PRJNA1460343：单细胞RNA测序与非靶向代谢组学整合揭示β-榄香烯在三阴性乳腺癌中的免疫与代谢调节
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1460343），主题为转录组或基因表达，属于肿瘤/乳腺癌分类。数据整合了单细胞 RNA 测序与非靶向代谢组学，用于研究 β-榄香烯在三阴性乳腺癌中的免疫与代谢调节作用
基本信息
资源简介
PRJNA1460343：单细胞RNA测序与非靶向代谢组学整合揭示β-榄香烯在三阴性乳腺癌中的免疫与代谢调节
该数据集为 NCBI BioProject 收录项目，编号 1460343，英文标题为“Integrated single-cell RNA sequencing and untargeted metabolomics reveals β-elemene’s immune and metabolic modulation in triple-negative breast cancer”。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，在本站归入肿瘤/乳腺癌分类。项目整合了单细胞 RNA 测序与非靶向代谢组学两类技术路线，围绕 β-榄香烯在三阴性乳腺癌中发挥的免疫与代谢调节作用展开研究。BioProject 作为生物数据的集合记录，旨在将同一项研究计划下产生的多种数据类型汇聚于一处，便于用户集中查找和访问。该数据集因此可作为探索三阴性乳腺癌转录组特征、单细胞层面细胞异质性以及代谢变化的重要资源入口。
【数据集背景】
三阴性乳腺癌是乳腺癌中较为特殊的一种亚型，其治疗选择相对有限，因此探索新的干预手段及其作用机制具有研究价值。β-榄香烯是一种受到关注的天然来源化合物，本研究试图从免疫调节和代谢调节两个层面理解其作用。该数据集来自 NCBI BioProject，编号 1460343，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站分类为肿瘤/乳腺癌。BioProject 的设计目标是把与单一研究计划相关的生物数据集中收录，使用户能够通过一条记录找到该项目产生的多种数据类型。源站描述指出，BioProject 记录来源于单一组织或联盟，并为用户提供查找项目相关多样数据类型的统一入口。该项目的标题明确体现了单细胞 RNA 测序与非靶向代谢组学的整合思路，以及在三阴性乳腺癌背景下研究 β-榄香烯免疫与代谢调节作用的目标。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容与转录组或基因表达相关。项目标题进一步说明，数据整合了单细胞 RNA 测序与非靶向代谢组学。单细胞 RNA 测序可用于在单个细胞层面获取基因表达信息，非靶向代谢组学则用于检测样本中的代谢物特征。两者结合，有助于从免疫与代谢两个维度研究 β-榄香烯在三阴性乳腺癌中的作用。关于具体的样本数量、细胞数量、代谢物数量、测序平台、数据处理流程、差异表达基因列表或代谢通路结果等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI BioProject，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 1460343。源站描述说明，BioProject 是来源于单一组织或联盟、与单一研究计划相关的生物数据集合，并为用户提供查找该项目所产生多样数据类型的统一位置。该项目的英文标题为“Integrated single-cell RNA sequencing and untargeted metabolomics reveals β-elemene’s immune and metabolic modulation in triple-negative breast cancer”。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、实验动物或细胞系来源、受试者信息等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与三阴性乳腺癌相关的转录组和基因表达研究，尤其适合关注单细胞层面基因表达特征、免疫调节机制以及代谢变化的研究场景。由于项目整合了单细胞 RNA 测序与非靶向代谢组学，也可用于探索 β-榄香烯处理后免疫与代谢两个层面的关联分析。此外，该数据集可作为 NCBI BioProject 中肿瘤/乳腺癌分类下的数据资源，供研究人员查找同一项目下的多种数据类型。关于具体的分析流程、推荐工具、统计方法或验证实验设计，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 记录查找该项目，并借助 BioProject 提供的统一入口访问与该项目相关的多样数据类型。源站描述指出，BioProject 记录使用户能够在一个位置找到为该项目生成的不同数据类型链接。关于数据下载方式、文件格式、访问权限、是否需要申请、配套分析代码或使用教程等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站分类为肿瘤/乳腺癌。项目标题表明其整合了单细胞 RNA 测序与非靶向代谢组学，用于研究 β-榄香烯在三阴性乳腺癌中的免疫与代谢调节作用。关于数据质量评估指标、批次效应、样本量大小、测序深度、代谢物鉴定置信度、数据完整性或潜在偏倚等，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject，编号 1460343，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式、许可协议、使用条款、数据共享政策或版权归属等，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1460343
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
三阴性乳腺癌（TNBC）因其侵袭性表型及缺乏靶向治疗选择，对女性健康构成重大挑战。β-榄香烯是一种从温郁金中分离得到的倍半萜烯，已显示出对TNBC的临床获益；然而，其作用机制，特别是在免疫与代谢肿瘤微环境方面，仍鲜有阐明。在本研究中，我们采用单细胞RNA测序和非靶向代谢组学，利用4T1原位小鼠模型，探究β-榄香烯如何重塑TNBC的细胞与代谢格局。我们的研究结果有望首次全面阐明β-榄香烯在TNBC中的双重免疫调节与代谢效应，凸显天然化合物增强抗肿瘤免疫的潜力。总体设计：为建立肿瘤，将4T1细胞（1 × 10⁶个细胞）悬浮于Matrigel与磷酸盐缓冲液（PBS）的等量混合物中。随后将悬液注射至每只小鼠的乳腺脂肪垫内。
小鼠被随机分为两组：β-榄香烯治疗组，每日腹腔注射β-榄香烯（30 mg/kg）；对照组，注射等量生理盐水。治疗18天后，收集肿瘤并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）进行分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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