即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

千方医数集致力于为医疗 AI 研究人员找到合适的数据集，让你的 AI 感知模型能够更快地学习、更准确地运行，并无缝适应现实世界的环境。

医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1346 个数据集

神经科学公共卫生与流行病学脑影像队列研究

AOMIC — 阿姆斯特丹开放 MRI 集合

约 408GB BIDS NIfTI1,370 名健康被试CC0 开放获取7 类 fMRI 任务fmriprep 预处理衍生1,370 名健康志愿者

三队列 1,370 名健康被试的多模态 3T MRI 开放集合

University of Amsterdam (阿姆斯特丹大学) url: https://nilab-uva.github.io/AOMIC.github.io 97

基因组学与多组学GWAS测序数据转录组

GTEx — 人类组织基因表达调控图谱

约 1.74 万 RNA-seq 样本（V8）948 名供体 · 54 种组织WGS 中位 32×汇总数据开放免注册基因型需 dbGaP 申请948 名供体 · 1.74 万组织样本

全球最大健康人多组织表达与 eQTL 参考图谱 · 948 供体 · 54 组织

NIH Common Fund GTEx 项目（Broad Institute LDACC） url: https://gtexportal.org/home/ 106

医学影像MRI乳腺癌肿瘤学

Duke 乳腺MRI — 922 例 DCE-MRI 数据集

922 名患者368.89 GB DICOM529 个影像组学特征近 100 列临床表格CC BY-NC 4.0免费下载922 名患者

922 例活检确诊乳腺癌的术前 DCE-MRI 多维标注研究数据集

Duke University (Mazurowski Lab) / The Cancer Imaging Archive (TCIA) url: https://doi.org/10.7937/TCIA.e3sv-re93 99

医疗NLP药物发现与化学化学信息学知识图谱肿瘤学

DGIdb — 药物-基因互作库

10,000+ 成药基因20,000+ 药物70,000+ 药物-基因互作40+ 数据来源GraphQL API + TSVSQL免费开放获取不适用（知识库型数据集，无患者数据；覆盖 10,000+ 基因、20,000+ 药物、70,000+ 互作）

10,000+ 基因、20,000+ 药物、70,000+ 互作的可计算成药基因组知识库

Washington University in St. Louis（Griffith Lab）& Nationwide Children's Hospital & The Ohio State University url: https://dgidb.org/ 71

基因组学与多组学医疗NLP化学信息学知识图谱

Reactome — 人工审编生物通路知识库

16,423 条人类反应2,883 条人类通路GMTCSVBioPAXSBML 多格式CC0 与 CC BY 4.0 双许可季度版本发布不适用（通路知识库，无患者数据）

16,423 条人类反应的开放审编通路知识库，季度更新、CC0/CC BY 4.0 双许可

EMBL-EBI / Ontario Institute for Cancer Research (OICR) 等联合维护 url: https://reactome.org/ 67

医疗NLP生物医学文献知识图谱

S2ORC — 学术论文开放语料库

约 1.36 亿篇论文元数据约 1,200 万篇开放获取全文gzipped JSON 分片ODC-By 1.0 开放许可免费 API key 申请不适用（学术论文语料，非患者数据）

1.36 亿篇论文元数据与约 1,200 万篇开放获取全文的机器可读学术语料

Allen Institute for AI（Semantic Scholar） url: https://allenai.org/data/s2orc 73

医学影像病理图像肿瘤学

SICAPv2 — 前列腺癌病理图像分级数据集

182 张 H&E 活检 WSI95 名患者18,783 个 512×512 patch10,340 个分级 patch763 个筛状标注 patch2.03 GB 免费下载95 名患者（155 张穿刺活检）

182 张 H&E 前列腺穿刺活检 WSI，活检级+像素级 Gleason 双标注

瓦伦西亚理工大学（Universitat Politècnica de València）· Mendeley Data url: https://data.mendeley.com/datasets/9xxm58dvs3 82

医学影像CTX光影像肺癌

JSRT — 胸部X光肺结节检测经典基准

247 张 PA 胸片2048×2048 像素 12-bit约 2.1 GB 原始数据免费学术使用247 例检查（每例 1 张 PA 胸片）

247 张 PA 胸片、12-bit 高灰阶、五档难度的经典肺结节检测公开基准

Japanese Society of Radiological Technology（日本放射技术学会） url: http://db.jsrt.or.jp/eng.php 58

基因组学与多组学医学影像病理图像肿瘤学

ICGC — 国际癌症基因组联盟数据门户

24,289 名供体（Release 28）8,178 万个体细胞突变PCAWG 2,658 全基因组开放+受控分级访问开放数据免认证受控数据需 DACO 审核2.6 万+名供体

全球最大泛癌体细胞突变目录之一 · 2.4 万供体 · PCAWG 2,658 全基因组

国际癌症基因组联盟（ICGC）/ 安大略癌症研究所（OICR） url: https://www.icgc-argo.org/ 84

医学影像医学问答与基准CT医学图像分割挑战赛数据集肿瘤学

62.5 万条 SNP-性状权威关联，8.5 万个全基因组汇总统计数据集

NHGRI & EMBL-EBI url: https://www.ebi.ac.uk/gwas/ 56

定制数据集服务

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