即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1355 个数据集

医学影像生理信号手术视频内窥镜影像步态与运动

CholecT50 — 腹腔镜手术动作三元组数据集

50 段手术视频约 100,900 标注帧151,000 三元组实例约 13,000 边界框CC BY-NC-SA 4.0 申请获取50 段腹腔镜胆囊切除术视频（约 100,900 个标注帧）

50 段腹腔镜胆囊切除视频、约 10.1 万帧、100 类器械-动词-目标三元组

CAMMA 研究组（ICube, University of Strasbourg / IHU Strasbourg） url: https://camma.u-strasbg.fr/datasets/ 84

药物发现与化学分子对接化学信息学

PDBbind — 蛋白-配体结合亲和力数据库

约 4GB（v2020 免费版）23,496 个复合物KdKiIC50 实验值注册免费获取CASF 金标准基准每年更新（v2021+ 商业版）2.3 万+ 复合物

蛋白-配体亲和力金标准数据库 · 2.3 万复合物 · CASF 基准发源地

复旦大学药学院王任小团队（PDBbind-CN / PDBbind+） url: http://www.pdbbind.org.cn/ 188

电子健康记录基因组学与多组学GWAS医疗登记队列研究

FinnGen — 芬兰全国基因组与健康队列

519,972 名参与者21,311,644 个插补变异2,755 个公开疾病终点汇总统计免费下载519,972 名参与者（R13 总基因型个体，截至 2026-09）

52 万芬兰生物银行个体的基因组-全国登记联动队列 · 2,755 个疾病终点 GWAS

FinnGen（芬兰生物银行公私合作伙伴项目，THL / 赫尔辛基大学 FIMM / Broad Institute） url: https://www.finngen.fi/en 73

药物发现与化学医学影像分子性质预测化学信息学病理图像肿瘤学

NCI-60 — 60 系肿瘤药筛金标准

60 条人类肿瘤细胞系10 万+ 化合物筛选史约 511 MB 压缩下载包GI50TGILC50 五剂量终点免费开放下载60 条细胞系（非患者数据，9 大癌种组织来源）

60 个人类肿瘤细胞系 × 10 万+ 化合物的 36 年抗癌药筛全景

美国国家癌症研究所发展治疗学计划（NCI/DTP） url: https://dctd.cancer.gov/drug-discovery-development/assays/high-throughput-screening-services/nci60 51

基因组学与多组学肿瘤学蛋白质组学

CPTAC — 癌症蛋白质基因组多组学

约 70 TB（PDC 全库）10 癌种 1,073 例肿瘤6,644 名受试者开放+受控申请获取6,644 名受试者（dbGaP CPTAC-3 v17）

10 大癌种 1,073 例肿瘤的蛋白组×基因组×影像配对多组学公共数据

美国国家癌症研究所（NCI）CPTAC 联盟 / 蛋白质组数据共享平台 PDC url: https://pdc.cancer.gov 88

电子健康记录重症监护临床电子病历

MIMIC-BR — 巴西 ICU 匿名化 OMOP 临床数据库

约 2.88 万名成人患者11 张 OMOP-CDM 核心表约 408 万行结构化记录CSV + ATHENA 词汇表免费申请审核获取2.88 万名成人患者（28,799）

2.88 万名成人患者、3.42 万次住院的巴西首个公开 ICU 匿名化 EHR 数据库

Hospital Israelita Albert Einstein（PhysioNet 托管） url: https://physionet.org/content/mimic-br/1.0.1/ 99

医学影像图像分类病理图像肿瘤学乳腺癌

BreakHis — 乳腺癌组织病理图像数据库

7,909 张 H&E 显微图像82 名患者40×-400× 四倍率约 4 GB PNG免费非商业使用82 名患者

乳腺癌病理图像分类的事实基准 · 7,909 张图像 · 82 名患者

巴西巴拉那联邦大学（UFPR）VRI 实验室 & P&D Laboratory url: https://web.inf.ufpr.br/vri/databases/breast-cancer-histopathological-database-breakhis/ 65

医学影像CT肺癌目标检测

LUNA16 — 肺结节检测基准数据集

888 例 CT 扫描1,186 个标注结节551,065 个候选结节约 120 GB mhdrawCC BY 4.0 开放下载888 例胸部 CT 扫描（LIDC-IDRI 衍生队列）

888 例胸部 CT 与 1,186 个专家标注结节的肺结节检测公开基准

LUNA16 Grand Challenge（Radboud University Medical Center 等） url: https://luna16.grand-challenge.org/ 105

生理信号医学问答与基准睡眠信号评测基准

ISRUC-Sleep — 睡眠分期多导睡眠图基准

118 名受试者126 份整夜 PSG约 17.7 GB 下载包双专家 AASM 分期200 Hz 采样免费公开获取118 名受试者（126 份整夜 PSG 记录）

118 例受试者、126 份整夜 PSG 与双专家 AASM 分期基准

葡萄牙科英布拉大学系统与机器人研究所（ISR-UC） url: http://sleeptight.isr.uc.pt/ 102

医学影像病理图像医学图像分割肿瘤学

Lizard — 49.5 万核实例分割病理数据集

495,179 个核实例4,981 个 256×256 patch约 700 MB（CoNIC patch 版）CC BY-NC-SA 4.0 免费下载16 个中心3 个国家不适用（图像区域级数据集，未随数据公开患者级元数据）

49.5 万像素级标注核实例的结肠 H&E 病理分割分类数据集

华威大学 Tissue Image Analytics 中心（联合英国多家 NHS 病理科） url: https://warwick.ac.uk/lizard-dataset 93

医学影像公共卫生与流行病学全球健康医学图像分割目标检测眼科影像

E-ophtha — 眼底微动脉瘤与硬性渗出病灶级标注

463 张眼底彩照1,306 个微动脉瘤实例2,278 个渗出实例四种分辨率 JPEG+PNG 掩码免费申请获取463 次检查就诊（同一患者可多次就诊，独立患者数未公开）

463 张眼底彩照，微动脉瘤与硬性渗出像素级标注的远程筛查病灶金标准库

TeleOphta 联盟（OPHDIAT 网络 / MINES ParisTech / ADCIS） url: https://www.adcis.net/en/third-party/e-ophtha/ 75

医学影像X光影像图像分类目标检测结核病

TBX11K — 大规模结核胸片病灶检测数据集

11,200 张 512×512 胸片约 1,211 个结核病灶框约 3.8 GB PNG 压缩包免费直接下载6,600/1,800/2,800 官方划分11,200 名受检者（每张图对应一名个体）

11,200 张胸片 + 病灶级边界框，全球最大开放结核 X 光检测基准

南开大学 VCIP / TKLNDST（Media Computing Lab） url: https://github.com/yun-liu/Tuberculosis 46

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