即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

千方医数集致力于为医疗 AI 研究人员找到合适的数据集，让你的 AI 感知模型能够更快地学习、更准确地运行，并无缝适应现实世界的环境。

医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

按任务类型浏览

图像分类目标检测语义分割

共 1354 个数据集

药物发现与化学虚拟筛选药物-靶点相互作用

DrugComb — 药物联用筛选平台

74 万+ 组合实验4,268 种药物288 个癌细胞系CSV 免费获取CC BY-NC 许可非临床患者数据：2320 个细胞系样本背景（组合数据中 288 个细胞系）

74 万+ 药物组合实验，芬兰赫尔辛基大学开源药物联用数据仓库

University of Helsinki, Research Program in Systems Oncology (Jing Tang lab) url: https://drugcomb.org 132

医疗NLP电子健康记录临床文本临床电子病历生物医学文献评测基准

MEDIQA — 医患对话病历摘要评测数据集

1,701 段模拟医患对话20 类病历章节标签207 段完整就诊对话（ACI-BENCH）CC BY 4.0 免费获取CSV 文本格式0 名真实患者（模拟对话构建，不含 PHI）

1,701 段医患对话与结构化病历摘要，MEDIQA 系列官方评测数据

美国国家医学图书馆（NLM/NIH）与 Microsoft 研究团队（MEDIQA 系列组织方） url: https://sites.google.com/view/mediqa-shared-tasks 89

药物发现与化学多模态化学信息学评测基准

TDC — 治疗科学机器学习基准平台

66 个 AI-ready 数据集22 个学习任务29 个公开排行榜pip 一键安装3 行代码加载代码 MIT 许可无患者数据 · 分子/蛋白实体级

66 个数据集 · 22 个学习任务 · 药物发现全管线基准

Harvard Medical School Zitnik Lab & MIT & Stanford 等 url: https://tdcommons.ai 89

多模态医学影像视觉问答

VQA-Med — 医学影像视觉问答年度评测

跨 7 个年度版本累计约 3.5 万 QA 对放射+内镜多模态竞赛注册后获取逐年评测协议完整匿名医学影像问答对（非患者级，约 3.5 万 QA 对/7 年版）

ImageCLEF 年度医学 VQA 挑战系列：2018-2024，多模态影像 + QA 对评测基准

ImageCLEF / CLEF url: https://www.imageclef.org/ 74

医学影像CT医学图像分割挑战赛数据集肿瘤学

KiTS23 — 肾脏肿瘤分割挑战赛数据集（MICCAI 2023）

599 例增强腹部 CT489 训练110 测试kidneytumorcyst 三类体素标注NIfTI .nii.gz 格式期相异构（皮髓质期为主+肾实质期新增）临床元数据随仓库更新599 例 CT 扫描（489 例训练公开标注 + 110 例测试官方持有标注）

599 例双期相 CT 肾脏/肿瘤/囊肿三类分割，Sørensen-Dice + Surface Dice 双指标 rank-then-aggregate 官方排名，MICCAI 2023 挑战赛

明尼苏达大学机器人研究所（MnRI）、Helmholtz Imaging（DKFZ）与克利夫兰诊所联合（M Health Fairview 2010-2022 回顾性队列；通讯作者 Nicholas Heller） url: https://kits23.kits-challenge.org/ 77

医学影像手术视频内窥镜影像医学图像分割

CholecSeg8k — 腹腔镜胆囊切除手术场景分割

8,080 帧视频帧13 类像素级掩码约 3GB PNG854×480 分辨率免费下载17 段手术视频片段（患者数未随数据集公开）

8,080 帧像素级标注的腹腔镜胆囊切除术语义分割数据集

台湾大学 CholecSeg8k 作者团队（底层数据：法国 CAMMA 组 Cholec80） url: https://www.kaggle.com/datasets/newslab/cholecseg8k 73

电子健康记录公共卫生与流行病学儿科脑影像队列研究

ABCD — 青少年脑发育纵向队列

约 100 TB 多模态11,878 名儿童21 个采集点随访至成年需 NDADAC 申请1.2 万名儿童（11,878 基线）

迄今最大青少年脑发育多模态纵向队列 · 11,878 名 · 随访至成年

Adolescent Brain Cognitive Development Consortium / NIMH Data Archive url: https://nda.nih.gov/abcd 75

生理信号电子健康记录时序数据重症监护

SICdb — 欧洲分钟级重症监护数据库

约 10GB 压缩分钟级解压约 240GB27,386 次 ICU 入院分钟级床旁信号GDPR 合规需 CITI 培训 + 逐案审批2.16 万名患者

全球粒度最高的公开 ICU 数据集之一 · 2.7 万次入院 · 分钟级信号

帕拉塞尔苏斯医科大学萨尔茨堡分校 & 萨尔茨堡大学医院（SALK） url: https://physionet.org/content/sicdb/ 92

电子健康记录临床电子病历重症监护COVID-19

VIRUS 注册库 — 全球 COVID-19 ICU 登记

6 万+ 住院重症病例去标识 ICU 数据申请获批后获取6 万+ 例（官方 65,000+ 成人及儿科住院，截至 2021 口径；2023 播客报告约 88,000 例）

SCCM 全球前瞻 ICU 注册 · 6 万+ 重症病例 · 多国站点

Society of Critical Care Medicine (SCCM) Discovery Network url: https://sccm.org/research/discovery-research-network/discovery-research-collaboratives/virus-covid-19-registry 69

电子健康记录公共卫生与流行病学医保理赔医疗登记卫生服务研究真实世界数据

SEER-Medicare — 美国老年癌症登记-理赔链接数据库

SAS 传输格式分发SEER 17/22 三个数据库变体1999-2022 诊断与理赔窗口DUA 申请审核获取仅限美国境内使用65 岁及以上癌症确诊人群（SEER 22 登记区覆盖 47.9% 美国人口，2020 Census）

覆盖 47.9% 美国人口的 65+ 岁癌症登记 × 30 余年 Medicare 理赔证据库

美国国家癌症研究所（NCI）医疗保健交付研究项目 url: https://healthservices.cancer.gov/seermedicare/ 71

生理信号可穿戴传感时序数据步态与运动神经退行性疾病

GaitND — 神经退行性疾病步态动力学数据库

17.9 MB ZIP64 例受试者约 15,092 个步态样本300 Hz 采样13 列衍生指标ODC-BY 1.0 免费开放64 名受试者（帕金森病 15/亨廷顿病 20/ALS 13/健康对照 16）

64 例 PD/HD/ALS 与健康对照的鞋内传感步态节奏时序库

PhysioNet（Beth Israel Deaconess Medical Center / Tel Aviv Sourasky Medical Center） url: https://physionet.org/content/gaitndd/ 64

医学影像病理图像医学图像分割结直肠癌

CoNSeP — 结直肠癌核实例分割基准

41 张 40× H&E 瓦片24,319 个核实例标注16 例患者 WSIZIP 约 146MB开放直接下载16 名结直肠腺癌患者

41 张 40× H&E 结直肠腺癌瓦片 · 24,319 个 7 类核实例标注

University of Warwick（Tissue Image Analytics 实验室） url: https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/data/hovernet/ 72

定制数据集服务

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