即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

按任务类型浏览

图像分类目标检测语义分割

共 1346 个数据集

内窥镜影像手术视频时序数据

Cholec80 — 腹腔镜胆囊切除术视频数据集

80 例手术视频7 阶段 + 7 器械标注非商业许可需申请获取80 例手术

CAMMA Research Group, University of Strasbourg url: https://camma.unistra.fr/datasets/ 159

药物发现与化学公共卫生与流行病学

MedDRA 监管活动医学词典

27,361 PT91,082 LLT27 个 SOC230 个 SMQ双年发布不适用（术语标准资源；无患者数据）

27,361 首选术语 · 91,082 低层级术语 · 27 个系统器官分类：全球药物警戒的通用语言

https://www.meddra.org 58

医学影像生理信号手术视频内窥镜影像步态与运动肿瘤学

SARAS-ESAD — 内窥镜术者动作检测

53,370 帧手术视频帧46,325 个动作实例21 个动作类别约 13 GB JPG+TXTCC BY-NC-SA 免费下载4 台真实 RARP 手术（前列腺癌患者，获录制与分发同意）

4 台真实 RARP 手术 53,370 帧内窥镜动作检测标注

SARAS 项目（牛津布鲁克斯大学视觉人工智能实验室等） url: https://saras-esad.grand-challenge.org 50

药物发现与化学虚拟筛选肿瘤学

NCI-ALMANAC — 抗癌药联用筛选数据库

104 种 FDA 抗癌药5,232 个药物对60 个 NCI-60 细胞系2,809,671 个剂量组合观测免费公开下载不适用（体外细胞系数据，无人类受试者）

104 种 FDA 抗癌药 × 5,232 药物对 × NCI-60，281 万剂量组合点

美国国家癌症研究所（NCI）Developmental Therapeutics Program（DTP） url: https://dtp.cancer.gov/ncialmanac 62

电子健康记录重症监护时序数据

MIMIC-IV-ED — 急诊科临床数据库

约 0.5GB CSV42.5 万次急诊就诊2011-2019 年数据星型 6 表结构需 CITI 培训Demo 免认证21 万名患者

全球最大公开急诊科 EHR 数据库 · 42.5 万就诊 · MIMIC-IV 官方急诊模块

MIT 计算生理学实验室 & 贝斯以色列女执事医疗中心 url: https://physionet.org/content/mimic-iv-ed/ 119

基因组学与多组学测序数据微生物组队列研究

American Gut Project — 全球最大公民科学微生物组参考库

15,096 个微生物组样本11,336 名参与者16S V4 测序 + 问卷元数据开放获取11,336 名参与者（15,096 个样本，截至 2017-05）

11,336 名公民科学家贡献 15,096 个 16S 样本的开放人类微生物组参考库

UC San Diego Knight Lab / The Microsetta Initiative url: https://microsetta.ucsd.edu/ 52

医疗NLP药物发现与化学知识图谱代谢组学化学信息学

ChEBI — 生物医学化学实体本体

201,471 条实体（release 244）61,961 条全人工整理>439,000 条跨库交叉引用OWLOBOSDFSQL 开放下载CC BY 4.0 免费获取不适用（化学实体本体，非患者数据）

超 20 万条目手工整理化学实体本体，小分子 AI 研究的语义底座

EMBL-EBI（欧洲生物信息学研究所） url: https://www.ebi.ac.uk/chebi/ 69

药物发现与化学药物-靶点相互作用化学信息学

DrugBank 药物知识库

11,891 药物141 万 DDI4,939 靶点序列MSNMR 光谱学术许可免费不适用（药物知识库；无患者数据）

11,891 药物 · 141 万 DDI · 4,939 靶点序列：成药知识的黄金标准库

https://go.drugbank.com/ 77

基因组学与多组学蛋白质组学变异与注释肿瘤学

VDJdb — TCR 抗原特异性策展库

约 30 MB TSV13 万+ 条记录CC BY-NC 4.0免费开放下载不适用（分子序列级策展库，非患者队列）

10 万+ TCR-表位配对，4 级置信度评分

Institute of Bioorganic Chemistry, Russian Academy of Sciences / Pirogov Russian National Research Medical University url: https://vdjdb.cdr3.net/ 57

电子健康记录神经科学脑影像队列研究阿尔茨海默病

ADNI — 阿尔茨海默病纵向多模态队列

2,500+ 参与者20+ 年随访MRI + PET + CSF + 基因免费申请获取2,500+ 名参与者

全球最大AD纵向多模态队列 · 2,500+参与者

Alzheimer''''s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI, PI: Michael W. Weiner, M.D.) url: https://adni.loni.usc.edu/ 108

基因组学与多组学微生物组测序数据

MGnify — 微生物组分析平台

近 50 万次分析301,808 个基因组REST API + FTP蛋白库 CC0 1.0不适用（样本级平台，非患者级队列）

EMBL-EBI 宏基因组分析平台 · 近 50 万次分析 · 301,808 个基因组

EMBL-EBI（欧洲分子生物学实验室-欧洲生物信息学研究所） url: https://www.ebi.ac.uk/metagenomics/ 36

药物发现与化学化学信息学知识图谱肿瘤学

TTD — 治疗靶点数据库

3,798 个治疗靶点40,398 种药物306,247 条靶点-疾病关联44,649 份 FDA 说明书免注册直接下载3,798 个治疗靶点（疾病关联覆盖 2,912 个靶点）

3,798 个治疗靶点 × 40,398 种药物的药物-靶点-疾病关联知识库

浙江大学药学院 IDRB 组 × 新加坡国立大学 BIDD 组（Innovative Drug Research and Bioinformatics Group / Bioinformatics and Drug Design Group） url: https://idrblab.org/ttd/ 52

定制数据集服务

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