医疗 AI-Ready 训练数据集库（上万即取即用）

致力于为医疗 AI 研究人员找到合适的数据集。已收录 2,151 个 AI-Ready 数据集，覆盖医学影像、电子病历与文本、病灶分割与标注等多模态数据。

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千方医数集 · 商业级 AI-Ready 数据集

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乳腺钼靶影像与病灶标注数据集

四体位乳腺钼靶 DICOM 影像，配病灶检出框与像素级分割掩膜，标签按 BI-RADS 术语组织。

眼底照相与 OCT 影像数据集

眼底彩照与 OCT 报告图文配对，一眼一报告可回溯，含逐项所见与 AI 辅诊结论。

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1886 个数据集

医学影像病理图像转录组肿瘤学

HEST-1k — 病理×空间转录组配对库

1,229 个 ST 样本配对 WSI210 万表达-形态对超 7,640 万细胞核全量超 1 TBH5ADTIFFH5Parquet1,229 个空间转录组样本（153 个独立队列，26 个器官）

1,229 个 ST 样本与 H&E 全切片一一配对，210 万表达-形态对覆盖 153 队列

Mahmood Lab（哈佛医学院 / Mass General Brigham） url: https://huggingface.co/datasets/MahmoodLab/hest 77

医学影像CTMRI医学图像分割挑战赛数据集脑影像

TopCoW Challenge — 面向 CT 与 MR 血管造影的 Willis 环拓扑感知分割

CTAMRA血管分割多类分割拓扑指标像素级标注配对影像226

TopCoW Challenge：Willis 环多类血管分割与拓扑感知评测数据集（CTA + MRA）

TopCoW Challenge (https://topcow23.grand-challenge.org/ ; https://topcow24.grand-challenge.org/) + Zenodo 存档 15692630 / 15665435 + arXiv:2312.17670 74

医疗NLP语音信号临床文本电子健康记录评测基准

PriMock57 — 模拟基层问诊多模态语料

语音数据文本数据人工标注57 名扮演患者（actor）；7 名临床医生；5 名评估 GP。全部为模拟问诊，无真实患者参与。

57 场模拟基层医疗问诊的公开多模态数据集——8 小时 38 分双声道音频、人工逐句转写与临床 SOAP 记录三件套，附 5 名全科医生的人类评估标注与 18 项自动指标相关性研究，成为会话式医疗 ASR 与问诊记录生成两大任务的通用基准

Babylon Health + University of Aberdeen 采集的 57 场模拟基层医疗问诊（5 天 / 7 名临床医生 / 57 名员工扮演患者），包含：双声道 WAV 音频（16bit/16kHz，医生与患者分轨）、Praat TextGrid 人工逐句转写、57 份 JSON 格式 SOAP 问诊记录、病例卡与咨询核对清单、以及 5 名全科医生的人类评估标注（后期编辑 / 错误陈述 / 遗漏）与 18 项自动指标分数。 69

眼科影像多模态影像图像分类青光眼糖尿病视网膜病变

Harvard-FairVision — 首个 2D+3D 眼科公平性大规模数据集

30,000 名受试者SLO 眼底 + OCT B-scan 双模态约 600 GBCC BY-NC-ND 4.0,6 个身份属性30,000 名受试者

30,000 名受试者的 SLO 眼底 + OCT 双模态影像与六维人口学属性的公平性研究平台

Harvard Ophthalmology AI Lab, Department of Ophthalmology, Harvard Medical School url: https://huggingface.co/datasets/harvardairobotics/FairVision 59

医学影像乳腺影像X光影像图像分类医学图像分割评测基准

Breast Cancer Digital Repository — 葡萄牙波尔图乳腺 X 光多源病案影像库

病灶级标注多边形分割掩码BI-RADS 分类临床电子病历多设备异构灰度 TIFF 影像1010

BCDR：胶片与全视野数字乳腺摄影双子库、BI-RADS 病灶分割与临床史三合一的老牌 CADx 基准

Breast Cancer Digital Repository (BCDR) — CETA-CIEMAT / INEGI / FMUP-HSJ 共建，IMED 项目与 ALOE 平台支持 url: https://www.qianfanghub.com/ai-ready-dataset/bcdr 61

医学影像内窥镜影像手术视频图像分类目标检测评测基准

Galar — 大规模多标签视频胶囊内镜数据集

人工标注影像数据原始数据多标签标注80 段 VCE 视频（自 449 段记录中预选，仅含病理发现者；患者级计数论文未披露）

德国德累斯顿 80 段视频胶囊内镜、351 万逐帧标注帧、29 类技术/解剖/病理标签——跨两中心三型胶囊系统、5 名标注员交叉验证，迄今规模最全面的 VCE 多标签数据集，figshare+ 以 CC BY 4.0 公开约 580GB

德国两中心视频胶囊内镜录像（2011-08 至 2023-03）：Olympus™ Endocapsule 10 System（336×336，22 视频/2,750,514 帧）+ PillCam™ SB2/SB3/Colon2（512×512，58 视频/763,025 帧）；逐帧标注为 29 类技术/解剖/病理标签；7-Zip 压缩发布约 580GB 80

医学影像医学图像分割图像分类评测基准

PFUS1 — 盆底经会阴超声八结构分割数据集

人工标注影像数据原始数据101–110 例（四方口径：Zenodo/GitHub 110｜论文摘要/官方页 111｜Table 1 101｜目录 102 folders）

PFUS1 是塞维利亚大学发布的盆底经会阴超声中矢状面 Valsalva 动作视频数据集：101–110 例患者、8 个盆底解剖结构逐帧分割掩码、Canon Aplio i700 采集、700×500 帧、CVAT 标注，附 FPN+ResNet50 基准（DSI 0.79），CC BY 4.0 于 Zenodo 公开直链。

塞维利亚大学（Universidad de Sevilla）与 Valme 大学医院：盆底经会阴超声中矢状面 Valsalva 动作视频逐帧 PNG 序列 + 8 结构 JSON 分割掩码（CVAT 标注） 58

医学影像图像分类病理图像结核病评测基准

AI-TB-ZN — 乌干达抗酸染色痰涂片结核杆菌图像级二分类数据集

人工标注影像数据原始数据512 张匿名显微图像（256 AFB 阳性 + 256 AFB 阴性）；患者级数量未披露（样本来自常规结核诊断的存档 ZN 染色玻片，回顾性选取）

乌干达西南部 MUST 团队 512 张 Ziehl–Neelsen 抗酸染色痰涂片明场显微图（256 AFB 阳性 + 256 AFB 阴性）——Olympus BX41 ×100 采集、逐图专家图像级标注、CC BY 4.0 于 Zenodo 公开，服务自动化结核检测算法的开发、验证与外部基准

乌干达西南部常规结核诊断来源的存档 Ziehl–Neelsen 抗酸染色痰涂片玻片，经 Olympus BX41 明场显微镜 ×100 放大配合 Infinity Lite 数码相机（部分图像用 Samsung Galaxy A16 手机）采集为匿名 JPEG 图像，配套逐图图像级诊断标签 45

医学影像挑战赛数据集评测基准

TUS-REC2025

影像数据原始数据人工标注85 名志愿者（多种族、多性别、多年龄多样队列），170 段扫描序列（每人左、右前臂各 1 段）；划分 50/3/32 名受试者 = 100/6/64 段（训练/验证/测试）

UCL 主办的 MICCAI 2025 免标记 3D 自由手持超声重建挑战赛数据集——85 名志愿者 170 段前臂超声（约 26 万帧）带光学跟踪金标准位姿，四指标位移向量评估，冠军 ImFusion 0.622，训练数据注册获取且禁商用

Ultrasonix（BK）超声仪 + 4DC7-3/40 凸阵探头采集的 2D 前臂超声帧序列（20 fps，480×640，6 MHz，9 cm 深度）+ NDI Polaris Vicra 光学跟踪器记录的逐帧金标准位姿（4×4 齐次变换矩阵）+ 每段 100 帧解剖标志点坐标 + pinhead 法标定矩阵（calib_matrix.csv） 57

医学影像眼科影像医学图像分割评测基准心血管疾病

ROSSA — OCTA 视网膜血管分割数据集（918 张 / MIT / SAM 半自动标注）

影像数据人工标注原始数据918 张 OCTA 图像（300 张人工标注 + 618 张 SAM 半自动标注；患者级数量未披露）

FRNet 论文随附的 OCTA 视网膜血管分割数据集：918 张 320×320 图像，300 张纯人工 + 618 张 SAM 半自动标注，MIT 许可 GitHub 直链公开，是迄今最大公开 OCTA 血管分割数据集之一

GitHub nhjydywd/OCTA-FRNet 仓库 dataset/ROSSA/ 目录：train_manual 100 张 + train_sam 618 张 + val 100 张 + test 100 张，320×320 像素级血管二值标注，随代码仓库 clone 一并发放 66

生理信号可穿戴传感多模态时序数据真实世界数据糖尿病视网膜病变

D1NAMO — 1 型糖尿病多模态可穿戴数据集

生理信号传感器数据影像数据人工标注原始数据29 人（20 名健康人 + 9 名 1 型糖尿病患者；T1D 亚组 6 男 3 女，年龄 20-79 岁，性别年龄为二手口径）

真实生活条件下 20 名健康人 + 9 名 1 型糖尿病患者的 ECG/呼吸/三轴加速度 + 血糖 + 餐食照片多模态数据集，Zephyr BioHarness 3 胸带采集，Zenodo 公开 10.2 GB，面向无创低血糖检测研究

Zephyr BioHarness 3 胸带（ECG I 导联双电极 250 Hz / 呼吸 EVA 泡沫压力传感器 18 Hz / 三轴加速度 100 Hz ±16 g / 设备自算 HR·BR·activity·posture）+ Bayer Contour XT 血糖仪（健康组每日 6 次指尖血）+ Medtronic iPro2 Professional CGM（T1D 组每 5 分钟）+ 手机餐食照片（瑞士法郎硬币比例尺）+ 营养师逐图饮食标注 53

医学影像X光影像图像分类医疗NLP临床文本评测基准

CRADI — 多中心多机构胸部平片 25 征象弱监督标注数据集

NLP标注影像数据原始数据84,012 例（训练 74,082 + 外部测试 9,930：Hospital-2 有症状 5,996 / 筛查 2,130 / 社区门诊 1,804）

上海两所学术医院与 8 家社区门诊的 84,012 例后前位胸片数据集——BERT 从中文诊断报告抽取 Fleischner 词汇 25 异常征象标签，Inception-v4 训练于 74,082 例并在三个异质队列外部验证，社区门诊 6 个征象反超本地放射科医师，测试集 Zenodo 公开、训练集申请制

上海市第六人民医院回顾性连续胸片（2014.02-2018.02）+ 上海市第一人民医院门诊/住院与筛查胸片 + 8 家社区门诊胸片；DCM 转 PNG 8-bit 去标识 + BERT NLP 25 征象标签 CSV 38

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