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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1433 个数据集

医学影像眼科影像医学图像分割青光眼

70 条整夜单导联 ECG 的睡眠呼吸暂停逐分钟筛查基准——为 PhysioNet 首届 Computers in Cardiology Challenge 2000 组装，人类专家基于呼吸信号逐分钟标注 A/N，赛后成为二十余年 ECG-based 筛查研究的公共起点，ODC-By 1.0 全开放

PhysioNet Apnea-ECG Database version 1.0.0（doi:10.13026/C23W2R）：70 条整夜单导联 ECG（100 Hz，16 bits/sample，WFDB 格式 .dat/.hea）+ .apn 逐分钟 A/N 人工专家标注 + .qrs 逐搏机器标注（sqrs125 生成，未审计）+ 8 条记录附加呼吸三通道（胸/腹感应容积描记与鼻气流，20 Hz）与 SpO2（1 Hz） 40

医学影像眼科影像糖尿病视网膜病变

MESSIDOR — 糖尿病视网膜病变眼底影像数据库

1,200 张彩色眼底影像TIFF 格式约 2.5 GBDR 四级分级 + 黄斑水肿风险约 1,200 例

ADCIS / MINES ParisTech / LaTIM INSERM UMR 1101（https://www.adcis.net/en/third-party/messidor/） 95

医疗NLP电子健康记录

Nosocomial Risk Datasets — MIMIC-III 院内获得性疾病风险数据集

HAAKI 34,878 住院HAPI 35,218 住院HAA 38,385 住院24-96h 预测窗UMLS CUI 快照序列来自 MIMIC-III 46,520 患者的三疾病住院队列（HAAKI 34,878 / HAPI 35,218 / HAA 38,385）

Nosocomial Risk Datasets：34,878+35,218+38,385 住院 × 临床文本的间接监督标签工厂——用规则造标签、用文本学风险的院感预测基准

https://physionet.org/content/nosocomialriskdata/ 58

医学影像眼科影像医学图像分割皮肤影像青光眼骨骼肌肉影像

RIM-ONE — 青光眼视神经评估眼底图像

485 幅统一版眼底图像159 幅立体眼底像（v3）视盘视杯分割掩码免费研究用途获取485 幅眼底图像（统一版 RIM-ONE DL，患者总数未公开）

485 幅统一版青光眼眼底图像与视盘视杯分割金标准

拉拉古纳大学（University of La Laguna）与圣克鲁斯-德特内里费大学医院（HUC） url: https://github.com/miag-ull/rim-one-dl 74

药物发现与化学电子健康记录化学信息学医疗登记影像-文本对齐

TrialBench — 多模态临床试验预测数据集

约 480000+ 临床试验记录23 个 AI-Ready 子数据集8 大预测任务48 万+ 试验记录

香港科技大学(广州) / 南京大学 / Harvard / Stanford / IQVIA 联合开发 — https://huyjj.github.io/Trialbench/ 79

医学影像CT多模态影像-文本对齐挑战赛数据集评测基准

VLM3D 2025

人工标注影像数据原始数据训练/验证 21,304 位独立患者（25,692 个 study / 50,188 个 volume / 超 1,430 万张 slice）；评测集 2,000 例内部 + 1,024 例波士顿大学

MICCAI 2025 官方注册的 3D 医学影像视觉语言建模挑战赛——基于 CT-RATE 25,692 例胸部 CT 与配对放射学报告，设 CT 报告生成、多异常分类、自监督多异常定位、文本条件 3D CT 生成四大任务，Docker 容器服务端评测封闭测试集，冠军方法发表于 ICCV 2025 Workshop，2026 届扩展 MR-RATE 脑 MRI 赛道

CT-RATE 非增强胸部 CT（土耳其伊斯坦布尔梅迪波尔医院单中心，3 家厂商扫描仪，年龄 18-102 岁，性别均衡）+ 放射科医生撰写的 impression/findings 配对报告 + 微调 RadBERT 从报告自动抽取的 18 种胸部异常多标签 70