PRJNA1460278：适配体-CRBNL PROTAC靶向降解SETDB1作为乳腺癌新型治疗策略
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1460278），主题为通过适配体-CRBNL PROTAC靶向降解SETDB1，作为乳腺癌的一种新型治疗策略
基本信息
资源简介
PRJNA1460278：适配体-CRBNL PROTAC靶向降解SETDB1作为乳腺癌新型治疗策略
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1460278），英文名称为“Targeted Degradation of SETDB1 by an Aptamer-CRBNL PROTAC as a Novel Therapeutic Strategy for Breast Cancer”，源站标题为“Targeted Degradation of SETDB1 by an Aptamer-CRBNL... (ID 1460278) - BioProject - NCBI”。其主题围绕通过适配体-CRBNL PROTAC靶向降解SETDB1，探索乳腺癌的一种新型治疗策略。本站将其归类于肿瘤 / 乳腺癌方向，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明该数据集与转录组或基因表达研究相关。整体来看，该数据集是一个与乳腺癌治疗策略研究相关的生物项目记录，用户可通过该记录获取该项目所关联的多种数据类型入口。
【数据集背景】
该数据集所对应的研究聚焦于乳腺癌治疗领域，核心思路是利用适配体-CRBNL PROTAC实现对SETDB1的靶向降解，并将其作为乳腺癌的一种新型治疗策略。SETDB1是该策略中的靶向降解对象，适配体-CRBNL PROTAC则是实现降解的手段。该研究属于肿瘤学与乳腺癌方向的转化研究范畴，旨在探索新的治疗干预方式。该数据集作为BioProject记录，用于汇集与这一研究计划相关的生物学数据。关于该研究更具体的立项背景、疾病模型选择依据、靶点选择理由等信息，源站未提供。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容与转录组或基因表达相关。作为BioProject记录，它提供用户查找该项目所产生的多种数据类型的统一入口。该项目的英文名称明确指向SETDB1的靶向降解以及适配体-CRBNL PROTAC在乳腺癌治疗中的应用。关于具体的数据文件类型、样本数量、测序平台、基因表达矩阵、差异表达结果、原始数据与处理后数据的具体构成等信息，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于NCBI BioProject，来源站为ncbi.nlm.nih.gov，项目ID为1460278。BioProject是围绕单一研究计划或倡议收集生物学数据的集合，这些计划可来自单一组织或联合体。BioProject记录为用户提供一个统一位置，以便找到该项目所产生的不同数据类型之间的链接。该数据集即属于此类记录，其源站标题为“Targeted Degradation of SETDB1 by an Aptamer-CRBNL... (ID 1460278) - BioProject - NCBI”。关于样本采集方法、实验设计、组织来源、伦理审批信息、具体提交机构或联合体名称等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与乳腺癌治疗策略相关的研究场景，尤其是涉及SETDB1靶向降解、适配体-CRBNL PROTAC应用以及转录组或基因表达分析的方向。研究人员可借助该BioProject记录查找该项目关联的多种数据类型，用于了解该研究计划所生成的数据资源。由于主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，其潜在适用场景包括基因表达层面的分析、转录组数据挖掘以及与该治疗策略相关的机制探索。关于该数据集是否适用于临床决策、药物开发、生物标志物验证等具体应用，源站未提供。
【使用方法】
作为BioProject记录，该数据集的使用方式是通过其提供的统一入口访问该项目所关联的多种数据类型。用户可在NCBI BioProject页面中根据项目ID 1460278定位该记录，并进一步跳转至该项目生成的数据资源。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程、软件工具、参数设置或复现步骤等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为NCBI BioProject记录，其描述中说明BioProject是围绕单一研究计划收集生物学数据的集合，并提供查找多种数据类型的统一入口。该记录的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，项目名称指向SETDB1靶向降解与乳腺癌治疗策略。关于数据质量评估指标、样本量大小、测序深度、数据完整性、批次效应、技术偏差或验证实验结果等具体质量信息，源站未提供。因此，使用者在依赖该数据集开展分析前，应自行查阅源站以获取更详细的质量与限制说明。
【引用与许可】
该数据集的来源站为ncbi.nlm.nih.gov，项目ID为1460278，英文名称为“Targeted Degradation of SETDB1 by an Aptamer-CRBNL PROTAC as a Novel Therapeutic Strategy for Breast Cancer”。关于该数据集的引用格式、许可协议、使用条款、数据共享政策或版权归属等具体信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1460278
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
蛋白水解靶向嵌合体（PROTACs）代表了一种新型治疗策略，它利用泛素-蛋白酶体系统实现靶向蛋白质降解。适配体因其高特异性和结合亲和力，近年来被探索作为PROTAC设计中的替代识别元件。在此，我们开发了一种基于适配体的PROTAC，靶向SET结构域分叉组蛋白赖氨酸甲基转移酶1（SETDB1），这是一种与乳腺癌进展相关表观遗传调控因子。我们将前期工作中鉴定出的SETDB1特异性适配体通过点击化学偶联至CRBN E3连接酶配体，生成了一种血清稳定的PROTAC，命名为P-SETDB1-4。P-SETDB1-4有效招募CRBN至SETDB1，诱导乳腺癌细胞中SETDB1的蛋白酶体依赖性降解。因此，P-SETDB1-4显著抑制乳腺癌细胞的增殖和迁移。此外，P-SETDB1-4增强CD8+ T细胞对乳腺癌细胞的细胞毒性，并在体内抑制肿瘤生长。RNA测序分析阐明了P-SETDB1-4介导的肿瘤抑制及促进CD8+ T细胞介导杀伤的分子机制。
本研究为乳腺癌提供了一种有前景的治疗策略，并凸显了适配体-CRBNL PROTACs在靶向其他难治性致癌蛋白方面的潜力。总体设计：检测转染对照PROTAC和P-SETDB1-4的MCF-7细胞中的基因表达变化。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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