即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

杜克大学 Syed 实验室 NIH R01DK131491 资助的 CoMPAS 项目首个公开数据分卷——从 Duke BRPC 临床归档取出约 550 张炎症性肠病（克罗恩病/溃疡性结肠炎）H&E 胃肠道全切片，经 BRPC 数字化去标识化后按 CC BY-4.0 挂 Zenodo 开放，文件仍受登录申请门槛管控

Duke BioRepository and Precision Pathology center (BRPC) 临床归档 H&E 胃肠道组织病理全切片（经 DUHS IRB Pro00117942、waiver of consent 取得）+ PRCC honest broker 去标识化的患者元数据（Excel/.csv） 36

医学影像PETCT多模态影像-文本对齐肿瘤学

PETWB-REP — 490 例多癌种全身 FDG PET/CT 中英双语报告配对数据集

影像数据文本数据原始数据衍生数据490 例（195 女 + 295 男；平均年龄 61.4 ± 12.8 岁）；每例含配对 PET/CT 影像 + 报告

上海单中心 2021-2024 回顾性采集的 490 例全身 18F-FDG PET/CT：BIDS 组织、RSNA 匿名器+CtaDeface 双文件去脸、SUVbw 归一与配准衍生、Google 翻译+核医学专家逐份审校的中英双语放射报告配对——面向肿瘤分割、报告生成与影像-文本多模态融合

上海联影（环球）医学影像诊断中心 2021-2024 年常规诊疗回顾性全身 18F-FDG PET/CT（Siemens Biograph 64）+ PACS 导出的中文放射报告（Google 翻译后双语专家审校成英文）——按 BIDS 组织的 NIfTI 原图（去脸匿名）与 SUV/配准衍生影像 + metadata.csv + report_zh.csv + report_en.csv 57

医学问答与基准医疗NLP临床文本电子健康记录评测基准

ER-REASON — 急诊室 LLM 临床推理基准

文本数据临床记录人工标注真实世界数据3,437 患者 / 3,984 次 ER 就诊 / 25,174 份临床笔记（另：194 例 SCT 习题 / 787 SCT 条目 / 2,555 条医师标注 / 72 份专家推理理由）

UCSF 急诊科 25,174 份去标识化纵向临床笔记构建的 LLM 临床推理评测基准：3,437 患者 / 3,984 次就诊 / 194 例脚本一致性测试（SCT）题 / 2,555 条急诊医师标注，凭证访问（PhysioNet DUA）

UCSF 急诊科（2022-03-01 至 2024-03-31）去标识化纵向临床笔记（HIPAA Safe Harbor + Expert Determination 双方法，UCSF Information Commons 执行），经 PhysioNet 凭证访问发布 v1.0.0 51

医学影像MRI脑肿瘤队列研究肿瘤学

Yale Brain Metastases Longitudinal — 耶鲁脑转移瘤纵向 MRI 数据集：1,430 患者 11,892 studies 近 20 年随访四序列影像与临床元数据

影像数据原始数据1,430 例经病理或影像学确认的脑转移患者（TCIA 与论文口径一致）

TCIA 旗下最大公开脑转移瘤纵向 MRI 数据集百科：耶鲁纽黑文医院 2004–2023 年 11,892 studies 纵向随访，1,430 例经病理/影像确诊脑转移患者，T1W/T1CE/T2/FLAIR 四序列 NIfTI，附 1,430 行临床与采集参数表；CC BY 4.0，43 GB，TCIA + DOI 10.7937/3YAT-E768——将「近 20 年真实世界放疗前后多时间点随访」作为首要而不是附属资产的脑转移瘤影像语料底座

耶鲁纽黑文医院（Yale New Haven Hospital）电子病历系统 2004–2023 年脑转移相关 MRI；四序列 mpMRI（T1W/T1CE/T2/FLAIR，1.5T 或 3T，Siemens Healthineers 或 GE Healthcare），NIfTI 导出并经 HD-BET 脑实质提取去标识化；临床与采集元数据抽取自 EMR 与 DICOM 49

医学影像眼科影像图像分类青光眼临床电子病历

Hillel Yaffe Glaucoma Dataset — 金标准注释眼底彩照青光眼检测数据集

影像数据标签数据原始数据288 名患者（747 张眼底彩照；186 名 GON+ 患者，占 64.6%）

以色列 Hillel Yaffe 医学中心 288 名患者 747 张眼底彩照的「临床金标准」青光眼检测数据集：标签源自完整眼科检查+OCT+视野+至少一年随访而非仅凭图像主观判读，ODC-By 1.0 于 PhysioNet 完全开放，配套 GONet 模型论文

以色列 Hillel Yaffe 医学中心眼科青光眼单元 2022–2024 年临床数据：TOPCON DRI OCT Triton 相机（45° FOV）拍摄的 747 张眼底彩照（JPG，2576×1934 或 1960×1934）+ Labels.csv（Image Name/Patient/Label/Quality Score） 46

医学影像CTMRI医学图像分割挑战赛数据集评测基准

RSNA Intracranial Aneurysm (RSNA-ICA) Dataset — 颅内动脉瘤多模态检测专家标注数据集

影像数据人工标注多模态数据4,278 成人患者（7,202 series：CTA 2,566 + MRA 2,166 + MRI 2,470）；21 机构 / 12 国 / 5 洲；178 series 含三维血管分割

RSNA 联合 ASNR/SNIS/ESNR 于 2025 年发布的 7,202 序列颅内动脉瘤检测数据集——4,278 成人、21 机构 12 国 5 洲，覆盖 CTA/MRA/MRI 三模态，14 目标标签加权多标签 AUC-ROC 评测，Kaggle 挑战赛 2025-07-28 至 2025-10-14

RSNA Intracranial Aneurysm Detection AI Challenge 2025（Kaggle）公开影像：去标识 DICOM 多模态血管影像 + 逐序列 14 标签表 + 动脉瘤中心点定位表 + 三维血管分割子集；托管于 Kaggle / AWS Open Data / RSNA MIRA 40

医学影像医学图像分割MRI脑影像神经退行性疾病多模态影像

Brain Slab Seg 3D — 尸检脑片照片分割数据集

人工标注影像数据原始数据1,573 对照片+掩码（Zenodo/NLM 口径）；训练用 1,414 张手工分割图像 = MADRC 733 + UW-fresh 681；三分源照片求和 1,632（含仅测试的 UW-fixe

1,573 对冠状脑组织切片解剖照片与手工分割掩码——MGH 阿尔茨海默研究中心与华盛顿大学双站点采集，nnU-Net 自动分割脑片正面（median Dice>0.98），集成入 FreeSurfer PhotoTools，CC BY 4.0 公开，让尸检脑组织的 3D 体积分析摆脱人工描边瓶颈

MGH 阿尔茨海默病研究中心（MADRC）+ 华盛顿大学检验医学与病理学系双站点解剖照片（fresh/fixed 组织，0.1 mm 重采样），配 GIMP v2.8 手工二值分割掩码（脑片正面 versus 背景/片外组织/皮质表面） 35

医学影像病理图像医学图像分割图像分类评测基准肿瘤学

Annotated Whole-Slide Images of Core Needle Prostate Biopsies — 西班牙单机构前列腺穿刺活检 H&E 全切片 15,480 条像素级专家注释数据集

人工标注影像数据原始数据32 位患者 / 60 条穿刺活检芯 / 37 张 WSI

西班牙坎塔布里亚 Marqués de Valdecilla 医院牵头的 37 张前列腺穿刺活检（CNB）H&E 全切片（WSI）、60 条活检芯、32 位患者、15,480 条泌尿病理学家像素级共识注释，含临床诊断表与芯映射表，CC BY 4.0 于 Zenodo 全公开直链

西班牙 Hospital Universitario Marqués de Valdecilla 单机构前列腺穿刺活检 H&E 全切片图像（含 IHC 辅助参考）+ 泌尿病理学家共识像素级专家注释 + clinical_diagnosis.csv 临床诊断表 + core_mapping.csv 芯-切片-患者映射表 + classes.txt 类别定义 35

医学影像病理图像医学图像分割多模态评测基准肿瘤学

PRECISE — 首个配对 H&E — IHC 前列腺穿刺 WSI 像素级专家标注数据集

人工标注影像数据原始数据25 例患者（25 subjects，sub-01 至 sub-25）；Zenodo/medRxiv 口径另称 37 core needle biopsies；54 张配对 WSI

PRostate Expert-annotated Contiguous IHC–H&E Serial sEctions——25 例前列腺穿刺活检的配对 H&E 与 HMWCK-AMACR 双染色 WSI，24,387 个跨染色语义谐调像素级标注，以 IHC 为边界金标准、镜像 H&E-then-IHC 两阶段临床流程，CC BY 4.0 于 Zenodo 完全开放

西班牙坎塔布里亚大学医院 Marqués de Valdecilla 病理科 de novo 采集的 25 例前列腺穿刺活检配对 H&E 与 HMWCK-AMACR (CKAPM+racemase) 免疫组化全切片图像（OME-TIFF 金字塔，6 层，0.243 μm/px，RGB uint8，3DHISTECH Pannoramic 250/1000 扫描）+ 跨 7 类诊断关键类别的 24,387 个像素级语义分割标注 + QuPath 掩码 + participants.csv 临床元数据 40

医学影像病理图像图像分类骨骼肌肉影像评测基准肿瘤学

PAIR-BST — 病理学家标注的骨与软组织肿瘤区域级 H&E 病理图像检索数据集

人工标注影像数据原始数据268 名患者；470 张 WSI；2,252 张病理学家标注 ROI 图像

470 张 WSI / 268 名患者 / 2,252 张病理学家标注 ROI —— 覆盖 33 种组织学诊断、11 种分化谱系、6 种生长模式的骨与软组织肿瘤 H&E 检索数据集，CC BY-NC 4.0 于 figshare+ 公开，暴露病理基础模型在罕见亚型与生长模式判别上的短板

骨与软组织肿瘤 H&E 组织病理图像：470 张全切片图像（WSI）切取 2,252 张病理学家标注感兴趣区域（ROI）图像 + 结构化元数据 CSV（Sarcoma_WSI_and_ROI_Metadata.csv，423.31 kB），覆盖 33 种组织学诊断、11 种分化谱系、6 种生长模式 37

心血管疾病医学影像时序数据评测基准

Ideal Left Ventricle Cardiac Flow — 理想化左心室三维 CFD 血流动力学仿真数据集

3D CFD 仿真流场（非真实患者数据）理想化半椭球 LV 腔动壁仿真层流 Re≈5500 不可压缩牛顿血液流心动周期 T=1s 时序场量快照无患者——理想化左心室腔 CFD 仿真（几何源自 Zheng 2012 与 Vedula 2014 文献标准模型，ESV=67 mL 生理校准）；论文教程另含 figshare 开源患者特异性几何与

马德里理工大学 UPM 团队（Lazpita/Le Clainche）发布的理想化左心室腔三维 CFD 血流动力学仿真数据集：半椭球动壁腔体、不可压缩牛顿血液流、层流 Re≈5500、60 bpm E/A 波生理入流、δt=5e-4 秒、双商业求解器交叉验证，配套涡环形成-演化研究与 ModelFLOWs-app 公开教程，结果发表于 Results in Engineering 24 (2024) 103644

ModelFLOWs-app 数据库 Cardiac Flow 条目（Google Drive 公开文件夹）：理想化左心室腔三维瞬态 CFD 流场（官网生成口径 Ansys Fluent 2024R2；论文验证口径 Fluent 2023 R1 + STAR-CCM+ 2023.06 双求解器），动壁半椭球腔 ESV=67mL，Re≈5500，δt=5e-4s，60 bpm E/A 波入流 37

生理信号心电信号医学影像挑战赛数据集心血管疾病

ECG-Image-Database — 大规模成对心电图图像与数字波形库

影像数据原始数据时序数据2,243 条 ECG 记录（PTB-XL 977 + Emory 1,000 + Akershus 266）；Ahus 子集 266 条对应 266 名患者，其余两源患者数未披露

2,243 条 12 导联 ECG 记录生成 37,191 张图像并逐图配对 WFDB 数字波形——PTB-XL、Emory、Akershus 三源，28 种真实世界伪影变体，支撑 Moody 2024 与 Kaggle ECG 图像数字化挑战赛，CC BY-ND 4.0 公开

PTB-XL 977 条（德国 PTB 公开 12 导联库，经许可 CC BY 4.0 再分发）+ Emory Healthcare 1,000 条（美国临床 12 导联）+ Akershus University Hospital 266 条（挪威热敏纸真实 ECG）——数字信号经 ECG-Image-Kit 合成打印、扫描、拍照与退化图像，逐图配对 WFDB 波形，Kaggle 托管 44

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