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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 277 个数据集

医疗 NLP 与多模态医学视觉问答 MedVQAPubMed Central 图文

PMC-VQA — 医学视觉问答大基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

227k 问答对149k 图像约 21GB CSV+JPEG开放下载 CC BY-SA复合图版本抉择MedVInT 生成式基准149k 幅生物医学图像 / 227k 个问答对

227k 问答对 / 149k 图的生物医学图文视觉问答数据集

上海交通大学 & 上海人工智能实验室 url: https://github.com/xiaoman-zhang/PMC-VQA 1

基因组学多组学儿科肿瘤NCIGDCAI-Ready 数据集

TARGET — 儿童肿瘤基因组项目 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 6,363 名知情受试者WGSWESRNA-seqmiRNA-seq受控+开放获取dbGaP 申请肿瘤-正常配对约 6,363 名知情同意受试者（dbGaP v26）

NCI 儿科癌症多组学队列，约 6,000+ 例 WES/WGS/RNA-seq

National Cancer Institute — Center for Cancer Genomics url: https://www.cancer.gov/ccg/research/genome-sequencing/target 2

组织病理乳腺癌图像回归医学影像挑战赛

BreastPathQ — 乳腺癌细胞增殖定量挑战 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

3,698 patch96 WSI55 名 NAT 后患者H&E 20X 扫描0-1 连续 TC 标签需申请下载55 名乳腺癌新辅助治疗后患者（NAT 后残余病变）

新辅助治疗后乳腺癌 H&E patch 肿瘤细胞占比回归 · 3,698 patch · 55 患者

SPIE BreastPathQ Grand Challenge（官方组织方） url: https://breastpathq.grand-challenge.org/ 2

放射科影像CT肺癌重复扫描TCIA

RIDER Lung CT — 重复扫描肺癌 CT 数据 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

32 例 NSCLC 重复扫描43.01GB DICOM六重建设置CC BY 4.0免费下载32 例患者

32 例 NSCLC 同日双 CT 重复扫描，六重建设置，影像组学可重复性金标准

Memorial Sloan Kettering Cancer Center（经由 The Cancer Imaging Archive） url: https://www.cancerimagingarchive.net/?p=43451 2

临床电子病历初级保健 EHR流行病学队列风险预测处方药物流行病学

QResearch — 英国初级保健研究数据库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 3,500 万累计患者1,500+ EMIS 诊所申请审核制可链接 HESONS 死亡记录回溯至 1989约 3,500 万累计患者（部分表述 4,000 万）

英国最大 EMIS 初级保健 EHR · 3,500 万+患者 · QRISK/QCovid 发源地

QResearch（University of Oxford & EMIS Health） url: https://www.qresearch.org/ 2

脑神经公共卫生神经科学参考图谱单细胞基因组学

BICCN — 哺乳动物脑细胞普查多模态图谱 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

数百万细胞 · 多模态跨小鼠狨猴人类运动皮层CC BY 4.0 开放NeMOBILDANDI 档案biccn.org 门户浏览运动皮层细胞普查图谱（细胞级数据，非患者队列）：小鼠/狨猴/人类供体数百万细胞

NIH BRAIN 计划跨物种运动皮层细胞普查图谱 · 数百万细胞 · 多模态

BRAIN Initiative Cell Census Network (BICCN) / BRAIN Cell Data Center (BCDC), Allen Institute url: https://www.biccn.org 2

药物警戒自发不良事件报告上市后安全监测真实世界证据

FAERS — 全球最大自发药物警戒库 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

FDA 公开免费下载季度非累计 ASCIIXMLMedDRA 编码七表 PRIMARYID 关联含重复报告需去重去标识化公开数千万条报告（含重复，FDA 仪表盘 2026-03 约 3,282 万条）

FDA 不良事件自发报告系统 · 累计报告 3,000 万+ · 公开免费

U.S. Food and Drug Administration (FDA) url: https://fis.fda.gov/extensions/FPD-QDE-FAERS/FPD-QDE-FAERS.html 3

眼科外科手术视频医学多媒体手术阶段识别显微影像

Cataract-101 — 白内障手术视频阶段数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方医数集

101 台手术视频10 阶段标注约 8.3 GB 压缩包CC BY-NC 4.0 免费下载720×540 显微视频101 台白内障手术（去标识视频）

101 台手术显微视频 · 10 阶段标注 · 4 名外科医生双经验级

Multimedia Systems Group, Institute of Information Technology (ITEC), Alpen-Adria-Universität Klagenfurt url: https://ftp.itec.aau.at/datasets/ovid/cat-101 2

生理信号与音频睡眠医学多导睡眠图时序信号基准

ISRUC-Sleep — 睡眠分期多导睡眠图基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

118 名受试者126 份整夜 PSG约 17.7 GB 下载包双专家 AASM 分期200 Hz 采样免费公开获取118 名受试者（126 份整夜 PSG 记录）

118 例受试者、126 份整夜 PSG 与双专家 AASM 分期基准

葡萄牙科英布拉大学系统与机器人研究所（ISR-UC） url: http://sleeptight.isr.uc.pt/ 2

皮肤眼科与骨骼专科影像眼底血管分割分割基准数据集眼科 AI

HRF — 45 幅高分辨率眼底血管分割基准 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

45 幅 3504×2336 眼底照健康DR青光眼各 15 幅单套专家共识血管金标准双专家视盘定位标注约 73 MB 开放直链下载45 幅眼底图像（健康、DR、青光眼各 15 幅；每幅独立病例）

45 幅 3504×2336 眼底照，健康/DR/青光眼三分组血管分割基准

Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU), Pattern Recognition Lab url: https://www5.cs.fau.de/research/data/fundus-images/ 2

医疗 NLP 与多模态病理图像视觉问答医学 AI 基准

PathVQA — 病理视觉问答基准数据集 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

4,998 张病理图像32,799 条问答对约 785 MB ParquetMIT 许证开放下载不适用（图像源自出版教科书与 PEIR 公共数字图书馆，不含患者信息）

4,998 张病理图像、32,799 条问答对的病理 VQA 开放基准

UCSD-AI4H（加州大学圣地亚哥分校 / 卡内基梅隆大学 / 北京工业大学） url: https://github.com/UCSD-AI4H/PathVQA 2

基因组学与多组学蛋白质组学肿瘤学泛癌分析

CPTAC — 癌症蛋白质基因组多组学 AI-Ready Wikipedia | 千方病案医数集

约 70 TB（PDC 全库）10 癌种 1,073 例肿瘤6,644 名受试者开放+受控申请获取6,644 名受试者（dbGaP CPTAC-3 v17）

10 大癌种 1,073 例肿瘤的蛋白组×基因组×影像配对多组学公共数据

美国国家癌症研究所（NCI）CPTAC 联盟 / 蛋白质组数据共享平台 PDC url: https://pdc.cancer.gov 3

定制数据集服务

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