱：1,494 例供体、632 万核、8 大类 27 亚类 67 亚型，21% 供体为跨诊断共病；本体走 Synapse 受控访问，CELLxGENE 只给可视化聚合，AWS Open Data 提供管控 S3 桶

Mount Sinai 等三家脑库的新鲜冷冻背外侧前额叶皮层组织，10x Genomics 3' v3.1 + TotalSeq-A 核哈希多重标记产出 snRNA-seq；配套 Illumina GSA-24 SNP 阵列与 WGS 基因型 34

基因组学与多组学微生物组测序数据代谢组学队列研究

Fecal Metagenomic Profiling of Cardiovascular-Kidney-Metabolic Syndrome — 心血管-肾脏-代谢综合征粪便菌群 16S 扩增子数据集（NGDC HRA020686）

原始数据受控访问人类遗传资源44 名心血管-肾脏-代谢（CKM）综合征参与者（CKM 1-2 期 19 人，CKM 3-4 期 25 人），每人 1 份粪便样本，共 44 个样本（全量以受控清单为准）

首都医科大学宣武医院团队在 NGDC GSA-Human 受控登记的 44 名心血管-肾脏-代谢（CKM）综合征参与者粪便 16S rRNA V3-V4 扩增子测序数据（CKM 1-2 期 19 人 + 3-4 期 25 人），配套粪-血配对代谢组关联设计，是 AHA 2023 CKM 分期框架下少见的中国人群分期分层菌群资源

NGDC GSA-Human HRA020686（受控）粪便样本 16S rRNA V3-V4 扩增子双端测序 fastq.gz（Illumina NextSeq 2000）+ 受控样本元数据（含 CKM 分期、性别、-80°C 保存描述）+ 描述中提及的粪-血配对代谢组关联分析选取的粪便代谢物（代谢组原始数据存放位置未公开） 54

微生物组代谢组学儿科队列研究罕见病测序数据

OrkambiKIDS / DeepPheno_Luma-Iva — 儿童囊性纤维化 LUMA/IVA 24 个月纵向多组学数据集

原始数据处理后数据纵向随访开放获取8 名儿童（F508del 纯合子；基线年龄中位数 9.50 岁，IQR 7.00-10.25；女 5 / 男 3）；9 次访视（0-24 个月）；SRA 145 个 16S run（粪便 59 /

8 名 F508del 纯合子患儿启动 lumacaftor/ivacaftor 前瞻性 IV 期试点研究，9 次访视采集临床、汗液氯、肺功能、炎症、16S 微生物组（粪便/痰/咽拭子）与血清非靶向代谢组，SRA + MassIVE + GitHub 三库公开

德国美因茨大学医学中心儿童呼吸门诊前瞻性 IV 期试点队列（DRKS00022267）；临床元数据 + 人体测量 + 汗液氯 + 肺功能 + 炎症 + 常规微生物学 + 16S rRNA（粪便/痰/咽拭子）+ 血清非靶向代谢组；数据分布于 SRA、MassIVE、GitHub/Zenodo 25

基因组学与多组学代谢组学GWAS测序数据队列研究药物-靶点相互作用

Plasma Metabolome Whole-Genome Landscape — 19.9 万人 WGS + NMR 血浆代谢组遗传图谱

原始数据衍生数据开放获取199,138 名 UK Biobank 参与者（欧洲血统 191,681、非洲 3,296、南亚 3,848、东亚 175、混合美洲 138；中位年龄 58 岁，女性 105,726 名）

复旦大学华山医院郁金泰/程炜团队基于 UK Biobank 199,138 人 WGS（32.5×）与 Nightingale NMR 313 项血浆代谢标志物绘制的遗传图谱：36,105 个独立信号、1,527 个基因-性状对、245 条因果关联、410 个候选靶点，配套汇总统计交互式开放浏览站点

UK Biobank 全基因组测序（Field 24310，Illumina NovaSeq 6000，平均 32.5×）+ Nightingale Health 高通量 NMR 血浆代谢组（249 项直接测量 + 64 项衍生比值 = 313 项代谢标志物）+ 本研究产出的单变异与聚集检验汇总统计交互式浏览站 24

生理信号可穿戴传感时序数据真实世界数据多模态

OU-DATASET — 匈牙利 22 例 1 型糖尿病多次每日注射（MDI）自由生活纵向多模态数据集

原始数据传感数据自报数据22 名 1 型糖尿病（T1D）患者，多次每日注射（MDI）治疗，随访 8 周

Óbuda University 团队 8 周纵向采集的 MDI 治疗 T1D 队列：血糖监测、胰岛素注射记录、活动追踪（心率与步数）、自报生活事件（进餐/运动/压力）四路模态，Figshare 公开，定位是填上「非泵、非闭环」人群的公开数据空白

四路纵向模态：①血糖监测序列 ②胰岛素注射记录 ③活动追踪器（心率 + 步数）④患者自报生活事件（进餐、运动、压力）；采集场景为自由生活条件（free-living），非住院或代谢舱。设备型号、采样间隔、记录条数与文件表结构论文摘要未披露，本条目记为未公开 27

基因组学与多组学队列研究测序数据GWAS变异与注释公共卫生与流行病学

The SuperAgers Family Study — 95 岁以上极端长寿家系队列的 WES 基因型-表型数据库

问卷数据临床数据基因组数据受控访问830 名参与者（2026-09 Data Release 26.09 口径，个体级人口学+临床）；上批 2026-04 为 767 人；招募目标 10,000 人（95+ 及其子女、子女配偶）

AFAR SuperAgers Initiative 旗下、Einstein 执行的远程招募家系研究：95+ 长寿者+子女+子女配偶，寄回唾液做全外显子测序；2026-09 经 ELITE Portal 放出 830 人个体级人口学与临床数据（上批 767 人），受控访问需 IDU+DUC，目标 10,000 人

多来源汇总：ELITE Portal Data Release 26.09 与 26.04 公告、ELITE Portal 数据访问文档、AFAR 2022 启动新闻稿、Nature Aging 2023 通讯；明细见正文附录来源清单 28

电子健康记录公共卫生与流行病学疾病监测真实世界数据临床电子病历

MENDS — REACHnet 多州 EHR 疾病监测节点：把研究级病历改造成公卫监测数据集的治理路径

电子病历结构化数据去标识数据受限访问加权分析样本约 800,000 名成人（≥18 岁，2018-02-01 起至少 1 次合格就诊、已去重）；去重后在册患者总数未公开

CDC 资助、NACDD 协调的美国五节点 EHR 监测网络；本条目聚焦 LPHI 牵头的 REACHnet 节点——5 个卫生系统、2 个州、约 80 万成人，用 MDSUA 与公共卫生权限替代研究授权，把 PCORnet CDM 转成季度更新的监测数据集

REACHnet 5 个卫生系统合作伙伴的 PCORnet CDM 病历（LA 3 + TX 2，合计 >100 家医院、>1200 个照护中心）经 Datavant Connect 去重后合并为 MENDS 组合通用数据模型（CCDM），挂载 ESP + PopMedNet + RiskScape；明细见正文附录 28

公共卫生与流行病学医保理赔疾病监测公共卫生统计流行病学队列研究

FAIR Health Atlas — 美国最大商业医保理赔库慢性病患病率图集：50 州+DC、州/县两级、46 类 CCW 慢病

聚合统计理赔数据真实世界数据未公开 —— 论文与白皮书均未给出覆盖参保人绝对数，仅披露理赔库年增逾 40 亿条记录；分母为 Census SAHIE 商业医保参保人数

FAIR Health 基于全美最大商业理赔库（年增 40 亿条记录）自建的公开患病率平台，用 CCW 诊断码+最近邻圆盘平滑+人口加权把慢病患病率算到州与县，补上 Medicare/Medicaid 口径之外的商业保险人群空白；只发聚合率、不发微观数据

FAIR Health 全国商业理赔库（保险方与第三方管理机构自愿贡献）+ CMS CCW 慢病诊断码字典 + Census SAHIE 参保人数分母 + Census ACS 贫困率 24

公共卫生与流行病学队列研究基因组学与多组学电子健康记录调查数据

Our Future Health — 英国两百万级 NHS 链接前瞻性队列的 TRE 内分析范式

原始数据表格数据测序数据2,021,810 名完成基线问卷的同意参与者（Participant 表 2,022,814）；其中 1,983,038 有地理数据、1,690,704 链接 NHS 号、1,518,202 有临床

2,021,810 名完成基线问卷的英国成年志愿者、1,690,704 人链接 NHS 号、755,000 人有芯片与插补基因型；数据全部锁在 DNAnexus 承建的 Trusted Research Environment 内，研究者须经注册认证—Access Board 审—付费—TRE 分析四道闸门

Our Future Health 前瞻性队列：基线健康问卷（v1/v2/v2.1/v2.2）、诊所客观测量与 POCT 血脂、Illumina Infinium Excalibur 芯片与插补基因型、英格兰 NHS 链接健康记录与 ONS 死亡登记、参与者地理数据 43

医学影像CT医学图像分割评测基准挑战赛数据集肿瘤学

CURVAS-PDACVI — 五位专家各自标注的胰腺癌血管侵犯基准

人工标注影像数据原始数据125 例 PDAC 增强 CT 初筛（PANORAMA 子集）；论文最终可用 109 例，公开训练 40 / 验证 5 / 测试 64（Zenodo v3 与挑战赛页另一口径写测试 85，详见 §1

MICCAI 2025 CURVAS 第二届：从 PANORAMA 挑 125 例胰腺导管腺癌增强 CT，40 例公开训练集含 5 位独立放射科医生逐例标注，人-人 Dice 仅 58.4%±25.7%；评价框架以 MR-ECE、CRPS 与逐血管 Wasserstein 距离取代单一 ground truth 打分。

PANORAMA 挑战赛公开的荷兰多中心门静脉期上腹部增强 CT（Zenodo records/11034178）中精选 125 例；每例由 5 位独立放射科医生（PANORAMA 原标注 1 份 + 新增 4 份，来自德国 Erlangen 大学医院、西班牙 Sant Pau 医院、西班牙 Mataró 医院）各自勾画 PDAC 肿瘤与胰腺，另配 1 份 STAPLE 共识与 1 份 5 血管掩码（门静脉 / SMV / 主动脉 / 腹腔干 / SMA）；NIfTI 格式，训练集压缩包 5.5 GB 28

电子健康记录真实世界数据临床电子病历医疗登记队列研究

广安门医院慢性胃炎高质量数据集 — 中医优势病种专病数据集的数据要素化样本

人工标注结构化数据多中心数据未公开（官方仅公布 6 大类 25 个模块，未披露入组病例数与数据元总数）

中国中医科学院广安门医院以真实门诊住院病历治理而成的慢性胃炎专病数据集：中医四诊、中西医诊断、中药处方等 6 大类 25 个模块、敏感信息 100% 匿名化，2026 年 5 月获批国家数据产权登记证书，2026 年 8 月 28 日于贵阳中国国际大数据产业博览会正式发布，配套出版《慢性胃炎专病中西医标准数据集（2025）》——它是可查证、可引用、却不可下载的数据资产

中国中医科学院广安门医院真实门诊病历与住院病历，经清洗、标准化、质控全流程治理形成 6 大类 25 个模块的专病结构化数据；字段定义公开于《慢性胃炎专病中西医标准数据集（2025）》（中国协和医科大学出版社），字段明细见正文附录 A 29

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