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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 262 个数据集

公共卫生与脑神经脑影像影像遗传学多中心联盟荟萃分析

ENIGMA — 国际多中心脑影像遗传联盟 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

50 个活跃工作组43 国 200+ 机构GWAS 汇总 51,665 人26 种脑疾病协议公开共享汇总统计申请获取代表性 GWAS 汇总 30,717-51,665 名受试者

50 个工作组、43 国 200+ 机构的分布式脑影像遗传荟萃分析联盟

ENIGMA Consortium（USC Stevens 神经影像与信息学研究所） url: http://enigma.ini.usc.edu/ 2

药物发现药物警戒药物相互作用真实世界证据图学习基准

TWOSIDES — 药物相互作用副作用权威数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

4,651,131 药物对-副作用关联63,473 个药物组合645 种药物1,301 种 MedDRA 副作用CSV 开放下载不适用（FAERS 自发报告聚合数据；覆盖 645 种药物）

645 药物 × 63,473 药物对，465 万药物对-副作用关联

Tatonetti Lab（斯坦福大学，后哥伦比亚大学，现 Cedars-Sinai） url: http://tatonettilab.org/resources/tatonetti-stm.html 2

外科手术手术视频白内障计算机视觉手术工作流分析

CATARACTS — 白内障手术视频基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

50 台白内障手术117.8 GB Full HD 视频21 类器械逐帧标注18+1 类手术阶段标注免费开放获取50 名白内障患者（38 女 / 12 男，平均 61 岁）

50 台白内障手术、9 小时 Full HD 显微镜视频、21 类器械与 18 类手术阶段逐帧标注

布雷斯特大学医院（CHU de Brest）× LaTIM / Inserm UMR 1101 url: https://ieee-dataport.org/open-access/cataracts 2

生理信号可穿戴设备帕金森病时序分类康复监测

Daphnet FoG — 帕金森冻结步态检测 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

20.5 MB 压缩包（UCI 直接下载）10 例患者 17 段录音237 次 FoG 事件标注8 小时 20 分连续记录9 通道 64 Hz 加速度10 例帕金森病患者（其中 8 例出现冻结步态）

10 例患者、237 次冻结事件、8 小时 20 分 9 通道可穿戴加速度金标注基准

UCI Machine Learning Repository（采集方：特拉维夫 Sourasky 医学中心与 ETH Zurich） url: https://archive.ics.uci.edu/dataset/245/daphnet+freezing+of+gait 1

皮肤眼科与骨骼专科影像眼科影像血管分割医学影像开放数据集

CHASE_DB1 — 儿童视网膜血管分割基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

28 幅儿童眼底图像56 幅人工血管掩膜999×960 JPGPNG约 2.4 MB ZIPCC BY 4.0 开放获取14 名儿童（双眼 28 幅图像）

28 幅儿童眼底图像 × 双观察者标注的视网膜血管分割参考基准

Kingston University London 与 St George's, University of London url: https://researchinnovation.kingston.ac.uk/en/datasets/chasedb1-retinal-vessel-reference-dataset-4 2

["医疗 NLP 与多模态""医学影像""视觉问答""知识图谱"]

SLAKE — 中英双语医学 VQA 基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

["642 幅放射影像""中英双语 QA（清洗版 5,980 条）""5,232 条知识三元组""约 217 MB JSON图像打包""CC-BY-4.0 免费下载"]不适用（影像级开放数据，未提供独立患者人口学信息）

642 幅放射影像、中英双语问答与 5,232 条知识图谱三元组的医生标注 Med-VQA 基准

name: "香港理工大学（med-vqa.com / HuggingFace BoKelvin/SLAKE）" url: "https://www.med-vqa.com/slake/" 2

基因组学多组学转录调控功能基因组

FANTOM5 — 哺乳动物转录调控元件图谱 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

2,832 个 CAGE 样本201,802 个人类 CAGE 峰65,423 个增强子CC BY 4.0 开放获取核心表达表 4.1 GB2,832 个样本（1,816 人 + 1,016 小鼠，phase 1+2）

975 人类样本启动子图谱 + 43,011 增强子，CAGE 单碱基分辨率转录调控参考

FANTOM Consortium / RIKEN Center for Integrative Medical Sciences url: https://fantom.gsc.riken.jp/5/ 2

肿瘤学病理组织与全切片乳腺癌计算病理学细胞核实例分割

NuCLS — 乳腺癌病理核分类数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

222,396 条核标注125 张 TCGA H&E WSI13/7/4 三级核分类CC0 1.0 开放获取官方五折划分125 名患者（每人 1 张 TCGA H&E 全切片）

TCGA 222,396 条核标注 · 三级分类 · CC0 开放

Northwestern University Department of Pathology（NuCLS 研究团队） url: https://sites.google.com/view/nucls/home 2

放射科影像与断层扫描肺癌影像组学生存预测公开数据集

NSCLC-Radiomics — 肺癌影像组学队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

422 名患者52,073 张 CT 切片35.78 GB DICOM7 项临床字段CC BY-NC 3.0 开放下载422 名 NSCLC 患者

422 例 NSCLC 患者的 CT 影像组学与生存随访金标准队列

MAASTRO Clinic / The Cancer Imaging Archive (TCIA) url: https://www.cancerimagingarchive.net/collection/nsclc-radiomics/ 1

临床电子病历重症监护 EHR & ICU多中心登记队列流行病学

CUB-Réa — 法国大巴黎 ICU 多中心登记队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 475,357 次 ICU 入院35-40 家大巴黎 ICU1993 年起前瞻采集申请审核获取累计 47.5 万+ 次 ICU 入院（1997-2016 公开研究口径）

累计 47.5 万+ 次 ICU 入院的大巴黎多中心重症监护登记库

CUB-Réa Network（SRLF 发起，AP-HP 资助） url: https://doi.org/10.1164/rccm.2201087 2

公共卫生队列研究脑神经儿童青少年精神健康神经影像

HBN — 儿童青少年脑与精神健康跨诊断队列 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 4,867 名受试者多模态 MRIEEG表型BIDS 格式CC BY-NC-SA 与 CC BY-SA 双许可DUA 申请获取约 4,867 名 5-21 岁受试者（Release 11，数据截至 2022-11）

5-21 岁约 4,867 名受试者的跨诊断儿童脑与精神健康开放生物样本库

Child Mind Institute（美国儿童心理研究所） url: https://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/cmi_healthy_brain_network/ 1

药物发现化学信息学激酶抑制剂结合亲和力机器学习基准

KIBA — 激酶抑制剂结合亲和力基准数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

246,088 个 KIBA scores52,498 个化合物467 个激酶靶点基准版 118,254 对相互作用29.8 MB ZIP开放免费下载不适用（化合物-靶标对数据：基准版 118,254 对相互作用）

52,498 化合物 × 467 激酶、246,088 个整合亲和力分数的开放药物发现基准

University of Helsinki — Institute for Molecular Medicine Finland (FIMM) url: https://zenodo.org/records/5105698 1

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