即取即用的 AI-Ready 医疗数据集库

70 条整夜单导联 ECG 的睡眠呼吸暂停逐分钟筛查基准——为 PhysioNet 首届 Computers in Cardiology Challenge 2000 组装，人类专家基于呼吸信号逐分钟标注 A/N，赛后成为二十余年 ECG-based 筛查研究的公共起点，ODC-By 1.0 全开放

PhysioNet Apnea-ECG Database version 1.0.0（doi:10.13026/C23W2R）：70 条整夜单导联 ECG（100 Hz，16 bits/sample，WFDB 格式 .dat/.hea）+ .apn 逐分钟 A/N 人工专家标注 + .qrs 逐搏机器标注（sqrs125 生成，未审计）+ 8 条记录附加呼吸三通道（胸/腹感应容积描记与鼻气流，20 Hz）与 SpO2（1 Hz） 43

医学影像眼科影像糖尿病视网膜病变

MESSIDOR — 糖尿病视网膜病变眼底影像数据库

1,200 张彩色眼底影像TIFF 格式约 2.5 GBDR 四级分级 + 黄斑水肿风险约 1,200 例

ADCIS / MINES ParisTech / LaTIM INSERM UMR 1101（https://www.adcis.net/en/third-party/messidor/） 102

医疗NLP电子健康记录

Nosocomial Risk Datasets — MIMIC-III 院内获得性疾病风险数据集

HAAKI 34,878 住院HAPI 35,218 住院HAA 38,385 住院24-96h 预测窗UMLS CUI 快照序列来自 MIMIC-III 46,520 患者的三疾病住院队列（HAAKI 34,878 / HAPI 35,218 / HAA 38,385）

Nosocomial Risk Datasets：34,878+35,218+38,385 住院 × 临床文本的间接监督标签工厂——用规则造标签、用文本学风险的院感预测基准

https://physionet.org/content/nosocomialriskdata/ 62

医学影像眼科影像医学图像分割皮肤影像青光眼骨骼肌肉影像

RIM-ONE — 青光眼视神经评估眼底图像

485 幅统一版眼底图像159 幅立体眼底像（v3）视盘视杯分割掩码免费研究用途获取485 幅眼底图像（统一版 RIM-ONE DL，患者总数未公开）

485 幅统一版青光眼眼底图像与视盘视杯分割金标准

拉拉古纳大学（University of La Laguna）与圣克鲁斯-德特内里费大学医院（HUC） url: https://github.com/miag-ull/rim-one-dl 80

药物发现与化学电子健康记录化学信息学医疗登记影像-文本对齐

TrialBench — 多模态临床试验预测数据集

约 480000+ 临床试验记录23 个 AI-Ready 子数据集8 大预测任务48 万+ 试验记录

香港科技大学(广州) / 南京大学 / Harvard / Stanford / IQVIA 联合开发 — https://huyjj.github.io/Trialbench/ 81

医学影像CT多模态影像-文本对齐挑战赛数据集评测基准

VLM3D 2025

人工标注影像数据原始数据训练/验证 21,304 位独立患者（25,692 个 study / 50,188 个 volume / 超 1,430 万张 slice）；评测集 2,000 例内部 + 1,024 例波士顿大学

MICCAI 2025 官方注册的 3D 医学影像视觉语言建模挑战赛——基于 CT-RATE 25,692 例胸部 CT 与配对放射学报告，设 CT 报告生成、多异常分类、自监督多异常定位、文本条件 3D CT 生成四大任务，Docker 容器服务端评测封闭测试集，冠军方法发表于 ICCV 2025 Workshop，2026 届扩展 MR-RATE 脑 MRI 赛道

CT-RATE 非增强胸部 CT（土耳其伊斯坦布尔梅迪波尔医院单中心，3 家厂商扫描仪，年龄 18-102 岁，性别均衡）+ 放射科医生撰写的 impression/findings 配对报告 + 微调 RadBERT 从报告自动抽取的 18 种胸部异常多标签 74

医学影像MRI医学图像分割脑影像挑战赛数据集儿科

BONBID-HIE 2024

ADC 图Z-ADC 图病灶分割掩膜NICU 结局Bayley-III 结局脑图谱237

第二届波士顿新生儿脑损伤数据集挑战赛：新生儿缺氧缺血性脑病病灶分割与神经发育结局预测

Zenodo（BONBID-HIE 2024 官方发布） url: https://zenodo.org/records/10978874 49

医学影像MRI医学图像分割心血管疾病挑战赛数据集

CMRxMotion 呼吸运动极端心脏MRI挑战数据集

人工标注影像数据原始数据40 例健康志愿者（24 男/16 女，19-48 岁）共 320 个 cine 影像 volume：训练 20 人 160 / 验证 5 人 40 / 测试 15 人 120（志愿者不跨集）

MICCAI 2022 STACOM 官方挑战：40 名志愿者 320 例 cine、同机 3T 单变量压力测试、4 种呼吸协议三级伪影、双任务质量评估+鲁棒分割，nnU-Net 主导，并列冠军 UA-SVCC 与 Med-Air，22 套算法全开源

复旦大学张江国际脑影像中心 Siemens MAGNETOM Vida 3T 前瞻采集（TrueFISP bSSFP cine 短轴，ED/ES 两时相，2.0×2.0 mm² 面内分辨率/8 mm 层厚/4 mm 层间隔）；40 名志愿者 × 4 种呼吸协议；LV/RV/MYO 三结构 NIfTI 标注 + 三级图像质量标签 49

医疗NLP医学影像多模态病理图像影像-文本对齐挑战赛数据集

REG²

人工标注原始数据影像数据文本数据~12,000 训练例（官网 'about 12K' 口径，官网与 AWS 均注明挑战期内确切数可变）+Test1 350+Test2 70——6 机构 5 国

第二届病理报告生成挑战赛——H&E 全切片→结构化报告+显式诊断推理链、~12K 例 7 器官 6 机构、Qwen3-8B 裁判评分、CC BY-NC-SA、S3 公开下载

多机构 H&E 染色 WSI（TIFF，20x，匿名化）+CAP 协议结构化病理报告+思维链 CoT 问答标注+Metric B ROI 标注（tissue/background 与 original/perturbed 配对） 73

医学影像乳腺影像医学图像分割图像分类乳腺癌肿瘤学

UDIAT — 乳腺 B 型超声病灶检测与良恶性分类数据集

超声B-mode2D静态图像分割掩码二分类标签PNG163

UDIAT Breast Ultrasound Dataset B：西班牙 Parc Taulí 的 163 张专家描边乳腺超声图像

UDIAT Breast Ultrasound Dataset B（Yap et al., IEEE JBHI 2017；MMU 官方请求制入口） url: http://www2.docm.mmu.ac.uk/STAFF/m.yap/dataset.php 80

电子健康记录医疗NLP

PIC — 浙大儿院儿童重症监护数据库

12,881 患儿13,941 ICU 住留LABEVENTS 1,009 万行英汉双语字典表术中 5 分钟生命体征12,881 患者 / 13,449 住院 / 13,941 ICU 住留（2010-2018）

Paediatric Intensive Care database：12,881 患儿 × 13,941 ICU 住留 × 双语 16 表——MIMIC 方法从波士顿到杭州的出口

https://physionet.org/content/picdb/1.1.0/ 99

医学影像目标检测挑战赛数据集评测基准

3DTeethLand

人工标注专家验证影像数据原始数据340 例口内 3D 扫描（240 训练 + 100 私有测试）；上游底座 Teeth3DS 为 1800 例扫描 / 900 名患者（上下颌分开采集，患者以 uuid 匿名）

3DTeethLand: 3D Teeth Landmarks Detection Challenge——MICCAI 2024 旗下首个公开的口内 3D 扫描牙齿标志点检测挑战赛数据集：340 例（240 训练+100 私有测试）、6 类解剖标志点、49 队注册 6 队决赛，Radboud 两阶段方案 mAP 0.78 夺冠；数据本体经 Synapse 注册制发放，Zenodo 仅存任务说明书（CC BY-4.0）

上游 Teeth3DS 数据集（1800 例口内 3D 扫描，OBJ 网格 + 逐顶点牙齿分割标签）派生的 340 例标注子集；挑战赛发放 STL 网格；标注含逐牙 6 类标志点坐标（单 JSON 文件）与牙齿分割标签；训练 240 例全标注，测试 100 例标签保密 43

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