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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1355 个数据集

医学影像病理图像医学图像分割结直肠癌

CoNSeP — 结直肠癌核实例分割基准

41 张 40× H&E 瓦片24,319 个核实例标注16 例患者 WSIZIP 约 146MB开放直接下载16 名结直肠腺癌患者

41 张 40× H&E 结直肠腺癌瓦片 · 24,319 个 7 类核实例标注

University of Warwick（Tissue Image Analytics 实验室） url: https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/data/hovernet/ 72

生理信号医学问答与基准心电信号挑战赛数据集时序数据

CPSC — 中国生理信号挑战赛心电数据集系列

6,877 条 12 导联 ECG四届赛事官方数据500 Hz400 Hz200 HzCC BY 4.0 开放获取隐藏测试集不公开1.3 万+ 条心电记录

中国首个心电 AI 挑战赛系列 · 12 导联分类到动态心电房颤检测

中国生理信号挑战赛组委会（东南大学刘澄玉团队 × ICBEB） url: http://2018.icbeb.org/Challenge.html 109

基因组学与多组学电子健康记录GWAS临床电子病历队列研究

dbGaP — 基因型-表型档案数据库

约 3,000 项研究约 510 万名受试者VCFCSVSRA 格式受控访问获取约 510 万名研究受试者（累计，截至 2025-12）

约 3,000 项研究、510 万名受试者的受控访问基因组-表型档案

NCBI（NLM/NIH） url: https://dbgap.ncbi.nlm.nih.gov/ 46

医学影像皮肤影像肿瘤学

SLICE-3D — ISIC 2024 3D 全身照相皮损数据集

401,059 张皮损裁剪图1,042 名患者恶性率仅 0.1%约 1.2GB 图像CC-BY-NCCC-BY 双许可Kaggle 8 万美元竞赛1,042 名患者 · 40.1 万张皮损图

全球最大 3D-TBP 皮肤癌筛查数据集 · 40.1 万皮损裁剪 · 约 1:1,000 极端不平衡

国际皮肤影像协作组（ISIC）& 纪念斯隆凯特琳癌症中心（MSK） url: https://challenge2024.isic-archive.com/ 65

电子健康记录医学问答与基准重症监护临床电子病历医疗登记死亡登记

ANZICS APD — 澳新 ICU 成人质控注册数据库

350 万+ 次住院发作约 19.9 万成人次年（FY2022/23）季度提交受控申请获取CSVExcel 定制提取350 万+ 次 ICU 住院发作（成人，截至 2026-09 官方口径）

350 万+ 次 ICU 入院的澳新双国质控级注册数据库

澳大利亚与新西兰重症监护学会成果与资源评估中心（ANZICS CORE） url: https://www.anzics.org/advocacy/core-icu-registries/registry-datasets/adult-patient-database 58

医学问答与基准乳腺癌图像分类病理图像评测基准

PCam — 淋巴结转移病理图像分类基准

约 8 GB HDF5,327,680 张 patch262,144/32,768/32,768 三划分CC0 公共领域上游 400 张全切片（CAMELYON16）

327,680 张 96×96 淋巴结 H&E patch，单卡可训的转移检测基准

University of Amsterdam（PatchCamelyon 官方，数据托管于 Zenodo） url: https://zenodo.org/record/2546921 58

医学影像公共卫生与流行病学脑影像

ENIGMA — 国际多中心脑影像遗传联盟

50 个活跃工作组43 国 200+ 机构GWAS 汇总 51,665 人26 种脑疾病协议公开共享汇总统计申请获取代表性 GWAS 汇总 30,717-51,665 名受试者

50 个工作组、43 国 200+ 机构的分布式脑影像遗传荟萃分析联盟

ENIGMA Consortium（USC Stevens 神经影像与信息学研究所） url: http://enigma.ini.usc.edu/ 76

医学影像目标检测CT

DeepLesion — 大规模CT病灶检测数据集

约220GB（56个zip）32,735个病灶4,427名患者免费无限制使用4,427名患者

NIH 临床中心影像生物标志物与计算机辅助诊断实验室 187

药物发现与化学化学信息学虚拟筛选

ZINC — 全球最大可购买化合物虚拟筛选数据库

375亿化合物 · 150+供应商化合物

375亿化合物 · 150+供应商 · 超大规模对接 · UCSF · 免费使用

是由加州大学旧金山分校（UCSF）制药化学系 Irwin & Shoichet 实验室开发和维护的免费化合物数据库 135

医学影像多模态手术视频眼科影像

Cataract-101 — 白内障手术视频阶段数据集

101 台手术视频10 阶段标注约 8.3 GB 压缩包CC BY-NC 4.0 免费下载720×540 显微视频101 台白内障手术（去标识视频）

101 台手术显微视频 · 10 阶段标注 · 4 名外科医生双经验级

Multimedia Systems Group, Institute of Information Technology (ITEC), Alpen-Adria-Universität Klagenfurt url: https://ftp.itec.aau.at/datasets/ovid/cat-101 56

药物发现与化学化学信息学药物安全虚拟筛选

DrugBank — 药物与药物靶点知识库

约 1.2 万药物条目约 141 万药物-药物相互作用约 4900 靶点药物知识库，非患者数据集

1.2万药物 · 140万药物相互作用 · 4900靶点 · 11监管区 · 20年持续运营

University of Alberta & OMx Personal Health Analytics | https://go.drugbank.com 97

医学影像基因组学与多组学影像-文本对齐

MultiMedBench — 谷歌医学多任务多模态基准

14 项任务12 个数据集超 100 万样本7 种数据模态许可证混合（部分需 CITI 认证）无统一打包下载Google Research 发布超 100 万样本（12 个去标识化数据集）

Med-PaLM M 配套评测基准 · 14 任务 12 数据集 7 模态 · 超 100 万样本

Google Research & Google DeepMind url: https://research.google/pubs/towards-generalist-biomedical-ai/ 96

定制数据集服务

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