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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1346 个数据集

医学影像眼科影像医学图像分割糖尿病视网膜病变

OCTA-500 — 全球最大公开 OCTA 视网膜血管数据集

约 36 GB 压缩包500 只眼 OCTOCTA 配对体数据7 类像素级分割标注IEEE DataPort 开放获取500 名受试者（500 只眼）

500 只眼 OCT/OCTA 配对三维体数据，2 种视野 + 11 类标注

南京理工大学计算机科学与工程学院 & 南京医科大学第一附属医院眼科（IEEE DataPort 托管） url: https://ieee-dataport.org/open-access/octa-500 102

医学影像内窥镜影像图像分类

GastroVision — 胃肠道内镜多类影像分类

约 1.8GB JPG 图像8,000 张 27 类上下消化道内镜免费开放获取CC BY 4.08,000 张内镜图像（非患者级数据）

8,000 张上下消化道内镜图像 · 27 类 · 多中心开放访问

OSF GastroVision Project url: https://osf.io/84e7f/ 76

药物发现与化学分子对接药物-靶点相互作用虚拟筛选

BindingDB — 蛋白质-配体结合亲和力数据库

约 324 万条结合数据约 143 万化合物约 1.15 万蛋白质靶点TSVSDFMySQLCC BY 4.0蛋白质-配体结合数据，非患者数据集

320万结合数据 · 143万化合物 · 1.15万靶点 · 美国专利策展唯一来源 · 25年持续运营

UC San Diego — Skaggs School of Pharmacy & Pharmaceutical Sciences url: https://bindingdb.org 149

生理信号语音信号心血管疾病

HLS-CMDS — 临床模拟人心肺音数据集

约 38 MB535 条录音CC BY 4.0 开放许可免费直接下载配对 Ground Truth535 条录音

McMaster University, Mohawk IAHS url: https://data.mendeley.com/datasets/8972jxbpmp 125

生理信号医学问答与基准神经退行性疾病评测基准语音信号帕金森病

Parkinson's Voice (UCI) — 嗓音生物标志物

195 条录音31 名受试者22 个声学特征297 KB CSV开放下载31 名受试者（23 例帕金森病）

31 人 195 条持续元音录音、22 维嗓音声学特征，帕金森检测经典基准

UCI Machine Learning Repository（牛津大学 Max Little 捐赠） url: https://archive.ics.uci.edu/dataset/174/parkinsons 71

公共卫生与流行病学全球健康公共卫生统计卫生服务研究时序数据

WHO 全球卫生观察 — 全球 194 国卫生指标开放数据库

1,000+ 指标194 个成员国1950 年代起时间序列CSVXLSXJSONXMLCC BY-NC-SA 3.0 IGO免 key OData API194 个成员国的国家-年-分层观测面板（无个体患者数据）

1,000+ 指标 × 194 国的 WHO 旗舰开放卫生统计库

World Health Organization (WHO) url: https://www.who.int/data/gho 85

医学影像多模态皮肤影像

Derm7pt — 皮肤镜七点检查法数据集

2,045 张图像1,011 例病例皮肤镜+临床双模态七点检查标注官方固定划分CC BY-NC-ND 4.01,011 例皮损病例

首个皮肤镜+临床双模态七点检查标注数据集 · 1,011 例病例

Simon Fraser University & 坎帕尼亚大学（那不勒斯）皮肤科 url: http://derm.cs.sfu.ca 136

基因组学与多组学转录组测序数据

GENCODE — 人类与小鼠参考基因注释

78,733 个人类基因（v50）644,292 条人类转录本GTFGFF3 + FASTA开放无限制下载每年最多 4 次更新不适用（参考基因组注释，非患者队列）

78,733 个人类基因、644,292 条转录本的参考注释（v50，截至 2026-09）

EMBL-EBI（GENCODE 项目，NIH/NHGRI U41HG007234 资助） url: https://www.gencodegenes.org 272

基因组学与多组学代谢组学转录组

Metabolomics Workbench — 代谢组 NIH 国家存储库

4,570 项公开研究6,125 个分析（2025-10 口径）164,000+ 化合物结构mwTabJSONmzML 格式免费开放获取官方未披露全库累计样本数（5,106 项研究，覆盖人、动物、植物与微生物）

NIH 资助：4,570 项公开代谢组研究与 RefMet 标准命名中枢

UCSD San Diego Supercomputer Center（NIH Common Fund NMDR） url: https://www.metabolomicsworkbench.org/ 106

基因组学与多组学公共卫生与流行病学队列研究

China Kadoorie Biobank — 中国慢性病队列

512,891 名参与者10 地区（5 城 5 乡）随访近 20 年10 万人基因分型申请审核获取中国大陆香港学术免费51.2 万名参与者

全球最大中国人群前瞻队列 · 51.2 万参与者 · 随访近 20 年

牛津大学人口健康系 & 北京大学公共卫生学院 & 中国医学科学院 url: https://www.ckbiobank.org/ 148

电子健康记录医疗NLP医疗登记真实世界数据

AACT — 临床试验注册结构化聚合数据库

601,524 项注册研究2.37 GB PostgreSQL 快照52 张关系表每日增量更新免费注册开放获取601,524 项注册研究（截至 2026-09-03，以研究为单位，非个体患者队列）

60 万+ 项临床试验注册与结局数据的 PostgreSQL 结构化镜像

Clinical Trials Transformation Initiative (CTTI) url: https://aact.ctti-clinicaltrials.org/ 115

医学影像眼科影像医学图像分割

IDRiD — 像素级病灶标注眼底数据集

516 张眼底彩照81 张像素级病灶掩码4288×2848 JPGCC BY 4.0 开放获取2009-2017 采集516 张图像（自数千次检查精选，患者级人数未公开）

516 张眼底彩照，像素级 DR 病灶分割与分级标注

IEEE DataPort（SGGS IE&T Nanded 等） url: https://ieee-dataport.org/open-access/indian-diabetic-retinopathy-image-dataset-idrid 108

定制数据集服务

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