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乳腺阳性影像数据集

乳腺钼靶阳性病例影像数据，覆盖肿块、钙化等典型征象，面向乳腺 AI 辅助筛查模型训练。

TCT 宫颈细胞学数据集

液基薄层细胞学（TCT）数字图像，含阴阳性判读结果，适配宫颈癌细胞学筛查模型。

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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图像分类目标检测语义分割

共 1922 个数据集

医学影像挑战赛数据集评测基准

USenhance 2023 超声图像增强挑战赛数据集

影像数据原始数据109 名患者（官方 Zenodo 描述口径）；成对图像 1,500 对共 3,000 张；官方测试集 210 张（第三方复现记录口径）

MICCAI 2023 附属挑战赛公开的成对手持低质-临床级高质超声图像集：甲状腺、颈动脉、肝脏、乳腺、肾脏多器官，LNCC/SSIM/PSNR 平均秩评测，grand-challenge.org 双阶段提交

手持超声设备采集的低质量 B 模式图像与临床级超声系统的配对高质量参考图像，覆盖甲状腺、颈动脉、肝脏、乳腺、肾脏多器官，256×256 灰度图 49

医学影像CT挑战赛数据集评测基准

低剂量CT感知图像质量评估挑战赛数据集

人工标注影像数据原始数据1,000 张 512×512 CT 切片（训练集口径）；患者级数量与身份信息未随数据发布

低剂量腹部 CT 切片图像（512×512）+ 多名放射科医生感知质量评分（0-4 分制均值）+ 挑战赛官方评测指标定义（|PLCC|/|SROCC|/|KROCC|） 30

医学影像挑战赛数据集评测基准

AI4Life 显微图像去噪挑战赛 2024

原始数据影像数据非临床数据：荧光显微图像与电压成像数据，不含人体受试者个体信息

AI4Life 联盟主办的首届生物影像公开挑战赛：无监督显微图像去噪任务，四个数据集横跨结构化与非结构化噪声，grand-challenge.org 平台评审，SI-PSNR 与 SSIM 双指标排行

四个挑战用数据集：JUMP Cell Painting datasets（GitHub）、W2S 宽场到 SIM 映射数据（GitHub IVRL/w2s）、Hagen et al. 荧光显微训练数据（GigaScience Database 100888）、SUPPORT 电压成像数据（Nature Methods 2023 附属），测试集隐藏托管于 grand-challenge.org 26

医学影像MRI医学图像分割脑肿瘤挑战赛数据集肿瘤学

BrainPTM 2021 脑术前白质纤维束映射数据集

影像数据原始数据人工标注75 例脑肿瘤术前患者（训练 60 例、测试 15 例），单一中心采集

以色列 Sheba 医学中心单中心 75 例脑肿瘤术前 T1 与扩散加权 MRI，60 例训练集附皮质脊髓束与视辐射共四束半自动体素掩码，4 例缺 CST；Dice 与 Jaccard 评测，禁止再分发与商用

Sheba 医学中心 3T Signa 扫描仪采集的无增强 T1 加权像（原始 1 mm 各向同性）与 64 方向扩散加权像（原始 1×1×2.6 毫米），经 MrDiffusion 配准、BET 颅骨剥离后统一重采样至 1.25 毫米各向同性、128×144×128 体素，配套半自动标注的皮质脊髓束与视辐射左右共四束二值掩码 20

医学影像手术视频内窥镜影像图像分类评测基准

CholecTriplet2022 手术动作三元组检测挑战赛

人工标注影像数据视频数据50 段腹腔镜胆囊切除术视频（挑战赛划分：45 训练 + 5 私有测试；患者数未逐段披露）

MICCAI EndoVis 2022 内镜视觉挑战赛：以 CholecT50 为官方基准，在仅给帧级二元标签的弱监督下同时完成手术动作三元组识别、器械尖端定位与框-三元组关联检测

CholecT50 挑战赛版：1 fps 抽帧视频与帧级三元组/器械/动词/目标/阶段二元标签（.txt）+ 自验证片段与私有测试集的器械尖端边界框及 box-triplet 配对标注 22

医学影像神经科学挑战赛数据集评测基准

AI4Life 钙成像去噪挑战赛 2025

原始数据合成数据影像数据非临床数据：5 个合成钙成像样本（训练 4 + 验证 1），不含人体受试者

AI4Life 联盟主办的钙成像去噪公开挑战赛：合成双光子视频栈配精确 ground truth 与受控噪声注入，双赛道评估空间重建与时间动态保真，Zenodo 公开、CC BY

AI4Life-CIDC25 训练集（Zenodo 15799506，4 个 in-silico 样本 A1/B1/C2/D2，两种噪声强度）+ 验证集（Zenodo 15807610，1 个样本的 clean 版 F0 与三个噪声级 F1/F2/F3），单栈形状 [1500, 490, 490]，TIFF 格式 30

基因组学与多组学代谢组学队列研究真实世界数据

BIDMC 活检证实 MASLD 血清代谢组队列

原始数据组学数据去标识化数据110 名成人（活检证实 MASLD；患者级人口学字段未随表发布）

110 名活检证实脂肪性肝病成人的空腹血清靶向代谢组，单个 CSV 表承载千余项质谱特征，PhysioNet 托管，须资质与贡献者审阅

BIDMC 处理的空腹血清 UPLC-MS/MS 靶向代谢组，样本取自澳大利亚 Sydney West Local Health District 胃肠-肝病门诊肝活检队列，单文件 database.csv（UTF-8，110 行 × 1,619 列） 25

医学影像医学图像分割病理图像挑战赛数据集评测基准

NeurIPS 2022 细胞分割挑战赛数据集

影像数据人工标注原始数据基准数据无患者级临床数据；图像来自体外培养细胞、外周血涂片、骨髓涂片、组织切片与细菌/酵母培养等 50 余个生物学实验，仅保留细胞级实例标注

四十家实验室、五十余个生物学实验拼出的多模态显微图像细胞实例分割基准——1000 张有标注加 1725 张无标注训练图、422 张跨实验测试图，以「弱监督 + 准确率与耗时双指标」逼出可直接部署的通用分割器，冠军方案 Nature Methods 2024 发表

grand-challenge.org 赛事官方发布的四类显微模态图像（明场 300 张、荧光 300 张、相差 200 张、DIC 200 张有标注训练图，另 1725 张无标注训练图，101 张调优图，422 张私有测试图），Zenodo 记录 10719375 为 21.3 GB 归档 25

医学影像手术视频视觉问答挑战赛数据集评测基准

创伤 THOMPSON 挑战赛

影像数据人工标注视频数据录像 220 段（其中 177 段常规操作、43 段即需变通操作）；按片段计为 3,717 段；参与者为受训人员与临床医师，人数未公开

第一人称视角的急救操作视频理解赛事——五类战伤与灾害现场救命操作的 220 段无脚本录像，标注动作、手势、器械与问答，2023 年起随 MICCAI 举办，数据托管于 Harvard Dataverse

头戴式第一人称摄像头录制的五类救命操作视频 + 动词-名词动作时段标注 + 左右手边界框 + 12 类器械框 + 医学视觉问答问答对；托管于 Harvard Dataverse（doi:10.7910/DVN/V5BTRU） 19

医学影像病理图像医学图像分割图像分类挑战赛数据集结直肠癌

CoNIC 结肠细胞核识别与计数挑战赛

人工标注影像数据原始数据未按患者披露；图像区域来自 Lizard 的六个数据源（病理切片级联），训练发布剔除 TCGA 部分

4,981 张 256×256 结肠 H&E 切块、六类细胞核、分割+分类+计数双任务的 ISBI 2022 挑战赛

Lizard 数据集派生的 4,981 张 256×256 结肠 H&E 切块（.npy 图像与双通道标注数组）+ counts.csv 六类计数表 + Lizard 原始 .mat 标注 29

医学影像MRI乳腺影像医学图像分割乳腺癌评测基准

MAMA-MIAAI 扩展乳腺 MRI 数据集

影像数据人工标注模型输出1,506 例（DUKE 291 + ISPY1 171 + ISPY2 980 + NACT 64）；训练侧另含 55 例不公开私有队列，合计 1,561

MAMA-MIA 全 1,506 例的预处理下游版本：用 3D U-Net 自动勾全乳掩膜、以此为权重做 N4 偏置场校正，输出 7,868 幅校正序列与 94 例人工掩膜，PhysioNet 开放下载

PhysioNet 托管 MAMA-MIAAI v1.0.0（doi:10.13026/w6wc-jh81）；底层影像来自 TCIA 四个集合（DUKE-Breast-Cancer-MRI、I-SPY1/ACRIN 6657、I-SPY2/ACRIN 6698、NACT-Pilot），经 MAMA-MIA 统一整理后由维也纳团队完成分割与偏置场校正 23

生理信号可穿戴传感心电信号心血管疾病评测基准

Auricle 耳戴多模态心血管数据集

原始数据真实世界数据结构化数据70 人（健康队列 42 + 心衰带病生活队列 28），对应 107 条 WFDB 记录（79 + 28）

70 名受试者、107 场会话的双耳耳内心音·双部位 PPG·ECG·心震·数字听诊·连续指压同步记录，全部信号 1 kHz，ODC-BY 1.0 于 PhysioNet 开放

多伦多大学与 University Health Network 两中心受试者，在实验室受控应激协议（静息/屏气/Valsalva/轻度运动/冷加压）下以 BIOPAC MP160 系统与改装降噪耳机同步采集，采集端 10 kHz 降采样至 1 kHz 后按 WFDB 格式发布 45

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