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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

按任务类型浏览

图像分类目标检测语义分割

共 769 个数据集

医学影像医学问答与基准手术视频评测基准

SERV-CT — 立体内镜 3D 重建验证基准

16 组立体对720×576 PNG16-bit 视差深度图CC BY 4.0 免费下载2 只猪尸体样本2 只 ex vivo 小型猪尸体(16 组立体对,非人类患者)

16 组锥形束 CT 参考立体对,免费开放的内镜 3D 重建验证基准

University College London (UCL WEISS) url: https://rdr.ucl.ac.uk/articles/dataset/SERV-CT_A_disparity_dataset_from_cone-beam_CT_for_validation_of_endoscopic_3D_reconstruction/26352199 56

医学影像医学问答与基准医学图像分割CT挑战赛数据集

BTCV — 腹部 CT 多器官分割基准

50 例增强腹部 CT13 类器官逐体素标注NIfTI 格式Synapse 注册后免费获取约 6 GB（Abdomen）50 名患者（30 训练 + 20 测试）

50 例增强 CT、13 器官逐体素标注的 MICCAI 2015 挑战赛基准

Vanderbilt University Medical Center（MICCAI 2015 BTCV 挑战赛） url: https://www.synapse.org/#!Synapse:syn3193805 95

医学影像病理图像医学图像分割挑战赛数据集

COSAS 2024 — 跨域腺癌分割

580 张 H&E 病理 patch约 1500×1500 像素手工轮廓像素级标注训练集注册后获取580 张 H&E patch（两任务各 290 张；患者级计数官方未披露）

580 张 H&E 病理 patch、6 器官与 6 扫描仪双赛道域泛化挑战赛

COSAS 2024 组织委员会（西交利物浦大学 / 上海交通大学医学院附属瑞金医院 / 深圳大学 / 广西医科大学 / Histo Pathology Diagnostic Center） url: https://cosas.grand-challenge.org 36

医学影像医学图像分割内窥镜影像结直肠癌肿瘤学

BKAI-IGH NeoPolyp — 结肠镜息肉分割与肿瘤性检测

7,466 标注图像4 种光成像模式6 种 Paris 分型3 类息肉分类~314 MB (Small)单中心数据集，越南河内 IGH

BKAI Center for AI, Hanoi University & Institute of Gastroenterology and Hepatology 103

医学影像MRI肿瘤学脑肿瘤

FeTS — 跨机构联邦脑肿瘤分割 MRI 数据集

25,256 例 MRI 扫描6,314 名患者71 家机构 6 大洲NIfTI 格式公开挑战数据 1,470 例注册后开放获取6,314 名胶质母细胞瘤患者（联邦全量口径）

71 机构联邦脑胶质瘤 MRI 分割数据集（25,256 例扫描）

FeTS Initiative Consortium（宾夕法尼亚大学发起） url: https://www.fets.ai/ 68

医学影像医学问答与基准骨骼肌肉影像MRI评测基准

MRNet — 膝关节 MRI 损伤检测数据集

约 6.09GB zip1,370 例检查2001-2012 年数据三平面 .npy 体积申请审核获取1,312 名患者 / 1,370 例检查

1,370 例斯坦福膝关节 MRI · ACL/半月板/异常三任务 · 匹敌放射科医生的经典基准

Stanford Machine Learning Group（斯坦福大学） url: https://stanfordmlgroup.github.io/competitions/mrnet/ 79

药物发现与化学肿瘤学分子性质预测化学信息学

CTRP v2 癌细胞系药敏数据库

约 900 细胞系 × 545 化合物AUCEC50 药敏 + 分子特征开放下载 CC BY 4.0txtCSV 多表非患者数据，细胞系药敏数据

约 900 细胞系 × 545 化合物的肿瘤药敏矩阵与分子特征库

Broad Institute, Center for the Science of Therapeutics (CTD²) url: https://portals.broadinstitute.org/ctrp.v2.1/ 96

医学影像MRI心血管疾病挑战赛数据集

CMRxRecon — 心脏 MRI k 空间重建基准数据集

300 名受试者（120/60/120 划分）复值多线圈 .mat + NIFTI 分割R=4/8/10 欠采样 · 24 行 ACSSynapse 注册后开放300 名健康志愿者（160 女 / 140 男）

300 名受试者心脏 MRI 原始 k 空间 · MICCAI 2023 重建挑战赛官方基准

CMRxRecon Consortium（复旦大学、厦门大学、帝国理工学院等） url: https://cmrxrecon.github.io/ 51

医学影像手术视频内窥镜影像

MISAW — 显微吻合手术工作流识别数据集

27 个显微吻合序列30 Hz 视频+运动学同步phasestepactivity 三层标注920×540 立体显微视频Synapse 注册后开放无患者数据（6 名受试者在人造血管上操作）

27 序列显微吻合视频+运动学双模态，三层工作流粒度基准

Univ Rennes, INSERM, LTSI - UMR 1099（挑战赛组织）& 东京大学（数据采集） url: https://www.synapse.org/MISAW 56

医学影像医学问答与基准图像分类皮肤影像评测基准皮肤癌

MED-NODE — 临床皮肤照片黑色素瘤数据集

约 24.7MB zip170 张图像70 黑色素瘤 + 100 痣非皮肤镜临床照片免费下载引用论文即可使用170 张图像

最常用的非皮肤镜临床照片基准 · 170 张图像 · 真实世界评估场景

格罗宁根大学 & 格罗宁根大学医学中心（UMCG）皮肤科 url: https://www.cs.rug.nl/~imaging/databases/melanoma_naevi 54

药物发现与化学基因组学与多组学分子性质预测肿瘤学药物-靶点相互作用虚拟筛选

DepMap / CCLE — 癌症依赖图谱与癌细胞系百科全书

Chronos 分数RNA-seq突变拷贝数2,000+ 癌细胞系（24+ 癌种）

Broad Institute Project Achilles + CCLE, 全球多中心贡献 101

医学影像CT骨骼肌肉影像目标检测医学图像分割

MedPelvis3D — 99 例骨盆 CT 的 57 点 3D 地标与三骨段网格

人工标注影像数据原始数据点云数据99 例去标识骨盆 CT（59 男 / 40 女）；57 个解剖地标/例；297 个网格组件；4,950,000 点参考点云

解放军总医院 99 例去标识骨盆 CT（59 男/40 女），每例 CT 体数据 + 三标签掩膜 + 3 个 STL 网格 + 57 个专家 3D 地标 + 5 万点参考点云，LPS 毫米坐标，配 scikit-image 0.26.0 重生成的零缺陷网格与 3.44/4.56 mm 标注一致性实测

解放军总医院回顾性骨盆 CT（NIfTI，512×512 面内，层厚 0.625 mm）+ 三标签骨分割掩膜 + 重生成 STL 网格 + 57 地标 CSV + 5 万点 npy + 队列元数据 CSV 25

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