乳腺癌

乳腺癌是发生于乳腺导管或小叶上皮细胞的恶性肿瘤，常见病理类型包括浸润性导管癌和小叶癌。其发病与遗传因素（如BRCA1/2突变）、激素暴露、生活方式等多种内外源因素相关。典型临床表现包括乳房无痛性肿块、乳头溢液、皮肤橘皮样改变及腋窝淋巴结肿大。诊断主要依靠乳腺X线摄影、超声、MRI及空芯针穿刺活检，并通过免疫组化检测ER、PR、HER2表达指导分型与治疗。治疗策略整合手术、放射治疗、化疗、内分泌治疗及靶向治疗，强调基于分子亚型的个体化综合管理。乳腺癌已成为精准医学与真实世界研究的重点病种，全球疾病负担持续上升，早期筛查与全程管理显著改善患者预后。

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共 5561 个数据集

BRCA1介导的miRNA与mRNA特征整合揭示miR-146a、miR-99b和miR-205对TRAF2和NFkB通路的调控（mRNA数据集）

基因组回归Transcriptome or Gene expression

该数据集来自NCBI，属于肿瘤/乳腺癌分类下的转录组或基因表达数据。源站描述围绕BRCA1失调在乳腺癌等肿瘤发病中的高频事件展开，整合了HCC1937乳腺癌细胞系及稳定表达BRCA1的同源细胞系的mRNA与miRNA微阵列实验数据，用于发现与BRCA1表达相关的显著miRNA-mRNA关系，揭示mi

PRJNA1144435：乳腺癌进展三维基因组图谱 [ChIP-seq]

基因组分类Epigenomics

数据围绕乳腺癌自然病程中三维基因组结构的变化展开，覆盖从发生到进展的过程，并分析同一患者的肿瘤以评估转移相关改变。源站描述指出，在肿瘤发生和转移过程中，拓扑关联结构域（TADs）和区室层面的基因组组织高度稳定，但在代表重度经治进展性疾病的胸膜转移中，三维基因组受到显著影响且患者间高度异质

BRPF1降解剂在肿瘤细胞中的作用机制研究

基因组Raw sequence reads

该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1483057），主题为 BRPF1 降解剂在肿瘤细胞中的作用机制研究，属于肿瘤与乳腺癌相关方向，数据主题标签为 Raw sequence reads

PRJNA283814：乳腺癌上皮-基质共表达网络重塑的ER阳性验证数据集

医学影像分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI，属于肿瘤/乳腺癌分类下的转录组或基因表达数据，英文名为 PRJNA283814，是乳腺癌上皮-基质共表达网络重塑研究的 ER 阳性乳腺癌验证数据集

PRJNA1479223：嵌合4/9ICR重编程免疫抑制IL-4信号增强B7-H3靶向CAR-T细胞抗三阴性乳腺癌疗效

时间序列分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1479223），主题为嵌合 4/9ICR 重编程免疫抑制 IL-4 信号以增强 B7-H3 靶向 CAR-T 细胞对三阴性乳腺癌的疗效

PRJNA1460278：适配体-CRBNL PROTAC靶向降解SETDB1作为乳腺癌新型治疗策略

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1460278），主题为通过适配体-CRBNL PROTAC靶向降解SETDB1，作为乳腺癌的一种新型治疗策略

HER2+ 女性肠道菌群数据集

基因组分类Raw sequence reads

该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1466613），主题为 HER2+ 癌症女性的肠道菌群，属于肿瘤/乳腺癌方向

整合轨迹推断与自解释预测模型探索单细胞分辨率下乳腺癌细胞状态转变

时间序列分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自浸润性导管乳腺癌的单细胞RNA测序，覆盖超过5,000个细胞，识别出跨越肿瘤与肿瘤微环境群体的六个不同细胞簇

RxPONDER：1-3个阳性淋巴结、激素受体阳性、HER2阴性且复发评分≤25的乳腺癌患者标准辅助内分泌治疗±化疗的III期随机临床试验

其他预测Phenotype or Genotype

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov，对应 NCTN RxPONDER（S1007）III期随机临床试验，研究对象为1-3枚阳性淋巴结、激素受体阳性、HER2阴性且复发评分不超过25的乳腺癌患者，比较标准辅助内分泌治疗联合或不联合化疗的效果

PRJNA984258：乳腺癌 Notch 转录组特征识别 [dataset1]

时间序列分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI，属于肿瘤/乳腺癌方向，主题为转录组或基因表达。其内容围绕建立乳腺癌 Notch 信号转录组特征：先从六种 basal-like 乳腺癌细胞系中，通过 Jagged1 固定化培养提升 Notch 信号或用 γ-secretase 抑制剂阻断 Notch，识别受 Notch 调控

PRJNA1476021：结肠癌染色体外环状DNA全基因组特征及其在癌变与进展中的功能作用 [miRNA]

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1476021），主题为结肠癌中染色体外环状DNA（extrachromosomal circular DNA）的全基因组特征及其在癌变与进展中的功能作用，并包含 miRNA 相关数据

PRJNA1460343：单细胞RNA测序与非靶向代谢组学整合揭示β-榄香烯在三阴性乳腺癌中的免疫与代谢调节

基因组分类Transcriptome or Gene expression

该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1460343），主题为转录组或基因表达，属于肿瘤/乳腺癌分类。数据整合了单细胞 RNA 测序与非靶向代谢组学，用于研究 β-榄香烯在三阴性乳腺癌中的免疫与代谢调节作用