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乳腺阳性影像数据集

乳腺钼靶阳性病例影像数据，覆盖肿块、钙化等典型征象，面向乳腺 AI 辅助筛查模型训练。

TCT 宫颈细胞学数据集

液基薄层细胞学（TCT）数字图像，含阴阳性判读结果，适配宫颈癌细胞学筛查模型。

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医学影像 AI-Ready 数据集

CT MRI 病理 X光

电子病历与文本数据集

电子病历病历文本

病灶分割与标注数据集

病灶分割数据标注

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共 1692 个数据集

基因组学与多组学代谢组学知识图谱

BioCyc 通路基因组库集合 — 两万库的三级策展分层

知识库代谢通路元数据物种基因组不适用（以数据库计数：物种库两万零九十五个，其中人工深度策展五个、中度策展七十余个、自动生成一万九千九百八十五个）

两万零九十五个物种库 / 五个深度策展 / 一万九千九百八十五个自动生成 / 两个免费

https://biocyc.org/ 11

基因组学与多组学转录组测序数据

基因组表达档案 GEA — 表达矩阵在 GEA，原始读段在 DRA

基因表达矩阵元数据转录组表观基因组单细胞不适用（记录级计数；本库不收需受控访问的人类个体数据）

DDBJ 中心的功能基因组档案 / 收微阵列、测序、单细胞与空间表达 / 与 GEO、ArrayExpress 同类不同库

https://www.ddbj.nig.ac.jp/gea/index-e.html 13

医学影像MRI乳腺影像肿瘤学乳腺癌

对侧乳腺 MRI 影像集（ACRIN 6667）

原始数据影像数据临床随访人工采集984 例（TCIA 收录口径）；试验实际入组千余人，其中 969 人进入主分析

ACRIN 6667 的 TCIA 影像侧：984 例单侧乳腺癌患者确诊后对侧乳腺的增强 MRI，1,103 个检查、万余个序列、199.59 GB，附按病例报告表拆分的临床表，CC BY 4.0 公开直链

https://www.cancerimagingarchive.net/collection/acrin-contralateral-breast-mr/ 12

医学影像MRI乳腺影像肿瘤学乳腺癌

QIN 乳腺动态增强 MRI — 十例两访视

动态对比增强药代动力学DICOM多中心比较文献引用十例（TCIA 集合页统计栏；对应二十次检查）

十例 · 二十次检查 · 六百五十二个序列 · 只公开前两个访视

https://www.cancerimagingarchive.net/collection/qin-breast-dce-mri/ 10

医学影像MRI肿瘤学

QIN 前列腺多参数 MRI — 二十二例

多参数 MRI动态对比增强弥散加权DICOM已退役二十二例（TCIA 集合页统计栏）

二十二例 · 单中心 · 四类序列 · 已退役

https://www.cancerimagingarchive.net/collection/qin-prostate/ 12

基因组学与多组学蛋白质组学肿瘤学肺癌

CPTAC-LSCC — 肺鳞癌的三个质谱分册与百余例

多组学组学矩阵质谱原始数据元数据论文口径 108 例肿瘤 + 99 例配对癌旁；PDC 门户口径 115 例；GDC 侧 109 例

108 例肿瘤 · 三册质谱 · PDC 与 GDC 双落位

https://pdc.cancer.gov/pdc/study/PDC000234 14

基因组学与多组学测序数据转录组肿瘤学肺癌

人肺腺癌 TCGA-LUAD — 五百八十五例与十个数据类别

多组学元数据病理全切片文献引用五百八十五例（GDC 项目口径，原发肿瘤样本同为 585 份）

585 例 · 十个数据类别 · 开放层 656 GB

https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-LUAD 19

基因组学与多组学肿瘤学脑肿瘤多模态

低级别胶质瘤 TCGA-LGG — 五百一十六例与三个分子组

多组学病理全切片原始影像元数据文献引用五百一十六例（GDC 项目口径；2015 年 NEJM 主论文的多平台整合口径为 293 例；TCIA 配对影像一百九十九例）

五百一十六例 · 十个数据类别 · 一百九十九例术前影像 · 三个分子组

https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-LGG 17

基因组学与多组学肿瘤学病理图像多模态转录组

头颈鳞癌 TCGA-HNSC — 四亚部位合一的五百二十八例

多组学病理全切片原始影像元数据文献引用五百二十八例（GDC 项目口径）；主论文多平台分析口径 279 例；TCIA 配对影像 227 例

五百二十八例 · 十二个解剖取值 · 十类数据 · 二百二十七例配对影像

https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-HNSC 15

基因组学与多组学肿瘤学脑肿瘤病理图像多模态

胶质母细胞瘤 TCGA-GBM — 六百一十七例与二百六十二例影像

多组学病理全切片原始影像元数据文献引用六百一十七例（GDC 项目口径；2008 年 Nature 主论文的多平台整合口径为 206 例）

六百一十七例 · 十个数据类别 · 二百六十二例术前影像 · 十三例复发

https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-GBM 15

医学影像PETCT肿瘤学肺癌

非小细胞肺癌放化疗 FDG-PET 双时点影像集（ACRIN 6668）

原始数据影像数据临床随访人工采集242 例（TCIA 收录口径）；试验口径为 250 人入组，226 人有可评估治疗前 PET，其中 173 人另有可评估治疗后 PET，构成主终点分析队列

ACRIN 6668 / RTOG 0235 的 TCIA 影像子集：242 例局部晚期非小细胞肺癌患者放化疗前与治疗后的全身 FDG-PET，七个模态混合存放，配 75%/25% 两份临床表，CC BY 3.0 公开直链

https://www.cancerimagingarchive.net/collection/acrin-nsclc-fdg-pet/ 13

基因组学与多组学肿瘤学病理图像转录组多模态

软组织肉瘤 TCGA-SARC — 二百六十一例与六类亚群

多组学病理全切片元数据文献引用二百六十一例（GDC 项目口径；主论文多平台分析口径为 206 例）

二百六十一例 · 十个数据类别 · 六类亚群 · 无配对影像

https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-SARC 15

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